Changeset 19958


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Timestamp:
01/15/16 15:41:20 (9 years ago)
Author:
Eric.Larour
Message:

CHG: some cleanup. Taking out the createxml routines, the effort did not pan out.

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issm/trunk-jpl/src/m/classes
Files:
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  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/SMBforcing.m

    r19897 r19958  
    1010        end
    1111        methods
    12         function createxml(self,fid) % {{{
    13             fprintf(fid, '\n\n');
    14             fprintf(fid, '%s\n', '<!-- smb(SMBforcing) -->');
    15                          fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="mass_balance" type="',class(self.mass_balance),'" default="',self.mass_balance,'">','     <section name="smb(SMBforcing)" />','     <help> surface mass balance [m/yr ice eq] </help>','</parameter>');
    16            
    17         end % }}}
    1812                function self = SMBforcing(varargin) % {{{
    1913                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/autodiff.m

    r19879 r19958  
    2020                %}}}
    2121        methods
    22         function createxml(self,fid) % {{{
    23             fprintf(fid, '<!-- autodiff -->\n');           
    24                    
    25             % automatic differentiation parameters
    26             fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="automatic differentiation parameters">','<section name="autodiff" />');                   
    27                 fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="isautodiff" type="',class(self.isautodiff),'" optional="false">','     <section name="autodiff" />','         <option value="',convert2str(self.isautodiff),'" type="string" default="true"></option>','     <help> indicates if the automatic differentiation is activated </help>','  </parameter>');
    28              
    29                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="dependents" type="',class(self.dependents),'" default="',convert2str(self.dependents),'">','     <section name="autodiff" />','     <help> list of dependent variables </help>','  </parameter>');
    30                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="independents" type="',class(self.independents),'" default="',convert2str(self.independents),'">','     <section name="autodiff" />','     <help> list of independent variables </help>','  </parameter>');
    31                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="driver" type="',class(self.driver),'" default="',convert2str(self.driver),'">','     <section name="autodiff" />','     <help> ADOLC driver (''fos_forward'' or ''fov_forward'') </help>','  </parameter>');
    32                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="obufsize" type="',class(self.obufsize),'" default="',convert2str(self.obufsize),'">','     <section name="autodiff" />','     <help> Number of operations per buffer (==OBUFSIZE in usrparms.h)  </help>','  </parameter>');
    33                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="lbufsize" type="',class(self.lbufsize),'" default="',convert2str(self.lbufsize),'">','     <section name="autodiff" />','     <help> Number of locations per buffer (==LBUFSIZE in usrparms.h) </help>','  </parameter>');
    34                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="cbufsize" type="',class(self.cbufsize),'" default="',convert2str(self.cbufsize),'">','     <section name="autodiff" />','     <help> Number of values per buffer (==CBUFSIZE in usrparms.h) </help>','  </parameter>');
    35                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="tbufsize" type="',class(self.tbufsize),'" default="',convert2str(self.tbufsize),'">','     <section name="autodiff" />','     <help> Number of taylors per buffer (&amp;lt;=TBUFSIZE in usrparms.h) </help>','  </parameter>');
    36                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="gcTriggerRatio" type="',class(self.gcTriggerRatio),'" default="',convert2str(self.gcTriggerRatio),'">','     <section name="autodiff" />','     <help> free location block sorting/consolidation triggered if the ratio between allocated and used locations exceeds gcTriggerRatio </help>','  </parameter>');
    37                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="gcTriggerRatio" type="',class(self.gcTriggerRatio),'" default="',convert2str(self.gcTriggerRatio),'">','     <section name="autodiff" />','     <help> free location block sorting/consolidation triggered if the allocated locations exceed gcTriggerMaxSize </help>','  </parameter>');
    38            
    39             fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');   
    40        
    41         end % }}}
    4222                function self = autodiff(varargin) % {{{
    4323                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/basalforcings.m

    r19897 r19958  
    1111        end
    1212        methods
    13                 function createxml(self,fid) % {{{
    14                         fprintf(fid, '\n\n');
    15                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- basalforcings -->');
    16                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="melting_rate" type="',            class(self.melting_rate),'" default="',              num2str(self.melting_rate),'">',              '     <section name="basalforcings" />','     <help> basal melting rate (positive if melting) [m/yr] </help>','</parameter>');
    17                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="geothermalflux" type="',          class(self.geothermalflux),'" default="',            num2str(self.geothermalflux),'">',            '     <section name="basalforcings" />','     <help> geothermal heat flux [W/m^2] </help>','</parameter>');
    18 
    19                 end % }}}
    2013                function self = extrude(self,md) % {{{
    2114                        self.groundedice_melting_rate=project3d(md,'vector',self.groundedice_melting_rate,'type','node','layer',1);

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/clusters/generic.m

    r19661 r19958  
    2424        end
    2525        methods
    26         function createxml(self,fid) % {{{
    27             fprintf(fid, '\n\n');
    28             fprintf(fid, '%s\n', '<!-- generic -->');
    29            
    30                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="name" type="',class(self.name),'" default="',convert2str(self.name),'">',  '     <section name="cluster" />','     <help> N/A </help>','</parameter>');
    31             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="login" type="',class(self.login),'" default="',convert2str(self.login),'">',     '     <section name="cluster" />','     <help> N/A </help>','</parameter>');
    32             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',     '<parameter key ="np" type="',class(self.np),'" default="',convert2str(self.np),'">',   '     <section name="cluster" />','     <help> N/A </help>','</parameter>');
    33             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="port" type="',class(self.port),'" default="',convert2str(self.port),'">',      '     <section name="cluster" />','     <help> N/A </help>','</parameter>');
    34             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="codepath" type="',class(self.codepath),'" default="',convert2str(self.codepath),'">',     '     <section name="cluster" />','     <help> N/A </help>','</parameter>');
    35              
    36             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="executionpath" type="',class(self.executionpath),'" default="',convert2str(self.executionpath),'">',   '     <section name="cluster" />','     <help> N/A </help>','</parameter>');
    37             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="etcpath" type="',class(self.etcpath),'" default="',convert2str(self.etcpath),'">',     '     <section name="cluster" />','     <help> N/A </help>','</parameter>');
    38             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="valgrind" type="',class(self.valgrind),'" default="',convert2str(self.valgrind),'">',  '     <section name="cluster" />','     <help> N/A </help>','</parameter>');
    39             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="valgrindlib" type="',class(self.valgrindlib),'" default="',convert2str(self.valgrindlib),'">',     '     <section name="cluster" />','     <help> N/A </help>','</parameter>');
    40             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="valgrindsup" type="',class(self.valgrindsup),'" default="',convert2str(self.valgrindsup),'">',     '     <section name="cluster" />','     <help> N/A </help>','</parameter>');
    41             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n',         '<parameter key ="verbose" type="',class(self.verbose),'" default="',convert2str(self.verbose),'">',    '     <section name="cluster" />','     <help> N/A </help>','</parameter>');
    42              
    43         end % }}}
    4426                function cluster=generic(varargin) % {{{
    4527

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/constants.m

    r19879 r19958  
    1212        end
    1313        methods
    14         function createxml(self,fid) % {{{
    15             fprintf(fid, '\n\n');
    16             fprintf(fid, '%s\n', '<!-- constants -->');
    17                          fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="g" type="',class(self.g),'" default="',num2str(self.g),'">','     <section name="constants" />','     <help> gravitational acceleration [m/s^2] </help>','</parameter>');
    18              fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="yts" type="',class(self.yts),'" default="',num2str(self.yts),'">','     <section name="constants" />','     <help> number of seconds in a year [s/yr] </help>','</parameter>');
    19              fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="referencetemperature" type="',class(self.referencetemperature),'" default="',num2str(self.referencetemperature),'">','     <section name="constants" />','     <help> reference temperature used in the enthalpy model [K] </help>','</parameter>');
    20                 end % }}}
    2114                function self = constants(varargin) % {{{
    2215                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/damage.m

    r19903 r19958  
    3030        end
    3131        methods
    32                 function createxml(self,fid) % {{{
    33                         fprintf(fid, '\n\n');
    34                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- damage -->');
    35                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- Note: this class depends on different input of law -->');
    36 
    37                         %fprintf(fid,'%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="law" type="logical"',           '" default="',                num2str(self.law),'">',   '     <section name="damage" />','     <help> damage law (string) from {"undamaged","pralong"} </help>','</parameter>');
    38                         % drop-down
    39                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n\t%s\n','<parameter key ="law" type="','alternative','" optional="','false','">','<section name="damage" />');
    40 
    41                         % law = 'undamage'
    42                         fprintf(fid,'\t%s%s%s%s%s\n\t\t%s\n','<option value="undamage" type="','string','" default="','true','">','<help> law = undamage </help>');
    43                         % footer for option
    44                         fprintf(fid,'\t%s\n%s\n','</option>');
    45 
    46                         % law = 'pralong'
    47                         fprintf(fid,'\t%s%s%s%s%s\n\t\t%s\n','<option value="pralong" type="','string','" default="','false','">','<help> law = pralong </help>');
    48 
    49                         fprintf(fid,'\t\t%s%s%s%s%s\n\t\t\t%s\n\t\t%s\n',   '<parameter key ="stress_threshold" type="',class(self.stress_threshold),'" default="',num2str(self.stress_threshold),'">','<help> damage stress threshold [Pa] </help>','</parameter>');
    50                         fprintf(fid,'\t\t%s%s%s%s%s\n\t\t\t%s\n\t\t%s\n',       '<parameter key ="c1" type="', class(self.c1),'" default="',   num2str(self.c1),'">',   '<help> damage parameter 1 </help>','</parameter>');
    51                         fprintf(fid,'\t\t%s%s%s%s%s\n\t\t\t%s\n\t\t%s\n',       '<parameter key ="c2" type="',          class(self.c2),'" default="',            num2str(self.c2),'">','<help> damage parameter 2 </help>','</parameter>');
    52                         fprintf(fid,'\t\t%s%s%s%s%s\n\t\t\t%s\n\t\t%s\n',       '<parameter key ="c3" type="',          class(self.c3),'" default="',            num2str(self.c3),'">','<help> damage parameter 3 [W/m^2] </help>','</parameter>');
    53                         fprintf(fid,'\t\t%s%s%s%s%s\n\t\t\t%s\n\t\t%s\n',       '<parameter key ="c4" type="',            class(self.c4),'" default="',              num2str(self.c4),'">','<help> damage parameter 4 </help>','</parameter>');
    54                         fprintf(fid,'\t\t%s%s%s%s%s\n\t\t\t%s\n\t\t%s\n',       '<parameter key ="healing" type="', class(self.healing),'" default="',   num2str(self.healing),'">','<help> damage healing parameter 1 </help>','</parameter>');
    55                         fprintf(fid,'\t\t%s%s%s%s%s\n\t\t\t%s\n\t\t%s\n',       '<parameter key ="equiv_stress" type="',          class(self.equiv_stress),'" default="',convert2str(self.equiv_stress),'">','<help> 0: von Mises </help>','</parameter>');
    56                         fprintf(fid,'\t\t%s%s%s%s%s\n\t\t\t%s\n\t\t%s\n',       '<parameter key ="requested_outputs" type="',          class(self.requested_outputs),'" default="',convert2str(self.requested_outputs),'">','<help> additional outputs requested </help>','</parameter>');
    57 
    58 
    59                         % footer for option
    60                         fprintf(fid,'\t%s\n%s\n','</option>');
    61 
    62 
    63                         % footer for drop-down
    64                         fprintf(fid,'\t%s\n%s\n%s','<help> damage law (string) from {"undamaged","pralong"} </help>','</parameter>');
    65 
    66 
    67                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="D" type="',              class(self.D),'" default="',                  num2str(self.D),'">',              '     <section name="damage" />','     <help> damage tensor (scalar) </help>','</parameter>');
    68                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="law" type="',            class(self.law),'" default="',                num2str(self.law),'">',   '     <section name="damage" />','     <help> damage law (string) from {"undamaged","pralong"} </help>','</parameter>');
    69                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="spcdamage" type="',      class(self.spcdamage),'" default="',          num2str(self.spcdamage),'">',            '     <section name="damage" />','     <help> damage constraints (NaN means no constraint) </help>','</parameter>');
    70                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="max_damage" type="',     class(self.max_damage),'" default="',         num2str(self.max_damage),'">',            '     <section name="damage" />','     <help> maximum possible damage (0&amp;lt;=max_damage&amp;lt;1) </help>','</parameter>');
    71 
    72                         % stabilization (0,1, or 2) drop-down
    73                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="stabilization" type="alternative" optional="false">','     <section name="damage" />','     <help> 0: no, 1: artificial_diffusivity, 2: SUPG </help>');
    74                         fprintf(fid, '%s\n', '       <option value="0" type="string" default="true"></option>');
    75                         fprintf(fid, '%s\n', '       <option value="1" type="string" default="false"></option>');
    76                         fprintf(fid, '%s\n', '       <option value="2" type="string" default="false"></option>');
    77                         fprintf(fid, '%s\n','</parameter>');
    78 
    79                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="maxiter" type="',             class(self.maxiter),'" default="',   num2str(self.maxiter),'">',   '     <section name="damage" />','     <help> maximum number of non linear iterations </help>','</parameter>');
    80 
    81                 end % }}}
    8232                function self = damage(varargin) % {{{
    8333                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/debug.m

