Index: /issm/trunk/src/mex/Makefile.am
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--- /issm/trunk/src/mex/Makefile.am	(revision 5709)
+++ /issm/trunk/src/mex/Makefile.am	(revision 5710)
@@ -45,5 +45,4 @@
 				OutputResults\
 				PenaltyConstraints\
-				PenaltySystemMatrices\
 				PropagateFlagsFromConnectivity\
 				ProcessParams\
@@ -228,7 +227,4 @@
 			  Qmu/Qmu.h
 
-PenaltySystemMatrices_SOURCES = PenaltySystemMatrices/PenaltySystemMatrices.cpp\
-			  PenaltySystemMatrices/PenaltySystemMatrices.h
-
 Reducematrixfromgtof_SOURCES = Reducematrixfromgtof/Reducematrixfromgtof.cpp\
 			  Reducematrixfromgtof/Reducematrixfromgtof.h