Changeset 11874


Ignore:
Timestamp:
04/03/12 12:13:58 (13 years ago)
Author:
Mathieu Morlighem
Message:

simpified 3d and better indentation

Location:
issm/trunk-jpl
Files:
6 edited

Legend:

Unmodified
Added
Removed

  • issm/trunk-jpl/m4/issm_options.m4

    r11862 r11874  
    44
    55        dnl ISSM's internal options
    6         dnl Debugging {{{1
    7         AC_ARG_ENABLE([debugging],AS_HELP_STRING([--enable-debugging],
    8                                          [turn debug support on]),
    9                 [enable_debugging=$enableval],[enable_debugging=no])
     6        dnl Debugging {{{
     7        AC_ARG_ENABLE([debugging],                                        dnl feature
     8                AS_HELP_STRING([--enable-debugging],[turn debug support on]),  dnl help string
     9                [enable_debugging=$enableval],                                 dnl action if given
     10                [enable_debugging=no])                                         dnl action if not given
    1011        if test "x$enable_debugging" = xyes; then
    11          AC_DEFINE([_ISSM_DEBUG_],[1],[Macro to enable debugging in ISSM.])
    12         fi
    13         dnl }}}
    14         dnl Serial build {{{1
     12                AC_DEFINE([_ISSM_DEBUG_],[1],[Macro to enable debugging in ISSM])
     13        fi
     14        dnl }}}
     15        dnl Serial build {{{
    1516        AC_ARG_WITH([serial],
    16                           AS_HELP_STRING([--with-serial = value],
    17                                                          [serial compilation. ]),
    18                           [SERIAL_VALUE=$withval],[SERIAL_VALUE="yes"])
     17                AS_HELP_STRING([--with-serial = value],[serial compilation. ]),
     18                [SERIAL_VALUE=$withval],[SERIAL_VALUE="yes"])
    1919        AC_MSG_CHECKING(for serial compilation)
    2020        AM_CONDITIONAL([NOSERIAL], [test $SERIAL_VALUE = no])
    … …  
    2222        AC_MSG_RESULT($SERIAL_VALUE)
    2323        dnl }}}
    24         dnl Parallel build {{{1
     24        dnl Parallel build {{{
    2525        AC_ARG_WITH([parallel],
    26                           AS_HELP_STRING([--with-parallel = value],
    27                                                          [parallel compilation. ]),
    28                           [PARALLEL_VALUE=$withval],[PARALLEL_VALUE="yes"])
     26                AS_HELP_STRING([--with-parallel = value], [parallel compilation. ]),
     27                [PARALLEL_VALUE=$withval],[PARALLEL_VALUE="yes"])
    2928        AC_MSG_CHECKING(for parallel compilation)
    3029        AM_CONDITIONAL([NOPARALLEL], [test $PARALLEL_VALUE = no])
    … …  
    3433        AC_SUBST([ISSMEXT])
    3534        dnl }}}
    36         dnl Serial or Parallel check {{{1
     35        dnl Serial or Parallel check {{{
    3736        dnl Check that at least serial or parallel builds have been requested!
    3837        if test "$SERIAL_VALUE" != "yes" ; then
    3938                if test "$PARALLEL_VALUE" != "yes"; then
    40                 AC_MSG_ERROR([cannot request --with-serial=no and --with-parallel=no at the same time!])
     39                        AC_MSG_ERROR([cannot request --with-serial=no and --with-parallel=no at the same time!])
    4140                fi
    4241        fi
    … …  
    4443
    4544        dnl ISSM's externalpackages
    46         dnl vendor{{{1
     45        dnl vendor{{{
    4746        AC_ARG_WITH([vendor],
    48                           AS_HELP_STRING([--with-vendor = VENDOR], [vendor name, ex: intel]), [VENDOR=$withval],[VENDOR=""])
     47          AS_HELP_STRING([--with-vendor = VENDOR], [vendor name, ex: intel]),
     48          [VENDOR=$withval],[VENDOR=""])
    4949        AC_MSG_CHECKING(for vendor compilers)
    5050        if test -n "$VENDOR"; then
    … …  
    9292        dnl 1. See if matlab has been provided
    9393        AC_ARG_WITH([matlab-dir],
    94                                 AS_HELP_STRING([--with-matlab-dir = DIR],
    95                                         [matlab root directory. necessary for serial build.]),
    96                                 [MATLAB_ROOT=$withval],[MATLAB_ROOT=""])
     94                AS_HELP_STRING([--with-matlab-dir = DIR], [matlab root directory. necessary for serial build.]),
     95                [MATLAB_ROOT=$withval],[MATLAB_ROOT=""])
    9796
    9897        AC_MSG_CHECKING([wether Matlab is enabled])
    … …  
    219218                AC_SUBST([MEXLINK])
    220219        fi
    221 
    222         dnl }}}
    223         dnl triangle {{{1
     220        dnl }}}
     221        dnl triangle {{{
    224222        AC_ARG_WITH([triangle-dir],