    r19879 r19958  
    1111        end
    1212        methods
    13         function createxml(self,fid) % {{{
    14             fprintf(fid, '\n\n');
    15             fprintf(fid, '%s\n', '<!-- Debug -->');
    16            
    17             %valgrind drop-down (0 or 1)
    18                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="valgrind" type="alternative" optional="false">','     <section name="debug" />','     <help> use Valgrind to debug (0 or 1) </help>');
    19             fprintf(fid,'%s\n','       <option value="0" type="string" default="true"> </option>');
    20             fprintf(fid,'%s\n%s\n','       <option value="1" type="string" default="false"> </option>','</parameter>');
    21          
    22             fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="gprof" type="',              class(self.gprof),'" optional="false">',              '     <section name="debug" />','        <option value="',convert2str(self.gprof),'" type="string" default="true"></option>','     <help> use gnu-profiler to find out where the time is spent </help>','</parameter>');
    23             fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n',    '<parameter key ="profiling" type="',              class(self.profiling),'" optional="false">',              '     <section name="debug" />','        <option value="',convert2str(self.profiling),'" type="string" default="true"></option>','     <help> enables profiling (memory, flops, time) </help>','</parameter>');
    24         end % }}}
    2513                function self = debug(varargin) % {{{
    2614                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/flaim.m

    r19879 r19958  
    2121        end
    2222        methods
    23                 function createxml(self,fid) % {{{
    24             fprintf(fid, '<!-- flaim -->\n');           
    25                    
    26             % Input
    27             fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="Input:">','<section name="flaim" />');                   
    28             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="targets" type="',class(self.targets),'" default="',convert2str(self.targets),'">','     <section name="flaim" />','     <help> name of kml output targets file </help>','  </parameter>');
    29             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="tracks" type="',class(self.tracks),'" default="',convert2str(self.tracks),'">','     <section name="flaim" />','     <help> name of kml input tracks file </help>','  </parameter>');
    30             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="flightreqs" type="',class(self.flightreqs),'" default="',convert2str(self.flightreqs),'">','     <section name="flaim" />','     <help> structure of kml flight requirements (not used yet) </help>','  </parameter>');
    31             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="criterion" type="',class(self.criterion),'" default="',convert2str(self.criterion),'">','     <section name="flaim" />','     <help> element or nodal criterion for flight path evaluation (metric) </help>','  </parameter>');
    32                 fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');   
    33            
    34             % Arguments
    35             fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="2" label="Arguments:">','<section name="flaim" />');                   
    36             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="gridsatequator" type="',class(self.gridsatequator),'" default="',convert2str(self.gridsatequator),'">','     <section name="flaim" />','     <help> number of grids at equator (determines resolution) </help>','  </parameter>');
    37             fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="usevalueordering" type="',class(self.usevalueordering),'" optional="false">','     <section name="flaim" />','         <option value="',convert2str(self.usevalueordering),'" type="string" default="true"></option>','     <help> flag to consider target values for flight path evaluation </help>','  </parameter>');
    38             fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="split_antimeridian" type="',class(self.split_antimeridian),'" optional="false">','     <section name="flaim" />','         <option value="',convert2str(self.split_antimeridian),'" type="string" default="true"></option>','     <help> flag to split polygons on the antimeridian </help>','  </parameter>');
    39             fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');   
    40            
    41             % Optimization
    42             fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="3" label="Optimization:">','<section name="flaim" />');                   
    43             fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="path_optimize" type="',class(self.path_optimize),'" optional="false">','     <section name="flaim" />','         <option value="',convert2str(self.path_optimize),'" type="string" default="true"></option>','     <help> optimize? (default false) </help>','  </parameter>');
    44             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="opt_ndir" type="',class(self.opt_ndir),'" default="',convert2str(self.opt_ndir),'">','     <section name="flaim" />','     <help> number of directions to test when moving a point.  If this value = 1, a random direction is tested. A value > 1 results in directions equally spaced from [0, 2*PI] being tested. For example, 4 would result in directions [0, PI/2, PI, 3PI/2] </help>','  </parameter>');
    45             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="opt_dist" type="',class(self.opt_dist),'" default="',convert2str(self.opt_dist),'">','     <section name="flaim" />','     <help> specifies the distance in km (default 25) to move a randomly selected path point on each iteration </help>','  </parameter>');
    46             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="opt_niter" type="',class(self.opt_niter),'" default="',convert2str(self.opt_niter),'">','     <section name="flaim" />','     <help> number of iterations (default 30,000) to run for flightplan optimization, i.e. the number of times to randomly select a point and move it. </help>','  </parameter>');
    47                 fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');     
    48            
    49             % Output
    50             fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="4" label="Output:">','<section name="flaim" />');                   
    51             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="solution" type="',class(self.solution),'" default="',convert2str(self.solution),'">','     <section name="flaim" />','     <help> name of kml solution file </help>','  </parameter>');
    52             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="quality" type="',class(self.quality),'" default="',convert2str(self.quality),'">','     <section name="flaim" />','     <help> quality of kml solution </help>','  </parameter>');
    53             fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');             
    54        
    55         end % }}}
    5623                function self = flaim(varargin) % {{{
    5724                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/flowequation.m

    r19879 r19958  
    6262        end
    6363        methods
    64                 function createxml(self,fid) % {{{
    65                         fprintf(fid, '\n\n');
    66                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- flowequation -->');
    67                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="Flow equation parameters">','<section name="flowequation" />');                   
    68 
    69                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="isSIA" type="',              class(self.isSIA),'" default="',                  convert2str(self.isSIA),'">',              '     <section name="flowequation" />','     <help> is the Shallow Ice Approximation (SIA) used ? </help>','</parameter>');
    70                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="isSSA" type="',            class(self.isSSA),'" default="',                convert2str(self.isSSA),'">',   '     <section name="flowequation" />','     <help> is the Shelfy-Stream Approximation (SSA) used ? </help>','</parameter>');
    71                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="isL1L2" type="',      class(self.isL1L2),'" default="',          convert2str(self.isL1L2),'">',            '     <section name="flowequation" />','     <help> is the L1L2 approximation used ? </help>','</parameter>');
    72                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="isHO" type="',     class(self.isHO),'" default="',         convert2str(self.isHO),'">',            '     <section name="flowequation" />','     <help> is the Higher-Order (HO) approximation used ? </help>','</parameter>');
    73 
    74                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="isFS" type="',       class(self.isFS),'" default="',              convert2str(self.isFS),'">',              '     <section name="flowequation" />','     <help> are the Full-FS (FS) equations used ? </help>','</parameter>');
    75 
    76                         % fe_SSA drop-down (P1, P1bubble, P1bubblecondensed, P2)
    77                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="fe_SSA" type="alternative" optional="false">','     <section name="flowequation" />','     <help> Finite Element for SSA  "P1", "P1bubble" "P1bubblecondensed" "P2" </help>');
    78                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="P1" type="string" default="true"> </option>');
    79                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="P1bubble" type="string" default="false"> </option>');
    80                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="P1bubblecondensed" type="string" default="false"> </option>');
    81                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','       <option value="P2" type="string" default="false"> </option>','</parameter>');
    82 
    83                         %fe_HO drop-down (P1, P1bubble, P1bubblecondensed, P1xP2, P2xP1, P2)
    84                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="fe_HO" type="alternative" optional="false">','     <section name="flowequation" />','     <help> Finite Element for HO   "P1" "P1bubble" "P1bubblecondensed" "P1xP2" "P2xP1" "P2" </help>');
    85                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="P1" type="string" default="true"> </option>');
    86                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="P1bubble" type="string" default="false"> </option>');
    87                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="P1bubblecondensed" type="string" default="false"> </option>');
    88                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="P1xP2" type="string" default="false"> </option>');
    89                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="P2xP1" type="string" default="false"> </option>');
    90                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','       <option value="P2" type="string" default="false"> </option>','</parameter>');
    91 
    92                         % fe_FS drop-down (P1P1, P1P1GLS, MINIcondensed, MINI, TaylowHood)
    93                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="fe_FS" type="alternative" optional="false">','     <section name="flowequation" />','     <help> Finite Element for FS   "P1P1" (debugging only) "P1P1GLS" "MINIcondensed" "MINI" "TaylorHood" </help>');
    94                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="P1P1" type="string" default="true"> </option>');
    95                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="P1P1GLS" type="string" default="false"> </option>');
    96                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="MINIcondensed" type="string" default="false"> </option>');
    97                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="MINI" type="string" default="false"> </option>');
    98                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','       <option value="TaylorHood" type="string" default="false"> </option>','</parameter>');
    99 
    100                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="vertex_equation" type="',      class(self.vertex_equation),'" default="',            convert2str(self.vertex_equation),'">',            '     <section name="flowequation" />','     <help> flow equation for each vertex </help>','</parameter>');
    101 
    102                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="element_equation" type="',            class(self.element_equation),'" default="',              convert2str(self.element_equation),'">',              '     <section name="flowequation" />','     <help> flow equation for each element </help>','</parameter>');
    103                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="borderSSA" type="', class(self.borderSSA),'" default="',   convert2str(self.borderSSA),'">',   '     <section name="flowequation" />','     <help> vertices on SSAs border (for tiling) </help>','</parameter>');
    104                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="borderHO" type="',          class(self.borderHO),'" default="',            convert2str(self.borderHO),'">',            '     <section name="flowequation" />','     <help> vertices on HOs border (for tiling) </help>','</parameter>');
    105                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="borderFS" type="',          class(self.borderFS),'" default="',            convert2str(self.borderFS),'">',            '     <section name="flowequation" />','     <help> vertices on FS border (for tiling) </help>','</parameter>');
    106 
    107                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    108                 end % }}}
    10964                function self = extrude(self,md) % {{{
    11065                        self.element_equation=project3d(md,'vector',self.element_equation,'type','element');

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/friction.m

    r19897 r19958  
    1111        end
    1212        methods
    13                 function createxml(self,fid) % {{{
    14                         fprintf(fid, '\n\n');
    15                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- Friction: Sigma= drag^2 * Neff ^r * u ^s, with Neff=rho_ice*g*thickness+rho_water*g*bed, r=q/p and s=1/p -->');
    16                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="Friction: Sigma= drag^2 * Neff ^r * u ^s, with Neff=rho_ice*g*thickness+rho_water*g*bed, r=q/p and s=1/p">','<section name="friction" />');   
    17                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="coefficient" type="',      class(self.coefficient),'" default="',          convert2str(self.coefficient),'">',              '     <section name="friction" />','     <help> friction coefficient [SI] </help>','</parameter>');
    18                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="p" type="',               class(self.p),'" default="',                 convert2str(self.p),'">',   '     <section name="friction" />','     <help> p exponent </help>','</parameter>');
    19                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="q" type="',               class(self.q),'" default="',                 convert2str(self.q),'">',            '     <section name="friction" />','     <help> q exponent </help>','</parameter>');
    20                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    21                 end % }}}
    2213                function self = extrude(self,md) % {{{
    2314                        self.coefficient=project3d(md,'vector',self.coefficient,'type','node','layer',1);

