Changeset 22770


Ignore:
Timestamp:
05/15/18 08:23:55 (7 years ago)
Author:
Mathieu Morlighem
Message:

CHG: reverting changes

Location:
issm/trunk-jpl/src/m
Files:
6 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed
  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/clusters/generic.m

    r22769 r22770  
    111111                                else
    112112                                        %Add --gen-suppressions=all to get suppression lines
    113                                         %fprintf(fid,'LD_PRELOAD=%s \\\n',cluster.valgrindlib);
     113                                        fprintf(fid,'LD_PRELOAD=%s \\\n',cluster.valgrindlib);
    114114                                        if ismac,
    115115                                                if IssmConfig('_HAVE_MPI_'),
    116                                                         fprintf(fid,'mpiexec -np %i %s --leak-check=full --gen-suppressions=all --error-limit=no --dsymutil=yes --suppressions=%s %s/%s %s %s %s 2> %s.errlog >%s.outlog ',...
     116                                                        fprintf(fid,'mpiexec -np %i %s --leak-check=full --error-limit=no --dsymutil=yes --suppressions=%s %s/%s %s %s %s 2> %s.errlog >%s.outlog ',...
    117117                                                        cluster.np,cluster.valgrind,cluster.valgrindsup,cluster.codepath,executable,solution,[cluster.executionpath '/' dirname], modelname,modelname,modelname);
    118118                                                else
     
    122122                                        else
    123123                                                if IssmConfig('_HAVE_MPI_'),
    124                                                         fprintf(fid,'mpiexec -np %i %s --leak-check=full --gen-suppressions=all --error-limit=no --suppressions=%s %s/%s %s %s %s 2> %s.errlog >%s.outlog ',...
     124                                                        fprintf(fid,'mpiexec -np %i %s --leak-check=full --error-limit=no --suppressions=%s %s/%s %s %s %s 2> %s.errlog >%s.outlog ',...
    125125                                                        cluster.np,cluster.valgrind,cluster.valgrindsup,cluster.codepath,executable,solution,[cluster.executionpath '/' dirname],modelname,modelname,modelname);
    126126                                                else
  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/clusters/pfe.m

    r22769 r22770  
    1111                 name           = 'pfe'
    1212                 login          = '';
    13                  modules        = {'comp-intel/2018.0.128' 'mpi-sgi/mpt'};
     13                 modules        = {'comp-intel/2016.2.181' 'mpi-sgi/mpt'};
    1414                 numnodes       = 20;
    1515                 cpuspernode    = 8;
     
    163163                         fprintf(fid,'#PBS -e %s.errlog \n\n',[cluster.executionpath '/' dirname '/' modelname]);
    164164                         fprintf(fid,'. /usr/share/modules/init/bash\n\n');
    165                          for i=1:numel(cluster.modules),
    166                                  fprintf(fid,['module load ' cluster.modules{i} '\n']);
    167                          end
     165                         fprintf(fid,'module load comp-intel/2016.2.181\n');
     166                         fprintf(fid,'module load mpi-sgi/mpt\n');
    168167                         fprintf(fid,'export PATH="$PATH:."\n\n');
    169168                         fprintf(fid,'export MPI_GROUP_MAX=64\n\n');
    170                          fprintf(fid,'export MKL_NUM_THREADS=2\n\n');
    171169                         fprintf(fid,'export ISSM_DIR="%s/../"\n',cluster.codepath); %FIXME
    172170                         fprintf(fid,'source $ISSM_DIR/etc/environment.sh\n');       %FIXME
     
    228226                         fprintf(fid,'#PBS -e %s.errlog \n\n',[cluster.executionpath '/' dirname '/' modelname]);
    229227                         fprintf(fid,'. /usr/share/modules/init/bash\n\n');
    230                          for i=1:numel(cluster.modules),
    231                                  fprintf(fid,['module load ' cluster.modules{i} '\n']);
    232                          end
     228                         fprintf(fid,'module load comp-intel/2016.2.181\n');
     229                         fprintf(fid,'module load mpi-sgi/mpt\n');
    233230                         fprintf(fid,'export PATH="$PATH:."\n\n');
    234231                         fprintf(fid,'export MPI_GROUP_MAX=64\n\n');
     
    356353                         fprintf(fid,'#PBS -e %s.errlog \n\n',modelname);
    357354                         fprintf(fid,'. /usr/share/modules/init/bash\n\n');
    358                          %for i=1:numel(cluster.modules),
    359                          %       fprintf(fid,['module load ' cluster.modules{i} '\n']);
    360                          %end
    361355                         fprintf(fid,'module load comp-intel/2016.2.181\n');
    362356                         fprintf(fid,'module load netcdf/4.4.1.1_mpt\n');
  • issm/trunk-jpl/src/m/inversions/marshallcostfunctions.m

    r22769 r22770  
    1515        pos=find(cost_functions==510); data(pos) = {'ThicknessPositive'};
    1616        pos=find(cost_functions==601); data(pos) = {'SurfaceAbsMisfit'};
    17         pos=find(cost_functions==602); data(pos) = {'OmegaAbsGradient'};
    18         pos=find(cost_functions==603); data(pos) = {'EtaDiff'};
  • issm/trunk-jpl/src/m/inversions/supportedcontrols.m

    r22769 r22770  
    22
    33        list = {...
    4                 'BalancethicknessSpcthickness',...
    54                'BalancethicknessThickeningRate',...
    65                'FrictionCoefficient',...
  • issm/trunk-jpl/src/m/plot/subplotmodel.m

    r22769 r22770  
    3030                if(((i-1)*ncols+j)==num)
    3131                        ha = axes('Units','normalized', ...
    32                                 'Position',[xmin ymin width height]);%,'XTickLabel','','YTickLabel','','Visible','off');
     32                                'Position',[xmin ymin width height],'XTickLabel','','YTickLabel','','Visible','off');
    3333                        return
    3434                end
  • issm/trunk-jpl/src/m/solvers/mumpsoptions.m

    r22769 r22770  
    2727        mumps.pc_factor_mat_solver_package=getfieldvalue(options,'pc_factor_mat_solver_package','mumps');
    2828        mumps.mat_mumps_icntl_14=getfieldvalue(options,'mat_mumps_icntl_14',120);
    29 
    30         %Seems like this one is not needed anymore
    3129        mumps.pc_factor_shift_positive_definite=getfieldvalue(options,'pc_factor_shift_positive_definite','true');
    3230
    3331        %These 2 lines make raijin break (ptwgts error during solver with PETSc 3.3)
    34         %mumps.mat_mumps_icntl_28=2; %1=serial, 2=parallel
    35         %mumps.mat_mumps_icntl_29=2; %parallel ordering 1 = ptscotch, 2 = parmetis
     32        mumps.mat_mumps_icntl_28=2; %1=serial, 2=parallel
     33        mumps.mat_mumps_icntl_29=2; %parallel ordering 1 = ptscotch, 2 = parmetis
    3634end
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.