    225223                          AS_HELP_STRING([--with-triangle-dir = DIR], [triangle root directory. necessary for serial build]),
    … …  
    262260        AC_MSG_RESULT(ok)
    263261        dnl }}}
    264         dnl dakota{{{1
     262        dnl dakota{{{
    265263        AC_ARG_WITH([dakota-dir],
    266                           AS_HELP_STRING([--with-dakota-dir = DIR], [dakota root directory. necessary for serial build]),
    267                         [DAKOTA_ROOT=$withval],[DAKOTA_ROOT=""])
     264          AS_HELP_STRING([--with-dakota-dir = DIR], [dakota root directory. necessary for serial build]),
     265          [DAKOTA_ROOT=$withval],[DAKOTA_ROOT=""])
    268266        AC_MSG_CHECKING(for Dakota)
    269267       
    … …  
    295293        AC_MSG_RESULT($HAVE_DAKOTA)
    296294        dnl }}}
    297         dnl boost{{{1
     295        dnl boost{{{
    298296        AC_ARG_WITH([boost-dir],
    299                           AS_HELP_STRING([--with-boost-dir = DIR], [boost root directory.]),
    300                         [BOOST_ROOT=$withval],[BOOST_ROOT=""])
     297          AS_HELP_STRING([--with-boost-dir = DIR], [boost root directory.]),
     298          [BOOST_ROOT=$withval],[BOOST_ROOT=""])
    301299        AC_MSG_CHECKING(for Boost)
    302300       
    … …  
    316314        AC_MSG_RESULT($HAVE_BOOST)
    317315        dnl }}}
    318         dnl python{{{1
     316        dnl python{{{
    319317        AC_ARG_WITH([python-dir],
    320                           AS_HELP_STRING([--with-python-dir = DIR], [python root directory.]),
    321                         [PYTHON_ROOT=$withval],[PYTHON_ROOT=""])
     318          AS_HELP_STRING([--with-python-dir = DIR], [python root directory.]),
     319          [PYTHON_ROOT=$withval],[PYTHON_ROOT=""])
    322320        AC_MSG_CHECKING(for Python)
    323321       
    … …  
    342340        AC_MSG_RESULT($HAVE_PYTHON)
    343341        dnl }}}
    344         dnl python-numpy{{{1
     342        dnl python-numpy{{{
    345343        AC_ARG_WITH([python-numpy-dir],
    346                           AS_HELP_STRING([--with-python-numpy-dir = DIR], [python-numpy root directory.]),
    347                         [PYTHON_NUMPY_ROOT=$withval],[PYTHON_NUMPY_ROOT=""])
     344          AS_HELP_STRING([--with-python-numpy-dir = DIR], [python-numpy root directory.]),
     345          [PYTHON_NUMPY_ROOT=$withval],[PYTHON_NUMPY_ROOT=""])
    348346        AC_MSG_CHECKING(for Python-Numpy)
    349347       
    … …  
    360358        AC_MSG_RESULT($HAVE_PYTHON_NUMPY)
    361359        dnl }}}
    362         dnl chaco{{{1
     360        dnl chaco{{{
    363361        AC_ARG_WITH([chaco-dir],
    364                           AS_HELP_STRING([--with-chaco-dir = DIR], [chaco root directory.]),
    365                         [CHACO_ROOT=$withval],[CHACO_ROOT=""])
     362          AS_HELP_STRING([--with-chaco-dir = DIR], [chaco root directory.]),
     363          [CHACO_ROOT=$withval],[CHACO_ROOT=""])
    366364        AC_MSG_CHECKING(for Chaco)
    367365       
    … …  
    382380        AC_MSG_RESULT($HAVE_CHACO)
    383381        dnl }}}
    384         dnl scotch{{{1
     382        dnl scotch{{{
    385383        AC_ARG_WITH([scotch-dir],
    386                           AS_HELP_STRING([--with-scotch-dir = DIR], [scotch root directory.]),
    387                         [SCOTCH_ROOT=$withval],[SCOTCH_ROOT=""])
     384          AS_HELP_STRING([--with-scotch-dir = DIR], [scotch root directory.]),
     385          [SCOTCH_ROOT=$withval],[SCOTCH_ROOT=""])
    388386        AC_MSG_CHECKING(for Scotch)
    389387       
    … …  
    395393                SCOTCHLIB="-L$SCOTCH_ROOT/lib -lnfioscotch -lnfioscotcherr -lnfioscotcherrexit -lscotchmetis"
    396394
    397 
    398395                AC_DEFINE([_HAVE_SCOTCH_],[1],[with Scotch in ISSM src])
    399396                AC_SUBST([SCOTCHINCL])
    … …  
    405402        AC_MSG_RESULT($HAVE_SCOTCH)
    406403        dnl }}}
    407         dnl adolc{{{1
     404        dnl adolc{{{
    408405        AC_ARG_WITH([adolc-dir],
    409                           AS_HELP_STRING([--with-adolc-dir = DIR], [adolc root directory.]),
    410                          [ADOLC_ROOT=$withval],[ADOLC_ROOT="no"])
     406                AS_HELP_STRING([--with-adolc-dir = DIR], [adolc root directory.]),
     407                [ADOLC_ROOT=$withval],[ADOLC_ROOT="no"])
    411408        AC_MSG_CHECKING(for ADOLC)
    412409
    … …  
    433430        AC_MSG_RESULT($HAVE_ADOLC)
    434431        dnl }}}
    435         dnl adic2{{{1
     432        dnl adic2{{{
    436433        AC_ARG_WITH([adic2-dir],
    437                           AS_HELP_STRING([--with-adic2-dir = DIR], [adic2 root directory.]),