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/frictioncoulomb.m

    r19897 r19958  
    1212        end
    1313        methods
    14                 function createxml(self,fid) % {{{
    15                         fprintf(fid, '\n\n');
    16                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- Friction: Sigma= drag^2 * Neff ^r * u ^s, with Neff=rho_ice*g*thickness+rho_water*g*bed, r=q/p and s=1/p -->');
    17                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="Friction: Sigma= drag^2 * Neff ^r * u ^s, with Neff=rho_ice*g*thickness+rho_water*g*bed, r=q/p and s=1/p">','<section name="frictioncoulomb" />');   
    18                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="coefficient" type="',      class(self.coefficient),'" default="',          convert2str(self.coefficient),'">',              '     <section name="frictioncoulomb" />','     <help> friction coefficient [SI] </help>','</parameter>');
    19                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="p" type="',               class(self.p),'" default="',                 convert2str(self.p),'">',   '     <section name="frictioncoulomb" />','     <help> p exponent </help>','</parameter>');
    20                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="q" type="',               class(self.q),'" default="',                 convert2str(self.q),'">',            '     <section name="frictioncoulomb" />','     <help> q exponent </help>','</parameter>');
    21                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    22                 end % }}}
    2314                function self = extrude(self,md) % {{{
    2415                        self.coefficient=project3d(md,'vector',self.coefficient,'type','node','layer',1);

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/frictionweertman.m

    r19897 r19958  
    1010        end
    1111        methods
    12                 function createxml(self,fid) % {{{
    13                         fprintf(fid, '\n\n');
    14                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- Friction: Sigma= drag^2 * Neff ^r * u ^s, with Neff=rho_ice*g*thickness+rho_water*g*bed, r=q/p and s=1/p -->');
    15                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="Friction: Sigma= drag^2 * Neff ^r * u ^s, with Neff=rho_ice*g*thickness+rho_water*g*bed, r=q/p and s=1/p">','<section name="frictionweertman" />');   
    16                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="coefficient" type="',      class(self.coefficient),'" default="',          convert2str(self.coefficient),'">',              '     <section name="frictionweertman" />','     <help> frictionweertman coefficient [SI] </help>','</parameter>');
    17                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="p" type="',               class(self.p),'" default="',                 convert2str(self.p),'">',   '     <section name="frictionweertman" />','     <help> p exponent </help>','</parameter>');
    18                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="q" type="',               class(self.q),'" default="',                 convert2str(self.q),'">',            '     <section name="frictionweertman" />','     <help> q exponent </help>','</parameter>');
    19                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    20                 end % }}}
    2112                function self = frictionweertman(varargin) % {{{
    2213                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/geometry.m

    r19897 r19958  
    3333        end
    3434        methods
    35                 function createxml(self, fid)% {{{
    36                         fprintf(fid, '\n\n');
    37                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- geometry -->');
    38                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="Geometry parameters">','<section name="geometry" />');
    39                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="surface" type="','path','" optional="','false','">','     <section name="geometry" />','     <help> surface elevation [m] </help>','</parameter>');
    40                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="thickness" type="','path','" optional="','false','">','     <section name="geometry" />','     <help> ice thickness [m] </help>','</parameter>');
    41                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="bed" type="','path','" optional="','false','">','     <section name="geometry" />','     <help> bed elevation [m] </help>','</parameter>');
    42                         %fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="bathymetry" type="',class(self.bathymetry),'" default="',convert2str(self.bathymetry),'">','     <section name="geometry" />','     <help> bathymetry elevation [m] </help>','</parameter>');
    43                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="hydrostatic_ratio" type="',class(self.hydrostatic_ratio),'" default="',convert2str(self.hydrostatic_ratio),'">','     <section name="geometry" />','     <help> coefficient for ice shelves; thickness correction: hydrostatic_ratio H_obs+ (1-hydrostatic_ratio) H_hydro </help>','</parameter>');
    44                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    45                 end % }}}
    4635                function self = extrude(self,md) % {{{
    4736                        self.surface=project3d(md,'vector',self.surface,'type','node');

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/gia.m

    r19897 r19958  
    1111        end
    1212        methods
    13                 function createxml(self,fid) % {{{
    14                         fprintf(fid, '<!-- gia -->\n');           
    15 
    16                         % gia solution parameters
    17                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="gia parameters">','<section name="gia" />');                   
    18                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="mantle_viscosity" type="',class(self.mantle_viscosity),'" default="',convert2str(self.mantle_viscosity),'">','     <section name="gia" />','     <help> mantle viscosity[Pa s] </help>','  </parameter>');
    19                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="lithosphere_thickness" type="',class(self.lithosphere_thickness),'" default="',convert2str(self.lithosphere_thickness),'">','     <section name="gia" />','     <help> lithosphere thickness (km) </help>','  </parameter>');
    20                         %cross_section_shape drop-down (1 o r 2)
    21                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="cross_section_shape" type="alternative" optional="false">','     <section name="gia" />','     <help> 1: square-edged (default). 2: elliptical.  See iedge in GiaDeflectionCore </help>');
    22                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="1" type="string" default="true"> </option>');
    23                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','       <option value="2" type="string" default="false"> </option>','</parameter>');
    24 
    25                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');   
    26 
    27                 end % }}}
    2813                function self = extrude(self,md) % {{{
    2914                        self.mantle_viscosity=project3d(md,'vector',self.mantle_viscosity,'type','node');

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/groundingline.m

    r19879 r19958  
    99        end
    1010        methods
    11                 function createxml(self,fid) % {{{
    12                         fprintf(fid, '\n\n');
    13                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- groundingline -->');
    14 
    15                         % Convergence criteria         
    16                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="Grounding line migration parameters">','<section name="groundingline" />'); 
    17 
    18                         % migration (SoftMigration, AggressiveMigration, or None)drop-down
    19                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="migration" type="alternative" optional="false">','     <section name="groundingline" />','     <help> type of grounding line migration: "SoftMigration","AggressiveMigration" or "None" </help>');
    20                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="SoftMigration" type="string" default="true"> </option>');
    21                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="AggressiveMigration" type="string" default="false"> </option>');
    22                         fprintf(fid, '%s\n%s\n','       <option value="None" type="string" default="false"></option>','</parameter>');
    23 
    24                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    25                 end % }}}
    2611                function self = groundingline(varargin) % {{{
    2712                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/hydrologyshreve.m

    r19903 r19958  
    1010        end
    1111        methods
    12                 function createxml(self,fid) % {{{
    13                         fprintf(fid, '\n\n');
    14                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- Hydrology -->');
    15 
    16                         % Convergence criteria           
    17                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="Hydrologyshreve solution parameters">','<section name="hydrologyshreve" />');                   
    18 
    19                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="spcwatercolumn" type="',      class(self.spcwatercolumn),'" default="',        convert2str(self.spcwatercolumn),'">',      '     <section name="hydrologyshreve" />','     <help> water thickness constraints (NaN means no constraint) [m] </help>','</parameter>');
    20                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="stabilization" type="',         class(self.stabilization),'" default="',           convert2str(self.stabilization),'">',   '     <section name="hydrologyshreve" />','     <help> artificial diffusivity (default is 1). can be more than 1 to increase diffusivity. </help>','</parameter>');
    21                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    22                 end % }}}
    2312                function self = extrude(self,md) % {{{
    2413                end % }}}

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/initialization.m

    r19897 r19958  
    1919        end
    2020        methods
    21                 function createxml(self,fid) % {{{
    22                         fprintf(fid, '\n\n');
    23                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- initialization -->');
    24                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="Initial field values">','<section name="initialization" />');                   
    25 
    26                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="vx" type="',class(self.vx),'" default="',self.vx,'">','     <section name="initialization" />','     <help> x component of velocity [m/yr] </help>','</parameter>');
    27                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="vy" type="',class(self.vy),'" default="',self.vy,'">','     <section name="initialization" />','     <help> y component of velocity [m/yr] </help>','</parameter>');
    28                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="vz" type="',class(self.vz),'" default="',self.vz,'">','     <section name="initialization" />','     <help> z component of velocity [m/yr] </help>','</parameter>');
    29                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="vel" type="',class(self.vel),'" default="',self.vel,'">','     <section name="initialization" />','     <help> velocity norm [m/yr] </help>','</parameter>');
    30                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="pressure" type="',class(self.pressure),'" default="',self.pressure,'">','     <section name="initialization" />','     <help> pressure field [Pa] </help>','</parameter>');
    31                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="temperature" type="',class(self.temperature),'" default="',self.temperature,'">','     <section name="initialization" />','     <help> fraction of water in the ice </help>','</parameter>');
    32                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="waterfraction" type="',class(self.waterfraction),'" default="',self.waterfraction,'">','     <section name="initialization" />','     <help> ice thickness [m] </help>','</parameter>');
    33                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="sediment_head" type="',class(self.sediment_head),'" default="',self.sediment_head,'">','     <section name="initialization" />','     <help> sediment water head of subglacial system [m] </help>','</parameter>');
    34                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="epl_head" type="',class(self.epl_head),'" default="',self.epl_head,'">','     <section name="initialization" />','     <help> epl water head of subglacial system [m] </help>','</parameter>');
    35                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="watercolumn" type="',class(self.watercolumn),'" default="',self.watercolumn,'">','     <section name="initialization" />','     <help> thickness of subglacial water [m] </help>','</parameter>');
    36                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    37                 end % }}}
    3821                function self = extrude(self,md) % {{{
    3922                        self.vx=project3d(md,'vector',self.vx,'type','node');

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/inversion.m

    r19947 r19958  
    2626        end
    2727        methods
    28                 function createxml(self,fid) % {{{
    29                         fprintf(fid, '<!-- inversion -->\n');           
    30 
    31                         % inversion parameters
    32                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="inversion parameters">','<section name="inversion" />');                   
    33                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="iscontrol" type="',class(self.iscontrol),'" default="',convert2str(self.iscontrol),'">','     <section name="inversion" />','     <help> is inversion activated? </help>','  </parameter>');
    34 
    35                         % incompleteadjoing drop-down (0 or 1)
    36                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="incomplete_adjoint" type="alternative" optional="false">','     <section name="inversion" />','     <help> 1: linear viscosity, 0: non-linear viscosity </help>');
    37                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="0" type="string" default="true"> </option>');
    38                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','       <option value="1" type="string" default="false"> </option>','</parameter>');
    39 
    40                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="control_parameters" type="',class(self.control_parameters),'" default="',convert2str(self.control_parameters),'">','     <section name="inversion" />','     <help> ex: {''FrictionCoefficient''}, or {''MaterialsRheologyBbar''} </help>','  </parameter>');
    41 
    42                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="nsteps" type="',class(self.nsteps),'" default="',convert2str(self.nsteps),'">','     <section name="inversion" />','     <help> number of optimization searches </help>','  </parameter>');
    43                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="cost_functions" type="',class(self.cost_functions),'" default="',convert2str(self.cost_functions),'">','     <section name="inversion" />','     <help> indicate the type of response for each optimization step  </help>','  </parameter>');
    44                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="cost_functions_coefficients" type="',class(self.cost_functions_coefficients),'" default="',convert2str(self.cost_functions_coefficients),'">','     <section name="inversion" />','     <help> cost_functions_coefficients applied to the misfit of each vertex and for each control_parameter </help>','  </parameter>');
    45 
    46                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="cost_function_threshold" type="',class(self.cost_function_threshold),'" default="',convert2str(self.cost_function_threshold),'">','     <section name="inversion" />','     <help> misfit convergence criterion. Default is 1%, NaN if not applied </help>','  </parameter>');
    47                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="maxiter_per_step" type="',class(self.maxiter_per_step),'" default="',convert2str(self.maxiter_per_step),'">','     <section name="inversion" />','     <help> maximum iterations during each optimization step  </help>','  </parameter>');
    48                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="gradient_scaling" type="',class(self.gradient_scaling),'" default="',convert2str(self.gradient_scaling),'">','     <section name="inversion" />','     <help> scaling factor on gradient direction during optimization, for each optimization step </help>','  </parameter>');
    49 
    50                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="step_threshold" type="',class(self.step_threshold),'" default="',convert2str(self.step_threshold),'">','     <section name="inversion" />','     <help> decrease threshold for misfit, default is 30% </help>','  </parameter>');
    51                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="min_parameters" type="',class(self.min_parameters),'" default="',convert2str(self.min_parameters),'">','     <section name="inversion" />','     <help> absolute minimum acceptable value of the inversed parameter on each vertex </help>','  </parameter>');
    52                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="max_parameters" type="',class(self.max_parameters),'" default="',convert2str(self.max_parameters),'">','     <section name="inversion" />','     <help> absolute maximum acceptable value of the inversed parameter on each vertex </help>','  </parameter>');
    53 
    54                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vx_obs" type="',class(self.vx_obs),'" default="',convert2str(self.vx_obs),'">','     <section name="inversion" />','     <help> observed velocity x component [m/yr] </help>','  </parameter>');
    55                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vy_obs" type="',class(self.vy_obs),'" default="',convert2str(self.vy_obs),'">','     <section name="inversion" />','     <help> observed velocity y component [m/yr]  </help>','  </parameter>');
    56                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vel_obs" type="',class(self.vel_obs),'" default="',convert2str(self.vel_obs),'">','     <section name="inversion" />','     <help> observed velocity magnitude [m/yr] </help>','  </parameter>');
    57                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="thickness_obs" type="',class(self.thickness_obs),'" default="',convert2str(self.thickness_obs),'">','     <section name="inversion" />','     <help> observed thickness [m]) </help>','  </parameter>');
    58 
    59                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');   
    60 
    61                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="2" label="Available cost functions">','<section name="inversion" />');                   
    62                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="SurfaceAbsVelMisfit" type="','string','" default="','101','">','     <section name="inversion" />','     <help>  </help>','  </parameter>');
    63                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="SurfaceRelVelMisfit" type="','string','" default="','102','">','     <section name="inversion" />','     <help>   </help>','  </parameter>');
    64                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="SurfaceLogVelMisfit" type="','string','" default="','103','">','     <section name="inversion" />','     <help>  </help>','  </parameter>');
    65 
    66                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="SurfaceLogVxVyMisfit" type="','string','" default="','104','">','     <section name="inversion" />','     <help>  </help>','  </parameter>');
    67                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="SurfaceAverageVelMisfit" type="','string','" default="','105','">','     <section name="inversion" />','     <help>   </help>','  </parameter>');
    68                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="ThicknessAbsMisfit" type="','string','" default="','106','">','     <section name="inversion" />','     <help>  </help>','  </parameter>');
    69 
    70                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="DragCoefficientAbsGradient" type="','string','" default="','107','">','     <section name="inversion" />','     <help>  </help>','  </parameter>');
    71                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="RheologyBbarAbsGradient" type="','string','" default="','108','">','     <section name="inversion" />','     <help>  </help>','  </parameter>');
    72                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="ThicknessAbsGradient" type="','string','" default="','109','">','     <section name="inversion" />','     <help> </help>','  </parameter>');
    73 
    74                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');   
    75 
    76                 end % }}}       
    7728                function self = inversion(varargin) % {{{
    7829                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/linearbasalforcings.m

    r19897 r19958  
    1313        end
    1414        methods
    15      function createxml(self,fid) % {{{
    16             fprintf(fid, '\n\n');
    17             fprintf(fid, '%s\n', '<!-- basalforcings -->');
    18                          fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="melting_rate" type="',            class(self.melting_rate),'" default="',              num2str(self.melting_rate),'">',              '     <section name="basalforcings" />','     <help> basal melting rate (positive if melting) [m/yr] </help>','</parameter>');
    19              fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="geothermalflux" type="',          class(self.geothermalflux),'" default="',            num2str(self.geothermalflux),'">',            '     <section name="basalforcings" />','     <help> geothermal heat flux [W/m^2] </help>','</parameter>');
    20              
    21         end % }}}
    2215                function self = linearbasalforcings(varargin) % {{{
    2316                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/mask.m

    r19892 r19958  
    2222        end
    2323        methods
    24                 function createxml(self,fid) % {{{
    25                         fprintf(fid, '\n\n');
    26                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- mask -->');
    27                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="groundedice_levelset" type="',class(self.groundedice_levelset),'" default="',self.groundedice_levelset,'">','     <section name="mask" />','     <help> is ice grounded ? grounded ice if > 0, grounding line position if = 0, floating ice if &amp;lt; 0 </help>','</parameter>');
    28                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="ice_levelset" type="',class(self.ice_levelset),'" default="',self.ice_levelset,'">','     <section name="mask" />','     <help> presence of ice if > 0, icefront position if = 0, no ice if &amp;lt; 0 </help>','</parameter>');
    29                 end % }}}
    3024                function self = extrude(self,md) % {{{
    3125                        self.groundedice_levelset=project3d(md,'vector',self.groundedice_levelset,'type','node');

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/maskpsl.m

    r19316 r19958  
    2323        end
    2424        methods
    25                 function createxml(self,fid) % {{{
    26                         fprintf(fid, '\n\n');
    27                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- mask -->');
    28                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="groundedice_levelset" type="',class(self.groundedice_levelset),'" default="',self.groundedice_levelset,'">','     <section name="mask" />','     <help> is ice grounded ? grounded ice if > 0, grounding line position if = 0, floating ice if &amp;lt; 0 </help>','</parameter>');
    29                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="ice_levelset" type="',class(self.ice_levelset),'" default="',self.ice_levelset,'">','     <section name="mask" />','     <help> presence of ice if > 0, icefront position if = 0, no ice if &amp;lt; 0 </help>','</parameter>');
    30                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="ocean_levelset" type="',class(self.ocean_levelset),'" default="',self.ocean_levelset,'">','     <section name="mask" />','     <help> is ice grounded ? grounded ice if > 0, grounding line position if = 0, floating ice if &amp;lt; 0 </help>','</parameter>');
    31                 end % }}}
    3225                function self = extrude(self,md) % {{{
    3326                        self.groundedice_levelset=project3d(md,'vector',self.groundedice_levelset,'type','node');

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/matdamageice.m

    r19048 r19958  
    3030        end
    3131        methods
    32                 function createxml(self,fid) % {{{
    33                         fprintf(fid, '\n\n');
    34                         fprintf(fid, '<!-- materials -->\n');
    35                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="rho_ice" type="',class(self.rho_ice),'" default="',convert2str(self.rho_ice),'">','     <section name="materials" />','     <help> ice density [kg/m^3] </help>','</parameter>');
    36                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="rho_water" type="',class(self.rho_water),'" default="',convert2str(self.rho_water),'">','     <section name="materials" />','     <help> ocean water density [kg/m^3] </help>','</parameter>');
    37                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="rho_freshwater" type="',class(self.rho_freshwater),'" default="',convert2str(self.rho_freshwater),'">','     <section name="materials" />','     <help> fresh water density [kg/m^3] </help>','</parameter>');
    38 
    39 
    40                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="mu_water" type="',class(self.mu_water),'" default="',convert2str(self.mu_water),'">','     <section name="materials" />','     <help> water viscosity [N s/m^2] </help>','</parameter>');
    41                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="heatcapacity" type="',class(self.heatcapacity),'" default="',convert2str(self.heatcapacity),'">','     <section name="materials" />','     <help> heat capacity [J/kg/K] </help>','</parameter>');
    42                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="latentheat" type="',class(self.latentheat),'" default="',convert2str(self.latentheat),'">','     <section name="materials" />','     <help> latent heat of fusion [J/kg] </help>','</parameter>');
    43 
    44 
    45                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="thermalconductivity" type="',class(self.thermalconductivity),'" default="',convert2str(self.thermalconductivity),'">','     <section name="materials" />','     <help> ice thermal conductivity [W/m/K] </help>','</parameter>');
    46                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="temperateiceconductivity" type="',class(self.temperateiceconductivity),'" default="',convert2str(self.temperateiceconductivity),'">','     <section name="materials" />','     <help> temperate ice thermal conductivity [W/m/K] </help>','</parameter>');
    47                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="meltingpoint" type="',class(self.meltingpoint),'" default="',convert2str(self.meltingpoint),'">','     <section name="materials" />','     <help> melting point of ice at 1atm in K </help>','</parameter>');
    48 
    49 
    50                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="beta" type="',class(self.beta),'" default="',convert2str(self.beta),'">','     <section name="materials" />','     <help> rate of change of melting point with pressure [K/Pa] </help>','</parameter>');
    51                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="mixed_layer_capacity" type="',class(self.mixed_layer_capacity),'" default="',convert2str(self.mixed_layer_capacity),'">','     <section name="materials" />','     <help> mixed layer capacity [W/kg/K] </help>','</parameter>');
    52                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="thermal_exchange_velocity" type="',class(self.thermal_exchange_velocity),'" default="',convert2str(self.thermal_exchange_velocity),'">','     <section name="materials" />','     <help> thermal exchange velocity [m/s] </help>','</parameter>');
    53 
    54 
    55                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="rheology_B" type="',class(self.rheology_B),'" default="',convert2str(self.rheology_B),'">','     <section name="materials" />','     <help> flow law parameter [Pa/s^(1/n)] </help>','</parameter>');
    56                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="rheology_n" type="',class(self.rheology_n),'" default="',convert2str(self.rheology_n),'">','     <section name="materials" />','     <help> Glens flow law exponent </help>','</parameter>');
    57                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="rheology_law" type="',class(self.rheology_law),'" default="',convert2str(self.rheology_law),'">','     <section name="materials" />','     <help> law for the temperature dependance of the rheology: "None", "Paterson",  "Arrhenius" or "LliboutryDuval" </help>','</parameter>');
    58 
    59                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="lithosphere_shear_modulus" type="',class(self.lithosphere_shear_modulus),'" default="',convert2str(self.lithosphere_shear_modulus),'">','     <section name="materials" />','     <help> Lithosphere shear modulus [Pa] </help>','</parameter>');
    60                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="lithosphere_density" type="',class(self.lithosphere_density),'" default="',convert2str(self.lithosphere_density),'">','     <section name="materials" />','     <help> Lithosphere density [g/cm^-3] </help>','</parameter>');
    61                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="mantle_shear_modulus" type="',class(self.mantle_shear_modulus),'" default="',convert2str(self.mantle_shear_modulus),'">','     <section name="materials" />','     <help> Mantle shear modulus [Pa] </help>','</parameter>');
    62                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="mantle_density" type="',class(self.mantle_density),'" default="',convert2str(self.mantle_density),'">','     <section name="materials" />','     <help> Mantle density [g/cm^-3] </help>','</parameter>');
    63 
    64 
    65                 end % }}}
    6632                function self = extrude(self,md) % {{{
    6733                        self.rheology_B=project3d(md,'vector',self.rheology_B,'type','node');