    438                         [ADIC2_ROOT=$withval],[ADIC2_ROOT="no"])
     434          AS_HELP_STRING([--with-adic2-dir = DIR], [adic2 root directory.]),
     435          [ADIC2_ROOT=$withval],[ADIC2_ROOT="no"])
    439436        AC_MSG_CHECKING(for ADIC2)
    440437
    … …  
    461458        AC_MSG_RESULT($HAVE_ADIC2)
    462459        dnl }}}
    463         dnl gsl{{{1
     460        dnl gsl{{{
    464461        AC_ARG_WITH([gsl-dir],
    465                           AS_HELP_STRING([--with-gsl-dir = DIR], [gsl root directory.]),
    466                         [GSL_ROOT=$withval],[GSL_ROOT=""])
     462          AS_HELP_STRING([--with-gsl-dir = DIR], [gsl root directory.]),
     463          [GSL_ROOT=$withval],[GSL_ROOT=""])
    467464        AC_MSG_CHECKING(for Gsl)
    468465       
    … …  
    484481        AC_MSG_RESULT($HAVE_GSL)
    485482        dnl }}}
    486         dnl rose{{{1
     483        dnl rose{{{
    487484        AC_ARG_WITH([rose-dir],
    488                           AS_HELP_STRING([--with-rose-dir = DIR], [rose root directory.]),
    489                         [ROSE_ROOT=$withval],[ROSE_ROOT=""])
     485          AS_HELP_STRING([--with-rose-dir = DIR], [rose root directory.]),
     486          [ROSE_ROOT=$withval],[ROSE_ROOT=""])
    490487        AC_MSG_CHECKING(for Rose)
    491488       
    … …  
    507504        AC_MSG_RESULT($HAVE_ROSE)
    508505        dnl }}}
    509         dnl metis{{{1
     506        dnl metis{{{
    510507        AC_ARG_WITH([metis-dir],
    511                           AS_HELP_STRING([--with-metis-dir = DIR],
    512                                                          [metis root directory. necessary for serial build]),
    513                           [METIS_ROOT=$withval],[METIS_ROOT=""])
     508          AS_HELP_STRING([--with-metis-dir = DIR],[metis root directory. necessary for serial build]),
     509          [METIS_ROOT=$withval],[METIS_ROOT=""])
    514510
    515511        if test -d "$METIS_ROOT"; then
    … …  
    526522                dnl defaults
    527523                HAVE_METIS=yes
    528                
    529                                                                  
     524
    530525                if test "$METIS_VERSION" = "4" ; then
    531526                       
    … …  
    563558                fi
    564559
    565 
    566560                AC_DEFINE([_HAVE_METIS_],[1],[with Metis in ISSM src])
    567561                AC_SUBST([METISINCL])
    … …  
    572566
    573567        if test $HAVE_METIS = no; then
    574         AC_MSG_ERROR([--with-metis-dir  missing. Metis is needed to run ISSM]);
    575         else
    576         AC_MSG_RESULT($HAVE_METIS)
    577         fi
    578         dnl }}}
    579         dnl mpi{{{1
     568                AC_MSG_ERROR([--with-metis-dir  missing. Metis is needed to run ISSM]);
     569        else
     570                AC_MSG_RESULT($HAVE_METIS)
     571        fi
     572        dnl }}}
     573        dnl mpi{{{
    580574        AC_MSG_CHECKING(for mpi)
    581575        AC_ARG_WITH([mpi-lib],
    582                           AS_HELP_STRING([--with-mpi-lib = otions],
    583                                                          [mpi options, for ex: "-L$MPIROOT -lmpich]),
    584                           [MPILIB=$withval],[MPILIB=""])
     576                AS_HELP_STRING([--with-mpi-lib = otions],[mpi options, for ex: "-L$MPIROOT -lmpich]),
     577                [MPILIB=$withval],[MPILIB=""])
    585578       
    586579        AC_ARG_WITH([mpi-include],
    587                           AS_HELP_STRING([--with-mpi-include = DIR],
    588                                                          [mpi include directory, necessary for parallel build]),
    589                           [MPI_INCLUDE=$withval],[MPI_INCLUDE=""])
     580          AS_HELP_STRING([--with-mpi-include = DIR],[mpi include directory, necessary for parallel build]),
     581          [MPI_INCLUDE=$withval],[MPI_INCLUDE=""])
    590582       
    591583        if test -z "$MPILIB" ; then
    … …  
    603595        AC_MSG_RESULT(done)
    604596        dnl }}}
    605         dnl petsc{{{1
     597        dnl petsc{{{
    606598        AC_ARG_WITH([petsc-dir],
    607                           AS_HELP_STRING([--with-petsc-dir = DIR],
    608                                                          [petsc root directory, necessary for parallel build]),
    609                           [PETSC_ROOT=$withval],[PETSC_ROOT=""])
     599          AS_HELP_STRING([--with-petsc-dir = DIR],[petsc root directory, necessary for parallel build]),
     600          [PETSC_ROOT=$withval],[PETSC_ROOT=""])
    610601               
    611         dnl Used to be necessary, not anymore.