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/matice.m

    r19897 r19958  
    3030        end
    3131        methods
    32                 function createxml(self,fid) % {{{
    33                         fprintf(fid, '\n\n');
    34                         fprintf(fid, '<!-- materials -->\n');
    35                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="rho_ice" type="',class(self.rho_ice),'" default="',convert2str(self.rho_ice),'">','     <section name="materials" />','     <help> ice density [kg/m^3] </help>','</parameter>');
    36                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="rho_water" type="',class(self.rho_water),'" default="',convert2str(self.rho_water),'">','     <section name="materials" />','     <help> ocean water density [kg/m^3] </help>','</parameter>');
    37                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="rho_freshwater" type="',class(self.rho_freshwater),'" default="',convert2str(self.rho_freshwater),'">','     <section name="materials" />','     <help> fresh water density [kg/m^3] </help>','</parameter>');
    38 
    39 
    40                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="mu_water" type="',class(self.mu_water),'" default="',convert2str(self.mu_water),'">','     <section name="materials" />','     <help> water viscosity [N s/m^2] </help>','</parameter>');
    41                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="heatcapacity" type="',class(self.heatcapacity),'" default="',convert2str(self.heatcapacity),'">','     <section name="materials" />','     <help> heat capacity [J/kg/K] </help>','</parameter>');
    42                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="latentheat" type="',class(self.latentheat),'" default="',convert2str(self.latentheat),'">','     <section name="materials" />','     <help> latent heat of fusion [J/kg] </help>','</parameter>');
    43 
    44 
    45                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="thermalconductivity" type="',class(self.thermalconductivity),'" default="',convert2str(self.thermalconductivity),'">','     <section name="materials" />','     <help> ice thermal conductivity [W/m/K] </help>','</parameter>');
    46                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="temperateiceconductivity" type="',class(self.temperateiceconductivity),'" default="',convert2str(self.temperateiceconductivity),'">','     <section name="materials" />','     <help> temperate ice thermal conductivity [W/m/K] </help>','</parameter>');
    47                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="meltingpoint" type="',class(self.meltingpoint),'" default="',convert2str(self.meltingpoint),'">','     <section name="materials" />','     <help> melting point of ice at 1atm in K </help>','</parameter>');
    48 
    49 
    50                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="beta" type="',class(self.beta),'" default="',convert2str(self.beta),'">','     <section name="materials" />','     <help> rate of change of melting point with pressure [K/Pa] </help>','</parameter>');
    51                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="mixed_layer_capacity" type="',class(self.mixed_layer_capacity),'" default="',convert2str(self.mixed_layer_capacity),'">','     <section name="materials" />','     <help> mixed layer capacity [W/kg/K] </help>','</parameter>');
    52                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="thermal_exchange_velocity" type="',class(self.thermal_exchange_velocity),'" default="',convert2str(self.thermal_exchange_velocity),'">','     <section name="materials" />','     <help> thermal exchange velocity [m/s] </help>','</parameter>');
    53 
    54 
    55                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="rheology_B" type="',class(self.rheology_B),'" default="',convert2str(self.rheology_B),'">','     <section name="materials" />','     <help> flow law parameter [Pa/s^(1/n)] </help>','</parameter>');
    56                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="rheology_n" type="',class(self.rheology_n),'" default="',convert2str(self.rheology_n),'">','     <section name="materials" />','     <help> Glens flow law exponent </help>','</parameter>');
    57 
    58                         % rheology_law drop-down
    59                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="rheology_law" type="alternative" optional="false">','     <section name="materials" />','     <help> law for the temperature dependance of the rheology: "None", "Paterson",  "Arrhenius" or "LliboutryDuval" </help>');
    60                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="None" type="string" default="true"> </option>');
    61                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="Paterson" type="string" default="false"> </option>');
    62                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="Arrhenius" type="string" default="false"> </option>');
    63                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','       <option value="LliboutryDuval" type="string" default="false"> </option>','</parameter>');
    64 
    65 
    66                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="lithosphere_shear_modulus" type="',class(self.lithosphere_shear_modulus),'" default="',convert2str(self.lithosphere_shear_modulus),'">','     <section name="materials" />','     <help> Lithosphere shear modulus [Pa] </help>','</parameter>');
    67                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="lithosphere_density" type="',class(self.lithosphere_density),'" default="',convert2str(self.lithosphere_density),'">','     <section name="materials" />','     <help> Lithosphere density [g/cm^-3] </help>','</parameter>');
    68                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="mantle_shear_modulus" type="',class(self.mantle_shear_modulus),'" default="',convert2str(self.mantle_shear_modulus),'">','     <section name="materials" />','     <help> Mantle shear modulus [Pa] </help>','</parameter>');
    69                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="mantle_density" type="',class(self.mantle_density),'" default="',convert2str(self.mantle_density),'">','     <section name="materials" />','     <help> Mantle density [g/cm^-3] </help>','</parameter>');
    70 
    71 
    72                 end % }}}
    7332                function self = extrude(self,md) % {{{
    7433                        self.rheology_B=project3d(md,'vector',self.rheology_B,'type','node');

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/mesh2dvertical.m

    r19897 r19958  
    5151        end
    5252        methods
    53                 function createxml(self,fid) % {{{
    54                         fprintf(fid, '<!-- 2d Mesh (Vertical) -->\n');
    55 
    56                         %elements and vertices
    57                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','       <frame key="1" label="Elements and vertices">','       <section name="mesh" />');
    58                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="numberofelements" type="',class(self.numberofelements),'" default="',convert2str(self.numberofelements),'">','              <help> number of elements </help>','          </parameter>');
    59                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="numberofvertices" type="',class(self.numberofvertices),'" default="',convert2str(self.numberofvertices),'">','              <help> number of vertices </help>','          </parameter>');
    60                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="elements" type="',class(self.elements),'" default="',convert2str(self.elements),'">','              <help> vertex indices of the mesh elements </help>','          </parameter>');
    61                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="x" type="',class(self.x),'" default="',convert2str(self.x),'">','     <section name="mesh" />','     <help> vertices x coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    62                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="y" type="',class(self.y),'" default="',convert2str(self.y),'">','     <section name="mesh" />','     <help> vertices y coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    63                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="edges" type="',class(self.edges),'" default="',convert2str(self.edges),'">','     <section name="mesh" />','     <help> edges of the 2d mesh (vertex1 vertex2 element1 element2) </help>','  </parameter>');
    64                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="numberofedges" type="',class(self.numberofedges),'" default="',convert2str(self.numberofedges),'">','     <section name="mesh" />','     <help> number of edges of the 2d mesh </help>','  </parameter>');
    65                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','       </frame>');
    66 
    67                         % properties
    68                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="2" label="Properties">','<section name="mesh" />');             
    69                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertexonboundary" type="',class(self.vertexonboundary),'" default="',convert2str(self.vertexonboundary),'">','     <section name="mesh" />','     <help> vertices on the boundary of the domain flag list </help>','  </parameter>');
    70                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertexonbase" type="',class(self.vertexonbase),'" default="',convert2str(self.vertexonbase),'">','     <section name="mesh" />','     <help> vertices on the bed of the domain flag list </help>','  </parameter>');           
    71                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="segments" type="',class(self.segments),'" default="',convert2str(self.segments),'">','     <section name="mesh" />','     <help> edges on domain boundary (vertex1 vertex2 element) </help>','  </parameter>');
    72                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="segmentmarkers" type="',class(self.segmentmarkers),'" default="',convert2str(self.segmentmarkers),'">','     <section name="mesh" />','     <help> number associated to each segment </help>','  </parameter>');
    73                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertexconnectivity" type="',class(self.vertexconnectivity),'" default="',convert2str(self.vertexconnectivity),'">','     <section name="mesh" />','     <help> list of vertices connected to vertex_i </help>','  </parameter>');
    74                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="elementconnectivity" type="',class(self.elementconnectivity),'" default="',convert2str(self.elementconnectivity),'">','     <section name="mesh" />','     <help> list of vertices connected to element_i </help>','  </parameter>');
    75                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="average_vertex_connectivity" type="',class(self.average_vertex_connectivity),'" default="',convert2str(self.average_vertex_connectivity),'">','     <section name="mesh" />','     <help> average number of vertices connected to one vertex </help>','  </parameter>');
    76                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    77 
    78                         %projection
    79                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="3" label="Projection">','<section name="mesh" />');
    80                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="lat" type="',class(self.lat),'" default="',convert2str(self.lat),'">','     <section name="mesh" />','     <help> vertices latitude [degrees] </help>','  </parameter>');
    81                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="long" type="',class(self.long),'" default="',convert2str(self.long),'">','     <section name="mesh" />','     <help> verticies longitude [degrees] </help>','  </parameter>');
    82                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="epsg" type="',class(self.epsg),'" default="',convert2str(self.epsg),'">','     <section name="mesh" />','     <help> Indicate epsg ''n'' or ''s'' </help>','  </parameter>');
    83                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    84 
    85                 end % }}}
    8653                function self = mesh2dvertical(varargin) % {{{
    8754                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/mesh3dprisms.m

    r19897 r19958  
    6262        end
    6363        methods
    64                 function createxml(self,fid) % {{{
    65                         fprintf(fid, '<!-- 3D prism Mesh -->\n');
    66 
    67                         % Elements and verticies of the original 2d mesh
    68                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','       <frame key="1" label="Elements and vertices of the orginal 2d mesh">','       <section name="mesh3dprisms" />');
    69                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="numberofelements2d" type="',class(self.numberofelements2d),'" default="',convert2str(self.numberofelements2d),'">','              <help> number of elements </help>','          </parameter>');
    70                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="numberofvertices2d" type="',class(self.numberofvertices2d),'" default="',convert2str(self.numberofvertices2d),'">','              <help> number of vertices </help>','          </parameter>');
    71                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="elements2d" type="',class(self.elements2d),'" default="',convert2str(self.elements2d),'">','              <help> vertex indices of the mesh elements </help>','          </parameter>');
    72                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="x2d" type="',class(self.x2d),'" default="',convert2str(self.x2d),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices x coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    73                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="y2d" type="',class(self.y2d),'" default="',convert2str(self.y2d),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices y coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    74                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','       </frame>');
    75 
    76                         % Elements and vertices of the extruded 3d mesh
    77                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','       <frame key="2" label="Elements and vertices of the orginal 3d mesh">','       <section name="mesh3dprisms" />');
    78                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="numberofelements" type="',class(self.numberofelements),'" default="',convert2str(self.numberofelements),'">','              <help> number of elements </help>','          </parameter>');
    79                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="numberofvertices" type="',class(self.numberofvertices),'" default="',convert2str(self.numberofvertices),'">','              <help> number of vertices </help>','          </parameter>');
    80                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="elements" type="',class(self.elements),'" default="',convert2str(self.elements),'">','              <help> vertex indices of the mesh elements </help>','          </parameter>');
    81                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="x" type="',class(self.x),'" default="',convert2str(self.x),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices x coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    82                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="y" type="',class(self.y),'" default="',convert2str(self.y),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices y coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    83                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="z" type="',class(self.y),'" default="',convert2str(self.y),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices z coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    84                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','       </frame>');
    85 
    86                         % properties
    87                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="3" label="Properties">','<section name="mesh3dprisms" />');             
    88                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="numberoflayers" type="',class(self.numberoflayers),'" default="',convert2str(self.numberoflayers),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> number of extrusion layers </help>','  </parameter>');
    89                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertexonbase" type="',class(self.vertexonbase),'" default="',convert2str(self.vertexonbase),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> lower vertices flags list </help>','  </parameter>');
    90                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="elementontbase" type="',class(self.elementontbase),'" default="',convert2str(self.elementontbase),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> lower elements flags list </help>','  </parameter>');
    91                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertexonsurface" type="',class(self.vertexonsurface),'" default="',convert2str(self.vertexonsurface),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> upper vertices flags list </help>','  </parameter>');
    92                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="elementontsurface" type="',class(self.elementontsurface),'" default="',convert2str(self.elementontsurface),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> upper elements flags list </help>','  </parameter>');
    93                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="uppervertex" type="',class(self.uppervertex),'" default="',convert2str(self.uppervertex),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> upper vertex list (NaN for vertex on the upper surface) </help>','  </parameter>');
    94                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="upperelements" type="',class(self.upperelements),'" default="',convert2str(self.upperelements),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> upper element list (NaN for element on the upper layer) </help>','  </parameter>');
    95                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="lowervertex" type="',class(self.lowervertex),'" default="',convert2str(self.lowervertex),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> lower vertex list (NaN for vertex on the lower surface) </help>','  </parameter>');
    96                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="lowerelements" type="',class(self.lowerelements),'" default="',convert2str(self.lowerelements),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> element list (NaN for element on the lower layer) </help>','  </parameter>');
    97                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertexonboundary" type="',class(self.vertexonboundary),'" default="',convert2str(self.vertexonboundary),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices on the boundary of the domain flag list </help>','  </parameter>');
    98                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertexconnectivity" type="',class(self.vertexconnectivity),'" default="',convert2str(self.vertexconnectivity),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> list of vertices connected to vertex_i </help>','  </parameter>');
    99                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="elementconnectivity" type="',class(self.elementconnectivity),'" default="',convert2str(self.elementconnectivity),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> average number of vertices connected to one vertex </help>','  </parameter>');
    100                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="average_vertex_connectivity" type="',class(self.average_vertex_connectivity),'" default="',convert2str(self.average_vertex_connectivity),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> average number of vertices connected to one vertex </help>','  </parameter>');
    101                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    102 
    103                         % Extracted model
    104                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="4" label="Extracted Model">','<section name="mesh3dprisms" />');
    105                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="extractedvertices" type="',class(self.extractedvertices),'" default="',convert2str(self.extractedvertices),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices extracted from the model </help>','  </parameter>');
    106                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="extractedelements" type="',class(self.extractedelements),'" default="',convert2str(self.extractedelements),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> elements extracted from the model </help>','  </parameter>');
    107                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    108 
    109                         % Projection
    110                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="5" label="Projection">','<section name="mesh3dprisms" />');
    111                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="lat" type="',class(self.lat),'" default="',convert2str(self.lat),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices latitude [degrees] </help>','  </parameter>');
    112                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="long" type="',class(self.long),'" default="',convert2str(self.long),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> verticies longitude [degrees] </help>','  </parameter>');
    113                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="epsg" type="',class(self.epsg),'" default="',convert2str(self.epsg),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> Indicate epsg ''n'' or ''s'' </help>','  </parameter>');
    114                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    115 
    116                 end % }}}cd
    11764                function self = mesh3dprisms(varargin) % {{{
    11865                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/mesh3dsurface.m

    r19897 r19958  
    130130                        fielddisplay(obj,'extractedelements','elements extracted from the model');
    131131                end % }}}
    132                 function createxml(obj,fid) % {{{
    133                         fprintf(fid, '<!-- #D surface Mesh -->\n');
    134 
    135                         %elements and vertices
    136                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="Elements and vertices">','<section name="mesh" />');
    137                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="numberofelements" type="',class(obj.numberofelements),'" default="',convert2str(obj.numberofelements),'">','     <section name="mesh" />','     <help> number of elements </help>','  </parameter>');
    138                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="numberofvertices" type="',class(obj.numberofvertices),'" default="',convert2str(obj.numberofvertices),'">','     <section name="mesh" />','     <help> number of vertices </help>','  </parameter>');
    139                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="elements" type="',class(obj.elements),'" default="',convert2str(obj.elements),'">','     <section name="mesh" />','     <help> vertex indices of the mesh elements </help>','  </parameter>');
    140                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="x" type="',class(obj.x),'" default="',convert2str(obj.x),'">','     <section name="mesh" />','     <help> vertices x coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    141                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="y" type="',class(obj.y),'" default="',convert2str(obj.y),'">','     <section name="mesh" />','     <help> vertices y coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    142                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="edges" type="',class(obj.edges),'" default="',convert2str(obj.edges),'">','     <section name="mesh" />','     <help> edges of the 2d mesh (vertex1 vertex2 element1 element2) </help>','  </parameter>');
    143                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="numberofedges" type="',class(obj.numberofedges),'" default="',convert2str(obj.numberofedges),'">','     <section name="mesh" />','     <help> number of edges of the 2d mesh </help>','  </parameter>');
    144                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    145 
    146                         % properties
    147                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="2" label="Properties">','<section name="mesh" />');             
    148                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertexonboundary" type="',class(obj.vertexonboundary),'" default="',convert2str(obj.vertexonboundary),'">','     <section name="mesh" />','     <help> vertices on the boundary of the domain flag list </help>','  </parameter>');
    149                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="segments" type="',class(obj.segments),'" default="',convert2str(obj.segments),'">','     <section name="mesh" />','     <help> edges on domain boundary (vertex1 vertex2 element) </help>','  </parameter>');
    150                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="segmentmarkers" type="',class(obj.segmentmarkers),'" default="',convert2str(obj.segmentmarkers),'">','     <section name="mesh" />','     <help> number associated to each segment </help>','  </parameter>');
    151                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertexconnectivity" type="',class(obj.vertexconnectivity),'" default="',convert2str(obj.vertexconnectivity),'">','     <section name="mesh" />','     <help> list of vertices connected to vertex_i </help>','  </parameter>');
    152                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="elementconnectivity" type="',class(obj.elementconnectivity),'" default="',convert2str(obj.elementconnectivity),'">','     <section name="mesh" />','     <help> list of vertices connected to element_i </help>','  </parameter>');
    153                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="average_vertex_connectivity" type="',class(obj.average_vertex_connectivity),'" default="',convert2str(obj.average_vertex_connectivity),'">','     <section name="mesh" />','     <help> average number of vertices connected to one vertex </help>','  </parameter>');
    154                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    155 
    156                         %extracted model
    157                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="3" label="Extracted Model">','<section name="mesh" />');
    158                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="extractedvertices" type="',class(obj.extractedvertices),'" default="',convert2str(obj.extractedvertices),'">','     <section name="mesh" />','     <help> vertices extracted from the model </help>','  </parameter>');
    159                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="extractedelements" type="',class(obj.extractedelements),'" default="',convert2str(obj.extractedelements),'">','     <section name="mesh" />','     <help> elements extracted from the model </help>','  </parameter>');
    160                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    161 
    162                         %projection
    163                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="4" label="Projection">','<section name="mesh" />');
    164                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="lat" type="',class(obj.lat),'" default="',convert2str(obj.lat),'">','     <section name="mesh" />','     <help> vertices latitude [degrees] </help>','  </parameter>');
    165                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="long" type="',class(obj.long),'" default="',convert2str(obj.long),'">','     <section name="mesh" />','     <help> verticies longitude [degrees] </help>','  </parameter>');
    166                         % choice (epsg) 'n' or 's'
    167                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="epsg" type="alternative" optional="false">','     <section name="mesh" />','     <help> Indicate epsg ''n'' or ''s'' </help>');
    168                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="n" type="string" default="true"> </option>');
    169                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="s" type="string" default="false"> </option>');
    170                         fprintf(fid,'%s\n','  </parameter>');
    171                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    172 
    173                 end % }}}
    174132                function marshall(obj,md,fid) % {{{
    175133                        WriteData(fid,'enum',DomainTypeEnum(),'data',StringToEnum(['Domain' domaintype(obj)]),'format','Integer');

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/mesh3dtetras.m

    r19897 r19958  
    6262        end
    6363        methods
    64                 function createxml(self,fid) % {{{
    65                         fprintf(fid, '<!-- 3D Tetra Mesh -->\n');
    66 
    67                         % Elements and verticies of the original 2d mesh
    68                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','       <frame key="1" label="Elements and vertices of the orginal 2d mesh">','       <section name="mesh3dprisms" />');
    69                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="numberofelements2d" type="',class(self.numberofelements2d),'" default="',convert2str(self.numberofelements2d),'">','              <help> number of elements </help>','          </parameter>');
    70                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="numberofvertices2d" type="',class(self.numberofvertices2d),'" default="',convert2str(self.numberofvertices2d),'">','              <help> number of vertices </help>','          </parameter>');
    71                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="elements2d" type="',class(self.elements2d),'" default="',convert2str(self.elements2d),'">','              <help> vertex indices of the mesh elements </help>','          </parameter>');
    72                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="x2d" type="',class(self.x2d),'" default="',convert2str(self.x2d),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices x coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    73                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="y2d" type="',class(self.y2d),'" default="',convert2str(self.y2d),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices y coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    74                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','       </frame>');
    75 
    76                         % Elements and vertices of the extruded 3d mesh
    77                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','       <frame key="2" label="Elements and vertices of the orginal 3d mesh">','       <section name="mesh3dprisms" />');
    78                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="numberofelements" type="',class(self.numberofelements),'" default="',convert2str(self.numberofelements),'">','              <help> number of elements </help>','          </parameter>');
    79                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="numberofvertices" type="',class(self.numberofvertices),'" default="',convert2str(self.numberofvertices),'">','              <help> number of vertices </help>','          </parameter>');
    80                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','          <parameter key ="elements" type="',class(self.elements),'" default="',convert2str(self.elements),'">','              <help> vertex indices of the mesh elements </help>','          </parameter>');
    81                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="x" type="',class(self.x),'" default="',convert2str(self.x),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices x coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    82                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="y" type="',class(self.y),'" default="',convert2str(self.y),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices y coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    83                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="z" type="',class(self.y),'" default="',convert2str(self.y),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices z coordinate [m] </help>','  </parameter>');
    84                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','       </frame>');
    85 
    86                         % properties
    87                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="3" label="Properties">','<section name="mesh3dprisms" />');             
    88                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="numberoflayers" type="',class(self.numberoflayers),'" default="',convert2str(self.numberoflayers),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> number of extrusion layers </help>','  </parameter>');
    89                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertexonbase" type="',class(self.vertexonbase),'" default="',convert2str(self.vertexonbase),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> lower vertices flags list </help>','  </parameter>');
    90                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="elementontbase" type="',class(self.elementontbase),'" default="',convert2str(self.elementontbase),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> lower elements flags list </help>','  </parameter>');
    91                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertexonsurface" type="',class(self.vertexonsurface),'" default="',convert2str(self.vertexonsurface),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> upper vertices flags list </help>','  </parameter>');
    92                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="elementontsurface" type="',class(self.elementontsurface),'" default="',convert2str(self.elementontsurface),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> upper elements flags list </help>','  </parameter>');
    93                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="uppervertex" type="',class(self.uppervertex),'" default="',convert2str(self.uppervertex),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> upper vertex list (NaN for vertex on the upper surface) </help>','  </parameter>');
    94                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="upperelements" type="',class(self.upperelements),'" default="',convert2str(self.upperelements),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> upper element list (NaN for element on the upper layer) </help>','  </parameter>');
    95                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="lowervertex" type="',class(self.lowervertex),'" default="',convert2str(self.lowervertex),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> lower vertex list (NaN for vertex on the lower surface) </help>','  </parameter>');
    96                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="lowerelements" type="',class(self.lowerelements),'" default="',convert2str(self.lowerelements),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> element list (NaN for element on the lower layer) </help>','  </parameter>');
    97                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertexonboundary" type="',class(self.vertexonboundary),'" default="',convert2str(self.vertexonboundary),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices on the boundary of the domain flag list </help>','  </parameter>');
    98                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertexconnectivity" type="',class(self.vertexconnectivity),'" default="',convert2str(self.vertexconnectivity),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> list of vertices connected to vertex_i </help>','  </parameter>');
    99                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="elementconnectivity" type="',class(self.elementconnectivity),'" default="',convert2str(self.elementconnectivity),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> average number of vertices connected to one vertex </help>','  </parameter>');
    100                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="average_vertex_connectivity" type="',class(self.average_vertex_connectivity),'" default="',convert2str(self.average_vertex_connectivity),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> average number of vertices connected to one vertex </help>','  </parameter>');
    101                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    102 
    103                         % Extracted model
    104                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="4" label="Extracted Model">','<section name="mesh3dprisms" />');
    105                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="extractedvertices" type="',class(self.extractedvertices),'" default="',convert2str(self.extractedvertices),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices extracted from the model </help>','  </parameter>');
    106                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="extractedelements" type="',class(self.extractedelements),'" default="',convert2str(self.extractedelements),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> elements extracted from the model </help>','  </parameter>');
    107                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    108 
    109                         % Projection
    110                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="5" label="Projection">','<section name="mesh3dprisms" />');
    111                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="lat" type="',class(self.lat),'" default="',convert2str(self.lat),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> vertices latitude [degrees] </help>','  </parameter>');
    112                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="long" type="',class(self.long),'" default="',convert2str(self.long),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> verticies longitude [degrees] </help>','  </parameter>');
    113                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="epsg" type="',class(self.epsg),'" default="',convert2str(self.epsg),'">','     <section name="mesh3dprisms" />','     <help> Indicate epsg ''n'' or ''s'' </help>','  </parameter>');
    114                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    115 
    116                 end % }}}cd
    11764                function self = mesh3dtetras(varargin) % {{{
    11865                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/miscellaneous.m

    r19951 r19958  
    1111        end
    1212        methods
    13         function createxml(self,fid) % {{{
    14             fprintf(fid, '<!-- miscellaneous -->\n');           
    15                    
    16             % miscellaneous solution parameters
    17             fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="miscellaneous parameters">','<section name="miscellaneous" />');                   
    18                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="notes" type="',class(self.notes),'" default="',convert2str(self.notes),'">','     <section name="miscellaneous" />','     <help> notes in a cell of strings </help>','  </parameter>');
    19                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="name" type="',class(self.name),'" default="',convert2str(self.name),'">','     <section name="miscellaneous" />','     <help> model name </help>','  </parameter>');
    20                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="dummy" type="',class(self.dummy),'" default="',convert2str(self.dummy),'">','     <section name="miscellaneous" />','     <help> empty field to store some data </help>','  </parameter>');
    21             fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');   
    22        
    23         end % }}}       
    2413                function self = miscellaneous(varargin) % {{{
    2514                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/mismipbasalforcings.m

    r19911 r19958  
    1313        end
    1414        methods
    15      function createxml(self,fid) % {{{
    16             fprintf(fid, '\n\n');
    17             fprintf(fid, '%s\n', '<!-- basalforcings -->');
    18                          fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="melting_rate" type="',            class(self.melting_rate),'" default="',              num2str(self.melting_rate),'">',              '     <section name="basalforcings" />','     <help> basal melting rate (positive if melting) [m/yr] </help>','</parameter>');
    19              fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="geothermalflux" type="',          class(self.geothermalflux),'" default="',            num2str(self.geothermalflux),'">',            '     <section name="basalforcings" />','     <help> geothermal heat flux [W/m^2] </help>','</parameter>');
    20              
    21         end % }}}
    2215                function self = extrude(self,md) % {{{
    2316                        self.groundedice_melting_rate=project3d(md,'vector',self.groundedice_melting_rate,'type','node','layer',1);