    612         dnl if test "$PARALLEL_VALUE" = "yes" ; then
    613                 dnl if test "$PETSC_ROOT" = "" ; then
    614                         dnl AC_MSG_ERROR([missing --with-petsc-dir argument for parallel compilation!])
    615                 dnl fi
    616         dnl fi
    617 
    618602        if test -d "$PETSC_ROOT"; then
    619603                AC_MSG_CHECKING(for petsc version)
    … …  
    626610       
    627611        AC_ARG_WITH([petsc-arch],
    628                           AS_HELP_STRING([--with-petsc-arch = DIR],
    629                                                          [petsc arch , necessary for parallel build]),
    630                           [PETSC_ARCH=$withval],[PETSC_ARCH=""])
    631 
    632         dnl Used to be necessary, not anymore.
    633         dnl if test "$PARALLEL_VALUE" = "yes" ; then
    634                 dnl if test "$PETSC_ARCH" = "" ; then
    635                         dnl AC_MSG_ERROR([missing --with-petsc-arch argument for parallel compilation!])
    636                 dnl fi
    637         dnl fi
    638        
     612          AS_HELP_STRING([--with-petsc-arch = DIR],[petsc arch , necessary for parallel build]),
     613          [PETSC_ARCH=$withval],[PETSC_ARCH=""])
     614
    639615        AC_MSG_CHECKING(for Petsc headers and libraries in $PETSC_ROOT for architecture $PETSC_ARCH)
    640        
    641616       
    642617        if test -d "$PETSC_ROOT"; then
    … …  
    676651                HAVE_PETSC=no
    677652        fi
    678 
    679         dnl used to e necessary, not anymore.
    680         dnl if test $HAVE_PETSC = no; then
    681                 dnl AC_MSG_ERROR([could not find petsc. user should specify --with-petsc-dir and --with-petsc-arch options. Petsc is needed to run ISSM!])
    682         dnl else
    683         dnl AC_MSG_RESULT($HAVE_PETSC)
    684         dnl fi
    685653       
    686654        AM_CONDITIONAL([PETSC], [test x$HAVE_PETSC = xyes])
    687655        AC_MSG_RESULT($HAVE_PETSC)
    688656        dnl }}}
    689         dnl tao{{{1
     657        dnl tao{{{
    690658        AC_ARG_WITH([tao-dir],
    691                                 AS_HELP_STRING([--with-tao-dir = DIR], [tao root directory.]),
    692                                 [TAO_ROOT=$withval],[TAO_ROOT=""])
    693           AC_MSG_CHECKING(for Tao)
    694 
    695           if test -d "$TAO_ROOT"; then
    696 
    697                 dnl defaults
    698                   HAVE_TAO=yes
    699                   TAOINCL="-I$TAO_ROOT/ -I$TAO_ROOT/include -I$TAO_ROOT/bmake/ "
    700                   TAOLIB="-L$TAO_ROOT/lib -ltao -lpetsc"
    701 
    702                   AC_DEFINE([_HAVE_TAO_],[1],[with Tao in ISSM src])
    703                   AC_SUBST([TAOINCL])
    704                   AC_SUBST([TAOLIB])
    705 
    706           else
     659                AS_HELP_STRING([--with-tao-dir = DIR], [tao root directory.]),
     660                [TAO_ROOT=$withval],[TAO_ROOT=""])
     661        AC_MSG_CHECKING(for Tao)
     662
     663        if test -d "$TAO_ROOT"; then
     664
     665          HAVE_TAO=yes
     666          TAOINCL="-I$TAO_ROOT/ -I$TAO_ROOT/include -I$TAO_ROOT/bmake/ "
     667          TAOLIB="-L$TAO_ROOT/lib -ltao -lpetsc"
     668
     669          AC_DEFINE([_HAVE_TAO_],[1],[with Tao in ISSM src])
     670          AC_SUBST([TAOINCL])
     671          AC_SUBST([TAOLIB])
     672        else
    707673                HAVE_TAO=no
    708                 fi
    709                 AC_MSG_RESULT($HAVE_TAO)
    710         dnl }}}
    711         dnl mpiuni{{{1
     674        fi
     675        AC_MSG_RESULT($HAVE_TAO)
     676        dnl }}}
     677        dnl mpiuni{{{
    712678        dnl when running in serial mode, MPI must be ignored, and set to internal petsc mpiuni:
    713679        if test "$PARALLEL_VALUE" = "no" ; then
    … …  
    732698        fi
    733699        dnl }}}
    734         dnl slepc{{{1
     700        dnl slepc{{{
    735701        AC_ARG_WITH([slepc-dir],
    736                           AS_HELP_STRING([--with-slepc-dir = DIR],
    737                                                          [slepc root directory]),
    738                           [SLEPC_ROOT=$withval],[SLEPC_ROOT=""])
     702          AS_HELP_STRING([--with-slepc-dir = DIR],[slepc root directory]),
     703          [SLEPC_ROOT=$withval],[SLEPC_ROOT=""])
    739704                         
    740705        AC_MSG_CHECKING(for Slepc headers and libraries in $SLEPC_ROOT)