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/outputdefinition.m

    r19879 r19958  
    99        end
    1010        methods
    11            function createxml(self,fid) % {{{
    12             fprintf(fid, '<!-- outputdefinition -->\n');           
    13                    
    14             % outputdefinition solution parameters
    15             fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="outputdefinition">','<section name="outputdefinition" />');                   
    16                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="definitions" type="',class(self.definitions),'" default="',convert2str(self.definitions),'">','     <section name="outputdefinition" />','     <help> list of potential outputs that can be requested, but which need additional data to be defined </help>','  </parameter>');
    17             fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');   
    18        
    19         end % }}}
    2011                function self = outputdefinition(varargin) % {{{
    2112                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/qmu.m

    r19879 r19958  
    2424        end
    2525        methods
    26                 function createxml(self,fid) % {{{
    27                         fprintf(fid, '<!-- qmu -->\n');           
    28 
    29                         % qmu solution parameters
    30                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="qmu parameters">','<section name="qmu" />');                   
    31                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="isdakota" type="',class(self.isdakota),'" default="',convert2str(self.isdakota),'">','     <section name="qmu" />','     <help> is qmu analysis activated? </help>','  </parameter>');
    32                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="variables" type="',class(self.variables),'" default="',convert2str(self.variables),'">','     <section name="qmu" />','     <help> (arrays of each variable class) </help>','  </parameter>');
    33                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="responses" type="',class(self.responses),'" default="',convert2str(self.responses),'">','     <section name="qmu" />','     <help> (arrays of each response class) </help>','  </parameter>');
    34 
    35                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="numberofresponses" type="',class(self.numberofresponses),'" default="',convert2str(self.numberofresponses),'">','     <section name="qmu" />','     <help> number of responses </help>','  </parameter>');
    36                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="params" type="',class(self.params),'" default="',convert2str(self.params),'">','     <section name="qmu" />','     <help> (array of method-independent parameters)  </help>','  </parameter>');
    37                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="results" type="',class(self.results),'" default="',convert2str(self.results),'">','     <section name="qmu" />','     <help> (information from dakota files) </help>','  </parameter>');
    38 
    39                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="partition" type="',class(self.partition),'" default="',convert2str(self.partition),'">','     <section name="qmu" />','     <help> user provided mesh partitioning, defaults to metis if not specified </help>','  </parameter>');
    40                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="numberofpartitions" type="',class(self.numberofpartitions),'" default="',convert2str(self.numberofpartitions),'">','     <section name="qmu" />','     <help> number of partitions for semi-discrete qmu  </help>','  </parameter>');
    41                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="variabledescriptors" type="',class(self.variabledescriptors),'" default="',convert2str(self.variabledescriptors),'">','     <section name="qmu" />','     <help>  </help>','  </parameter>');
    42 
    43                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="responsedescriptors" type="',class(self.responsedescriptors),'" default="',convert2str(self.responsedescriptors),'">','     <section name="qmu" />','     <help> use an enthalpy formulation to include temperate ice (default is 0) </help>','  </parameter>');
    44                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="method" type="',class(self.method),'" default="',convert2str(self.method),'">','     <section name="qmu" />','     <help> array of dakota_method class </help>','  </parameter>');
    45                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="mass_flux_profile_directory" type="',class(self.mass_flux_profile_directory),'" default="',convert2str(self.mass_flux_profile_directory),'">','     <section name="qmu" />','     <help> directory for mass flux profiles </help>','  </parameter>');
    46 
    47                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="mass_flux_profiles" type="',class(self.mass_flux_profiles),'" default="',convert2str(self.mass_flux_profiles),'">','     <section name="qmu" />','     <help>  </help>','  </parameter>');
    48                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="mass_flux_segments" type="',class(self.mass_flux_segments),'" default="',convert2str(self.mass_flux_segments),'">','     <section name="qmu" />','     <help>  </help>','  </parameter>');
    49                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="adjacency" type="',class(self.adjacency),'" default="',convert2str(self.adjacency),'">','     <section name="qmu" />','     <help> additional outputs requested </help>','  </parameter>');
    50                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="vertex_weight" type="',class(self.vertex_weight),'" default="',convert2str(self.vertex_weight),'">','     <section name="qmu" />','     <help> weight applied to each mesh vertex </help>','  </parameter>');
    51 
    52                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');   
    53 
    54                 end % }}}       
    5526                function self = extrude(self,md) % {{{
    5627                        self.partition=project3d(md,'vector',self.partition','type','node');

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/rifts.m

    r19879 r19958  
    1010        end
    1111        methods
    12         function createxml(self,fid) % {{{
    13             fprintf(fid, '\n\n');
    14             fprintf(fid, '%s\n', '<!-- rifts -->');
    15                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="riftstruct" type="',              class(self.riftstruct),'" default="',                  self.riftstruct,'">',              '     <section name="rifts" />','     <help> structure containing all rift information (vertices coordinates, segments, type of melange, ...) </help>','</parameter>');
    16             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="riftproperties" type="',            class(self.riftproperties),'" default="',                self.riftproperties,'">',   '     <section name="rifts" />','     <help> N/A </help>','</parameter>');
    17    
    18         end % }}}
    1912                function self = rifts(varargin) % {{{
    2013                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/settings.m

    r19879 r19958  
    2020        end
    2121        methods
    22         function createxml(self,fid) % {{{
    23             fprintf(fid, '\n\n');
    24             fprintf(fid, '%s\n', '<!-- settings -->');
    25                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="results_on_nodes" type="',      class(self.results_on_nodes),'" default="',        convert2str(self.results_on_nodes),'">',        '     <section name="settings" />','     <help> results are output for all the nodes of each element </help>','</parameter>');
    26             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="io_gather" type="',          class(self.io_gather),'" default="',           convert2str(self.io_gather),'">',     '     <section name="settings" />','     <help> I/O gathering strategy for result outputs (default 1) </help>','</parameter>');
    27            
    28             % lowmen drop-down (0 or 1)
    29             fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n%s\n',     '<parameter key ="lowmem" type="alternative" optional="true">', '     <section name="settings" />','     <help> is the memory limited ? (0 or 1) </help>');
    30             fprintf(fid,'%s\n','       <option value="0" type="string" default="true"> </option>');
    31             fprintf(fid,'%s\n%s\n','       <option value="1" type="string" default="false"> </option>','</parameter>');
    32 
    33             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="output_frequency" type="',          class(self.output_frequency),'" default="',           convert2str(self.output_frequency),'">',     '     <section name="settings" />','     <help> frequency at which results are saved in all solutions with multiple time_steps </help>','</parameter>');
    34             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="waitonlock" type="',   class(self.waitonlock),'" default="',      convert2str(self.waitonlock),'">',     '     <section name="settings" />','     <help> maximum number of minutes to wait for batch results (NaN to deactivate) </help>','</parameter>');
    35             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="upload_server" type="',         class(self.upload_server),'" default="',          convert2str(self.upload_server),'">',        '     <section name="settings" />','     <help> server hostname where model should be uploaded </help>','</parameter>');
    36             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="upload_path" type="',             class(self.upload_path),'" default="',              convert2str(self.upload_path),'">',     '     <section name="settings" />','     <help> path on server where model should be uploaded </help>','</parameter>');
    37             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="upload_login" type="',        class(self.upload_login),'" default="',         convert2str(self.upload_login),'">',     '     <section name="settings" />','     <help> server login </help>','</parameter>');
    38             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="upload_port" type="',          class(self.upload_port),'" default="',      convert2str(self.upload_port),'">',     '     <section name="settings" />','     <help> port login (default is 0) </help>','</parameter>');
    39             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n',         '<parameter key ="upload_filename" type="',         class(self.upload_filename),'" default="',          convert2str(self.upload_filename),'">', '     <section name="settings" />','     <help> unique id generated when uploading the file to server </help>','</parameter>');
    40              
    41         end % }}}
    4222                function self = settings(varargin) % {{{
    4323                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/steadystate.m

    r19879 r19958  
    1111        end
    1212        methods
    13         function createxml(self,fid) % {{{
    14             fprintf(fid, '<!-- steadystate -->\n');           
    15                    
    16             % steadystate solution parameters
    17             fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="steadystate solution parameters">','<section name="steadystate" />');                   
    18                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="reltol" type="',class(self.reltol),'" default="',convert2str(self.reltol),'">','     <section name="steadystate" />','     <help> relative tolerance criterion [K] </help>','  </parameter>');
    19                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="maxiter" type="',class(self.maxiter),'" default="',convert2str(self.maxiter),'">','     <section name="steadystate" />','     <help> maximum number of iterations </help>','  </parameter>');
    20                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="requested_outputs" type="',class(self.requested_outputs),'" default="',convert2str(self.requested_outputs),'">','     <section name="steadystate" />','     <help> additional requested outputs </help>','  </parameter>');
    21             fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');   
    22        
    23         end % }}}
    2413                function self = steadystate(varargin) % {{{
    2514                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/stressbalance.m

    r19903 r19958  
    2626        end
    2727        methods
    28                 function createxml(self,fid) % {{{
    29                         fprintf(fid, '\n\n');
    30                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- StressBalance solution parameters: -->');
    31 
    32                         % Convergence criteria           
    33                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="Convergence criteria">','<section name="stressbalance" />');
    34                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="restol" type="',      class(self.restol),'" default="',        convert2str(self.restol),'">',      '     <section name="stressbalance" />','     <help> mechanical equilibrium residual convergence criterion </help>','</parameter>');
    35                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="reltol" type="',          class(self.reltol),'" default="',            convert2str(self.reltol),'">',     '     <section name="stressbalance" />','     <help> velocity relative convergence criterion, NaN: not applied </help>','</parameter>');
    36                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n', '<parameter key ="abstol" type="',        class(self.abstol),'" default="',          convert2str(self.abstol),'">',     '     <section name="stressbalance" />','     <help> velocity absolute convergence criterion, NaN: not applied </help>','</parameter>');
    37 
    38                         %is newton drop-down (0,1,or 2)
    39                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="isnewton" type="alternative" optional="false">',   '     <section name="stressbalance" />','     <help> 0: Picards fixed point, 1: Newtons method, 2: hybrid </help>');
    40                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="0" type="string" default="true"> </option>');
    41                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="1" type="string" default="false"> </option>');
    42                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','       <option value="2" type="string" default="false"> </option>','</parameter>');
    43 
    44                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="maxiter" type="',          class(self.maxiter),'" default="',       convert2str(self.maxiter),'">',     '     <section name="stressbalance" />','     <help> maximum number of nonlinear iterations </help>','</parameter>');
    45                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="viscosity_overshoot" type="',         class(self.viscosity_overshoot),'" default="',           convert2str(self.viscosity_overshoot),'">', '     <section name="stressbalance" />','     <help> over-shooting constant new=new+C*(new-old) </help>','</parameter>');
    46                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    47 
    48                         % boundary conditions   
    49                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="2" label="Boundary conditions">','<section name="stressbalance" />');                   
    50                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="spcvx" type="',            class(self.spcvx),'" default="',        convert2str(self.spcvx),'">',     '     <section name="stressbalance" />','     <help> x-axis velocity constraint (NaN means no constraint) [m/yr] </help>','</parameter>');
    51                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="spcvy" type="',            class(self.spcvy),'" default="',        convert2str(self.spcvy),'">',   '     <section name="stressbalance" />','     <help> y-axis velocity constraint (NaN means no constraint) [m/yr] </help>','</parameter>');
    52                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="spcvz" type="',            class(self.spcvz),'" default="',        convert2str(self.spcvz),'">',     '     <section name="stressbalance" />','     <help> z-axis velocity constraint (NaN means no constraint) [m/yr] </help>','</parameter>');
    53                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    54 
    55                         % Rift options   
    56                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="3" label="Rift options">','<section name="stressbalance" />'); 
    57                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="rift_penalty_threshold" type="',           class(self.rift_penalty_threshold),'" default="',       convert2str(self.rift_penalty_threshold),'">',     '     <section name="stressbalance" />','     <help> threshold for instability of mechanical constraints </help>','</parameter>');
    58                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',         '<parameter key ="rift_penalty_lock" type="',         class(self.rift_penalty_lock),'" default="',           convert2str(self.rift_penalty_lock),'">',  '     <section name="stressbalance" />','     <help> number of iterations before rift penalties are locked </help>','</parameter>');
    59                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    60 
    61                         %others
    62                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="4" label="Other">','<section name="stressbalance" />');         
    63                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="shelf_dampening" type="',          class(self.shelf_dampening),'" default="',       convert2str(self.shelf_dampening),'">',     '     <section name="stressbalance" />','     <help> use dampening for floating ice ? Only for FS model </help>','</parameter>');
    64                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',         '<parameter key ="FSreconditioning" type="',    class(self.FSreconditioning),'" default="',           convert2str(self.FSreconditioning),'">',  '     <section name="stressbalance" />','     <help> multiplier for incompressibility equation. Only for FS model </help>','</parameter>');
    65                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="referential" type="',      class(self.referential),'" default="',       convert2str(self.referential),'">',     '     <section name="stressbalance" />','     <help> local referential </help>','</parameter>');
    66                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',         '<parameter key ="loadingforce" type="',        class(self.loadingforce),'" default="',           convert2str(self.loadingforce),'">',  '     <section name="stressbalance" />','     <help> loading force applied on each point [N/m^3] </help>','</parameter>');
    67                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="requested_outputs" type="',        class(self.requested_outputs),'" default="',       convert2str(self.requested_outputs),'">',     '     <section name="stressbalance" />','     <help> additional outputs requested </help>','</parameter>');
    68 
    69 
    70                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');
    71                 end % }}}
    7228                function self = extrude(self,md) % {{{
    7329                        self.spcvx=project3d(md,'vector',self.spcvx,'type','node');