    741706        if test -d "$SLEPC_ROOT"; then
    742 
    743 
    744                 dnl defaults
    745707                HAVE_SLEPC=yes
    746708                SLEPCINCL=-I"$SLEPC_ROOT/include"
    … …  
    755717        AC_MSG_RESULT($HAVE_SLEPC)
    756718        dnl }}}
    757         dnl shapelib{{{1
     719        dnl shapelib{{{
    758720        AC_ARG_WITH([shapelib-dir],
    759                           AS_HELP_STRING([--with-shapelib-dir = DIR],
    760                                                          [shapelib root directory]),
    761                           [SHAPELIB_ROOT=$withval],[SHAPELIB_ROOT=""])
     721          AS_HELP_STRING([--with-shapelib-dir = DIR], [shapelib root directory]),
     722          [SHAPELIB_ROOT=$withval],[SHAPELIB_ROOT=""])
    762723                         
    763724        AC_MSG_CHECKING(for Shapelib headers and libraries in $SHAPELIB_ROOT)
    764725        if test -d "$SHAPELIB_ROOT"; then
    765726
    766 
    767727                dnl defaults
    768728                HAVE_SHAPELIB=yes
    … …  
    778738        AC_MSG_RESULT($HAVE_SHAPELIB)
    779739        dnl }}}
    780         dnl scalapack{{{1
     740        dnl scalapack{{{
    781741        AC_ARG_WITH([scalapack-dir],
    782                           AS_HELP_STRING([--with-scalapack-dir = DIR],
    783                                                          [scalapack root directory]),
    784                           [SCALAPACK_ROOT=$withval],[SCALAPACK_ROOT=""])
     742          AS_HELP_STRING([--with-scalapack-dir = DIR],[scalapack root directory]),
     743          [SCALAPACK_ROOT=$withval],[SCALAPACK_ROOT=""])
    785744                         
    786745        AC_MSG_CHECKING(for Scalapack headers and libraries in $SCALAPACK_ROOT)
    787746        if test -d "$SCALAPACK_ROOT"; then
    788747
    789 
    790748                dnl defaults
    791749                HAVE_SCALAPACK=yes
    … …  
    799757        AC_MSG_RESULT($HAVE_SCALAPACK)
    800758        dnl }}}
    801         dnl blas{{{1
     759        dnl blas{{{
    802760        AC_ARG_WITH([blas-lapack-dir],
    803                           AS_HELP_STRING([--with-blas-lapack-dir = DIR],
    804                                                          [blas-lapack root directory]),
    805                           [BLASLAPACK_ROOT=$withval],[BLASLAPACK_ROOT=""])
     761          AS_HELP_STRING([--with-blas-lapack-dir = DIR],[blas-lapack root directory]),
     762          [BLASLAPACK_ROOT=$withval],[BLASLAPACK_ROOT=""])
    806763                         
    807764        AC_MSG_CHECKING(for Blas and Lapack headers and libraries in $BLASLAPACK_ROOT)
    808765        if test -d "$BLASLAPACK_ROOT"; then
    809 
    810766
    811767                dnl defaults
    … …  
    825781                        ;;
    826782                esac
    827                                                                  
    828 
    829783
    830784                AC_DEFINE([_HAVE_BLASLAPACK_],[1],[with blas lapack in ISSM src])
    … …  
    836790        AC_MSG_RESULT($HAVE_BLASLAPACK)
    837791        dnl }}}
    838         dnl mkl{{{1
     792        dnl mkl{{{
    839793        AC_ARG_WITH([mkl-dir],
    840                           AS_HELP_STRING([--with-mkl-dir = DIR],
    841                                                          [mkl root directory]),
    842                           [MKL_ROOT=$withval],[MKL_ROOT=""])
     794          AS_HELP_STRING([--with-mkl-dir = DIR],[mkl root directory]),
     795          [MKL_ROOT=$withval],[MKL_ROOT=""])
    843796                         
    844797        AC_MSG_CHECKING(for mkl headers and libraries in $MKL_ROOT)
    … …  
    857810        AC_MSG_RESULT($HAVE_MKL)
    858811        dnl }}}
    859         dnl plapack{{{1
     812        dnl plapack{{{
    860813        AC_ARG_WITH([plapack-lib],
    861                           AS_HELP_STRING([--with-plapack-lib = lib],
    862                                                          [plapack library]),
    863                           [PLAPACK_LIB=$withval],[PLAPACK_LIB=""])
     814          AS_HELP_STRING([--with-plapack-lib = lib],[plapack library]),
     815          [PLAPACK_LIB=$withval],[PLAPACK_LIB=""])
    864816        AC_MSG_CHECKING(for Plapack libraries)
    865817       
    … …  
    889841        AC_MSG_RESULT($HAVE_PLAPACK)
    890842        dnl }}}
    891         dnl mumps{{{1
    892 
    893         dnl Mumps directory
     843        dnl mumps{{{
    894844        AC_ARG_WITH([mumps-dir],
    895                           AS_HELP_STRING([--with-mumps-dir = DIR],
    896                                                          [mumps root directory]),
    897                           [MUMPS_ROOT=$withval],[MUMPS_ROOT=""])
     845          AS_HELP_STRING([--with-mumps-dir = DIR],[mumps root directory]),
     846          [MUMPS_ROOT=$withval],[MUMPS_ROOT=""])
    898847                         
    899848        AC_MSG_CHECKING(for Mumps headers and libraries in $MUMPS_ROOT)
    … …  
    917866        AC_MSG_RESULT($HAVE_MUMPS)
    918867        dnl }}}
    919         dnl blacs{{{1
     868        dnl blacs{{{
    920869        AC_ARG_WITH([blacs-dir],
    921                           AS_HELP_STRING([--with-blacs-dir = DIR],
    922                                                          [blacs root directory]),
     870                AS_HELP_STRING([--with-blacs-dir = DIR],[blacs root directory]),
    923871                          [BLACS_ROOT=$withval],[BLACS_ROOT=""])
    924872                         
    … …  
    939887        AC_MSG_RESULT($HAVE_BLACS)
    940888        dnl }}}
    941         dnl hypre{{{1
     889        dnl hypre{{{
    942890        AC_ARG_WITH([hypre-dir],
    943                           AS_HELP_STRING([--with-hypre-dir = DIR],
    944                                                          [hypre root directory]),
     891          AS_HELP_STRING([--with-hypre-dir = DIR],[hypre root directory]),
    945892                          [HYPRE_ROOT=$withval],[HYPRE_ROOT=""])
    946893                         
    … …  
    961908        AC_MSG_RESULT($HAVE_HYPRE)
    962909        dnl }}}
    963         dnl ml{{{1
     910        dnl ml{{{
    964911        AC_ARG_WITH([ml-dir],
    965                           AS_HELP_STRING([--with-ml-dir = DIR],
    966                                                          [ml root directory]),
     912          AS_HELP_STRING([--with-ml-dir = DIR],[ml root directory]),
    967913                          [ML_ROOT=$withval],[ML_ROOT=""])
    968914                         
    … …  
    983929        AC_MSG_RESULT($HAVE_ML)
    984930        dnl }}}
    985         dnl math{{{1
     931        dnl math{{{
    986932        AC_MSG_CHECKING(for math library)
    987933        AC_ARG_WITH([math-lib],
    988                           AS_HELP_STRING([--with-math-lib = otions],
    989                                                          [math options, for ex: "/usr/lib/libm.a]),
    990                           [MATH_LIB=$withval],[MATH_LIB=""])
     934          AS_HELP_STRING([--with-math-lib = otions],[math options, for ex: "/usr/lib/libm.a]),
     935          [MATH_LIB=$withval],[MATH_LIB=""])
    991936
    992937        dnl check that --with-math-lib may have been provided
    … …  
    1000945        AC_MSG_RESULT(done)
    1001946        dnl }}}
    1002         dnl fortran{{{1
     947        dnl fortran{{{
    1003948        dnl fortran library  option
    1004949        AC_MSG_CHECKING(for fortran library)
    1005950        AC_ARG_WITH([fortran-lib],
    1006                           AS_HELP_STRING([--with-fortran-lib = options],
    1007                                                          [fortran options, for ex: "/usr/lib/gfortran.a]),
    1008                           [FORTRAN_LIB=$withval],[FORTRAN_LIB=""])
     951          AS_HELP_STRING([--with-fortran-lib = options],[fortran options, for ex: "/usr/lib/gfortran.a]),
     952                [FORTRAN_LIB=$withval],[FORTRAN_LIB=""])
    1009953
    1010954        dnl check that --with-fortran-lib may have been provided
    … …  
    1018962        AC_MSG_RESULT(done)
    1019963        dnl }}}
    1020         dnl graphics{{{1
     964        dnl graphics{{{
    1021965        AC_MSG_CHECKING(for graphics library)
    1022966        AC_ARG_WITH([graphics-lib],
    1023                           AS_HELP_STRING([--with-graphics-lib = options],
    1024                                                          [graphics options, for ex: "/usr/X11/lib/libX11.a]),
    1025                           [GRAPHICS_LIB=$withval],[GRAPHICS_LIB=""])
     967          AS_HELP_STRING([--with-graphics-lib = options],[graphics options, for ex: "/usr/X11/lib/libX11.a]),
     968          [GRAPHICS_LIB=$withval],[GRAPHICS_LIB=""])
    1026969
    1027970        dnl check that --with-graphics-lib may have been provided
    … …  