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/thermal.m

    r19903 r19958  
    1818        end
    1919        methods
    20                 function createxml(self,fid) % {{{
    21                         fprintf(fid, '<!-- thermal -->\n');           
    22 
    23                         % thermal solution parameters
    24                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="Thermal solution parameters">','<section name="thermal" />');                   
    25                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="spctemperature" type="',class(self.spctemperature),'" default="',convert2str(self.spctemperature),'">','     <section name="thermal" />','     <help> temperature constraints (NaN means no constraint) [K] </help>','  </parameter>');
    26 
    27                         % penalty_threshold drop-down (0, 1, or 2)
    28                         fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="penalty_threshold" type="alternative"  optional="false">','     <section name="thermal" />','     <help> 0: no, 1: artificial_diffusivity, 2: SUPG </help>');
    29                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="0" type="string" default="true"> </option>');
    30                         fprintf(fid,'%s\n','       <option value="1" type="string" default="false"> </option>');
    31                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','       <option value="2" type="string" default="false"> </option>','</parameter>');
    32 
    33                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="stabilization" type="',class(self.stabilization),'" default="',convert2str(self.stabilization),'">','     <section name="thermal" />','     <help> maximum number of non linear iterations </help>','  </parameter>');
    34                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="reltol" type="',class(self.reltol),'" default="',convert2str(self.reltol),'">','     <section name="steadystate" />','     <help> relative tolerance criterion [K] </help>','  </parameter>');
    35                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="maxiter" type="',class(self.maxiter),'" default="',convert2str(self.maxiter),'">','     <section name="thermal" />','     <help> stabilize unstable thermal constraints that keep zigzagging after n iteration (default is 0, no stabilization) </help>','  </parameter>');
    36                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="penalty_lock" type="',class(self.penalty_lock),'" default="',convert2str(self.penalty_lock),'">','     <section name="thermal" />','     <help> threshold to declare convergence of thermal solution (default is 0)  </help>','  </parameter>');
    37                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="penalty_factor" type="',class(self.penalty_factor),'" default="',convert2str(self.penalty_factor),'">','     <section name="thermal" />','     <help> scaling exponent (default is 3) </help>','  </parameter>');
    38                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="isenthalpy" type="',class(self.isenthalpy),'" default="',convert2str(self.isenthalpy),'">','     <section name="thermal" />','     <help> use an enthalpy formulation to include temperate ice (default is 0) </help>','  </parameter>');
    39                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="isdynamicbasalspc" type="',class(self.isdynamicbasalspc),'" default="',convert2str(self.isdynamicbasalspc),'">','     <section name="thermal" />','     <help> enable dynamic setting of basal forcing. recommended for enthalpy formulation (default is 0)  </help>','  </parameter>');
    40                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="requested_outputs" type="',class(self.requested_outputs),'" default="',convert2str(self.requested_outputs),'">','     <section name="thermal" />','     <help> additional outputs requested </help>','  </parameter>');
    41                         fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');   
    42 
    43                 end % }}}
    4420                function self = extrude(self,md) % {{{
    4521                        self.spctemperature=project3d(md,'vector',self.spctemperature,'type','node','layer',md.mesh.numberoflayers,'padding',NaN);

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/timestepping.m

    r19897 r19958  
    1414        end
    1515        methods
    16        function createxml(self,fid) % {{{
    17             fprintf(fid, '\n\n');
    18             fprintf(fid, '%s\n', '<!-- Timestepping -->');
    19                         fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="start_time" type="',              class(self.start_time),'" default="',                  convert2str(self.start_time),'">',              '     <section name="timestepping" />','     <help> simulation starting time [yr] </help>','</parameter>');
    20             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="final_time" type="',            class(self.final_time),'" default="',                convert2str(self.final_time),'">',   '     <section name="timestepping" />','     <help> final time to stop the simulation [yr] </help>','</parameter>');
    21             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',        '<parameter key ="time_step" type="',      class(self.time_step),'" default="',          convert2str(self.time_step),'">',            '     <section name="timestepping" />','     <help> length of time steps [yr] </help>','</parameter>');
    22             % time_adapt 0 or 1 drop down
    23             fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n%s\n','<parameter key ="time_adapt" type="alternative" optional="false">','     <section name="timestepping" />','     <help> use cfl condition to define time step ? (0 or 1)  </help>');
    24             fprintf(fid, '%s\n',   '       <option value="0" type="string" default="true"></option>');
    25             fprintf(fid, '%s\n%s\n',   '       <option value="1" type="string" default="false"></option>','</parameter>');
    26             fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="cfl_coefficient" type="',       class(self.cfl_coefficient),'" default="',              convert2str(self.cfl_coefficient),'">',              '     <section name="timestepping" />','     <help> coefficient applied to cfl condition </help>','</parameter>');
    27            
    28         end % }}}
    29        
    3016                function self = timestepping(varargin) % {{{
    3117                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/transient.m

    r19879 r19958  
    1919        end
    2020        methods
    21         function createxml(self,fid) % {{{
    22             fprintf(fid, '<!-- transient -->\n');           
    23                    
    24             % transient solution parameters
    25             fprintf(fid,'%s\n%s\n%s\n','<frame key="1" label="transient solution parameters">','<section name="transient" />');                   
    26                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="issmb" type="',class(self.issmb),'" default="',convert2str(self.issmb),'">','     <section name="transient" />','     <help> indicates whether a masstransport solution is used in the transient </help>','  </parameter>');
    27                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="ismasstransport" type="',class(self.ismasstransport),'" default="',convert2str(self.ismasstransport),'">','     <section name="transient" />','     <help> indicates whether a masstransport solution is used in the transient </help>','  </parameter>');
    28                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="isstressbalance" type="',class(self.isstressbalance),'" default="',convert2str(self.isstressbalance),'">','     <section name="transient" />','     <help> indicates whether a stressbalance solution is used in the transient </help>','  </parameter>');
    29                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="isthermal" type="',class(self.isthermal),'" default="',convert2str(self.isthermal),'">','     <section name="transient" />','     <help> indicates whether a thermal solution is used in the transient </help>','  </parameter>');
    30                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="isgroundingline" type="',class(self.isgroundingline),'" default="',convert2str(self.isgroundingline),'">','     <section name="transient" />','     <help> indicates whether a groundingline migration is used in the transient </help>','  </parameter>');
    31                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="isgia" type="',class(self.isgia),'" default="',convert2str(self.isgia),'">','     <section name="transient" />','     <help> indicates whether a postglacial rebound model is used in the transient </help>','  </parameter>');
    32                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="isdamageevolution" type="',class(self.isdamageevolution),'" default="',convert2str(self.isdamageevolution),'">','     <section name="transient" />','     <help> indicates whether damage evolution is used in the transient </help>','  </parameter>');
    33                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="islevelset" type="',class(self.islevelset),'" default="',convert2str(self.islevelset),'">','     <section name="transient" />','     <help> LEVEL SET DESCRIPTION...  </help>','  </parameter>');
    34                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="iscalving" type="',class(self.iscalving),'" default="',convert2str(self.iscalving),'">','     <section name="transient" />','     <help> indicates whether calving is used in the transient </help>','  </parameter>');
    35                 fprintf(fid,'%s%s%s%s%s\n%s\n%s\n%s\n','  <parameter key ="requested_outputs" type="',class(self.requested_outputs),'" default="',convert2str(self.requested_outputs),'">','     <section name="transient" />','     <help> list of additional outputs requested </help>','  </parameter>');
    36             fprintf(fid,'%s\n%s\n','</frame>');   
    37        
    38         end % }}}
    3921                function self = transient(varargin) % {{{
    4022                        switch nargin

  • issm/trunk-jpl/src/m/classes/verbose.m

    r19879 r19958  
    4040        %}}}
    4141        methods
    42                 function createxml(self,fid) % {{{
    43                         fprintf(fid, '\n\n');
    44                         fprintf(fid, '%s\n', '<!-- verbose -->');
    45 
    46                         fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="mprocessor" type="',              class(self.mprocessor),'" optional="false">',              '     <section name="verbose" />','        <option value="',convert2str(self.mprocessor),'" type="string" default="true"></option>','     <help>  </help>','</parameter>');
    47                         fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="module" type="',              class(self.module),'" optional="false">',              '     <section name="verbose" />','        <option value="',convert2str(self.module),'" type="string" default="true"></option>','     <help>  </help>','</parameter>');
    48                         fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="solution" type="',              class(self.solution),'" optional="false">',              '     <section name="verbose" />','        <option value="',convert2str(self.solution),'" type="string" default="true"></option>','     <help>  </help>','</parameter>');
    49                         fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="solver" type="',              class(self.solver),'" optional="false">',              '     <section name="verbose" />','        <option value="',convert2str(self.solver),'" type="string" default="true"></option>','     <help>  </help>','</parameter>');
    50                         fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="convergence" type="',              class(self.convergence),'" optional="false">',              '     <section name="verbose" />','        <option value="',convert2str(self.convergence),'" type="string" default="true"></option>','     <help>  </help>','</parameter>');
    51                         fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="control" type="',              class(self.control),'" optional="false">',              '     <section name="verbose" />','        <option value="',convert2str(self.control),'" type="string" default="true"></option>','     <help>  </help>','</parameter>');
    52                         fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n%s\n',    '<parameter key ="qmu" type="',              class(self.qmu),'" optional="false">',              '     <section name="verbose" />','        <option value="',convert2str(self.qmu),'" type="string" default="true"></option>','     <help>  </help>','</parameter>');
    53                         fprintf(fid,'%s%s%s\n%s\n%s%s%s\n%s\n',    '<parameter key ="autodiff" type="',              class(self.autodiff),'" optional="false">',              '     <section name="verbose" />','        <option value="',convert2str(self.autodiff),'" type="string" default="true"></option>','     <help>  </help>','</parameter>');
    54 
    55 
    56                 end % }}}
    5742                function verbose=verbose(varargin) % {{{
    5843
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.