    1035978        AC_MSG_RESULT(done)
    1036979        dnl }}}
    1037         dnl with-steadystate{{{1
    1038         AC_ARG_WITH([steadystate],AS_HELP_STRING([--with-steadystate = YES], [compile with steadystate capabilities (default is yes)]),[STEADYSTATE=$withval],[STEADYSTATE=yes])
     980        dnl with-steadystate{{{
     981        AC_ARG_WITH([steadystate],
     982                AS_HELP_STRING([--with-steadystate = YES],[compile with steadystate capabilities (default is yes)]),
     983                [STEADYSTATE=$withval],[STEADYSTATE=yes])
    1039984        AC_MSG_CHECKING(for steadystate capability compilation)
    1040985
    … …  
    1051996        AC_MSG_RESULT($HAVE_STEADYSTATE)
    1052997        dnl }}}
    1053         dnl with-transient{{{1
    1054         AC_ARG_WITH([transient],AS_HELP_STRING([--with-transient = YES], [compile with transient capabilities (default is yes)]),[TRANSIENT=$withval],[TRANSIENT=yes])
     998        dnl with-transient{{{
     999        AC_ARG_WITH([transient],
     1000                AS_HELP_STRING([--with-transient = YES], [compile with transient capabilities (default is yes)]),
     1001                [TRANSIENT=$withval],[TRANSIENT=yes])
    10551002        AC_MSG_CHECKING(for transient capability compilation)
    10561003
    … …  
    10671014        AC_MSG_RESULT($HAVE_TRANSIENT)
    10681015        dnl }}}
    1069         dnl with-thermal{{{1
    1070         AC_ARG_WITH([thermal],AS_HELP_STRING([--with-thermal = YES], [compile with thermal capabilities (default is yes)]),[THERMAL=$withval],[THERMAL=yes])
     1016        dnl with-thermal{{{
     1017        AC_ARG_WITH([thermal],
     1018                AS_HELP_STRING([--with-thermal = YES], [compile with thermal capabilities (default is yes)]),
     1019                [THERMAL=$withval],[THERMAL=yes])
    10711020        AC_MSG_CHECKING(for thermal capability compilation)
    10721021
    … …  
    10831032        AC_MSG_RESULT($HAVE_THERMAL)
    10841033        dnl }}}
    1085         dnl with-prognostic{{{1
    1086         AC_ARG_WITH([prognostic],AS_HELP_STRING([--with-prognostic = YES], [compile with prognostic capabilities (default is yes)]),[PROGNOSTIC=$withval],[PROGNOSTIC=yes])
     1034        dnl with-prognostic{{{
     1035        AC_ARG_WITH([prognostic],
     1036                AS_HELP_STRING([--with-prognostic = YES], [compile with prognostic capabilities (default is yes)]),
     1037                [PROGNOSTIC=$withval],[PROGNOSTIC=yes])
    10871038        AC_MSG_CHECKING(for prognostic capability compilation)
    10881039
    … …  
    10991050        AC_MSG_RESULT($HAVE_PROGNOSTIC)
    11001051        dnl }}}
    1101         dnl with-control{{{1
    1102         AC_ARG_WITH([control],AS_HELP_STRING([--with-control = YES], [compile with control capabilities (default is yes)]),[CONTROL=$withval],[CONTROL=yes])
     1052        dnl with-control{{{
     1053        AC_ARG_WITH([control],
     1054                AS_HELP_STRING([--with-control = YES], [compile with control capabilities (default is yes)]),
     1055                [CONTROL=$withval],[CONTROL=yes])
    11031056        AC_MSG_CHECKING(for control capability compilation)
    11041057
    … …  
    11151068        AC_MSG_RESULT($HAVE_CONTROL)
    11161069        dnl }}}
    1117         dnl with-hydrology{{{1
    1118         AC_ARG_WITH([hydrology],AS_HELP_STRING([--with-hydrology = YES], [compile with hydrology capabilities (default is yes)]),[HYDROLOGY=$withval],[HYDROLOGY=yes])
     1070        dnl with-hydrology{{{
     1071        AC_ARG_WITH([hydrology],
     1072                AS_HELP_STRING([--with-hydrology = YES], [compile with hydrology capabilities (default is yes)]),
     1073                [HYDROLOGY=$withval],[HYDROLOGY=yes])
    11191074        AC_MSG_CHECKING(for hydrology capability compilation)
    11201075
    … …  
    11311086        AC_MSG_RESULT($HAVE_HYDROLOGY)
    11321087        dnl }}}
    1133         dnl with-diagnostic{{{1
    1134         AC_ARG_WITH([diagnostic],AS_HELP_STRING([--with-diagnostic = YES], [compile with diagnostic capabilities (default is yes)]),[DIAGNOSTIC=$withval],[DIAGNOSTIC=yes])
     1088        dnl with-diagnostic{{{
     1089        AC_ARG_WITH([diagnostic],
     1090                AS_HELP_STRING([--with-diagnostic = YES], [compile with diagnostic capabilities (default is yes)]),
     1091                [DIAGNOSTIC=$withval],[DIAGNOSTIC=yes])
    11351092        AC_MSG_CHECKING(for diagnostic capability compilation)
    11361093
    … …  
    11471104        AC_MSG_RESULT($HAVE_DIAGNOSTIC)
    11481105        dnl }}}
    1149         dnl with-balanced{{{1
    1150         AC_ARG_WITH([balanced],AS_HELP_STRING([--with-balanced = YES], [compile with balanced capabilities (default is yes)]),[BALANCED=$withval],[BALANCED=yes])
     1106        dnl with-balanced{{{
     1107        AC_ARG_WITH([balanced],
     1108                AS_HELP_STRING([--with-balanced = YES], [compile with balanced capabilities (default is yes)]),
     1109                [BALANCED=$withval],[BALANCED=yes])
    11511110        AC_MSG_CHECKING(for balanced capability compilation)
    11521111
    … …  
    11631122        AC_MSG_RESULT($HAVE_BALANCED)
    11641123        dnl }}}
    1165         dnl with-responses{{{1
    1166         AC_ARG_WITH([responses],AS_HELP_STRING([--with-responses = YES], [compile with responses capabilities (default is yes)]),[RESPONSES=$withval],[RESPONSES=yes])
     1124        dnl with-responses{{{
     1125        AC_ARG_WITH([responses],
     1126                AS_HELP_STRING([--with-responses = YES], [compile with responses capabilities (default is yes)]),
     1127                [RESPONSES=$withval],[RESPONSES=yes])
    11671128        AC_MSG_CHECKING(for responses capability compilation)
    11681129
    … …  
    11791140        AC_MSG_RESULT($HAVE_RESPONSES)
    11801141        dnl }}}
    1181         dnl with-slope{{{1
    1182         AC_ARG_WITH([slope],AS_HELP_STRING([--with-slope = YES], [compile with slope capabilities (default is yes)]),[SLOPE=$withval],[SLOPE=yes])
     1142        dnl with-slope{{{
     1143        AC_ARG_WITH([slope],
     1144                AS_HELP_STRING([--with-slope = YES], [compile with slope capabilities (default is yes)]),
     1145                [SLOPE=$withval],[SLOPE=yes])
    11831146        AC_MSG_CHECKING(for slope capability compilation)
    11841147
    … …  
    11951158        AC_MSG_RESULT($HAVE_SLOPE)
    11961159        dnl }}}
    1197         dnl with-groundingline{{{1
    1198         AC_ARG_WITH([groundingline],AS_HELP_STRING([--with-groundingline = YES], [compile with groundingline capabilities (default is yes)]),[GROUNDINGLINE=$withval],[GROUNDINGLINE=yes])
     1160        dnl with-groundingline{{{
     1161        AC_ARG_WITH([groundingline],
     1162                AS_HELP_STRING([--with-groundingline = YES], [compile with groundingline capabilities (default is yes)]),
     1163                [GROUNDINGLINE=$withval],[GROUNDINGLINE=yes])
    11991164        AC_MSG_CHECKING(for groundingline capability compilation)
    12001165
    … …  
    12111176        AC_MSG_RESULT($HAVE_GROUNDINGLINE)
    12121177        dnl }}}
    1213         dnl with-rifts{{{1
    1214         AC_ARG_WITH([rifts],AS_HELP_STRING([--with-rifts = YES], [compile with rifts capabilities (default is yes)]),[RIFTS=$withval],[RIFTS=yes])
     1178        dnl with-rifts{{{
     1179        AC_ARG_WITH([rifts],
     1180                AS_HELP_STRING([--with-rifts = YES], [compile with rifts capabilities (default is yes)]),
     1181                [RIFTS=$withval],[RIFTS=yes])
    12151182        AC_MSG_CHECKING(for rifts capability compilation)
    12161183
    … …  
    12271194        AC_MSG_RESULT($HAVE_RIFTS)
    12281195        dnl }}}
    1229         dnl with-3d{{{1
    1230         AC_ARG_WITH([3d],AS_HELP_STRING([--with-3d = YES], [compile with 3d capabilities (default is yes)]),[THREED=$withval],[THREED=yes])
     1196        dnl with-3d{{{
     1197        AC_ARG_WITH([3d],
     1198                AS_HELP_STRING([--with-3d = YES], [compile with 3d capabilities (default is yes)]),
     1199                [THREED=$withval],[THREED=yes])
    12311200        AC_MSG_CHECKING(for 3d capability compilation)
    12321201
    … …  
    12341203
    12351204                dnl defaults
    1236                 HAVE_THREED=yes
    1237 
    1238                 AC_DEFINE([_HAVE_THREED_],[1],[with 3d capability])
    1239         else
    1240                 HAVE_THREED=no
    1241         fi
    1242         AM_CONDITIONAL([THREED], [test x$HAVE_THREED = xyes])
    1243         AC_MSG_RESULT($HAVE_THREED)
    1244         dnl }}}
    1245         dnl checks{{{1
     1205                HAVE_3D=yes
     1206
     1207                AC_DEFINE([_HAVE_3D_],[1],[with 3d capability])
     1208        else
     1209                HAVE_3D=no
     1210        fi
     1211        AM_CONDITIONAL([THREED], [test x$HAVE_3D = xyes])
     1212        AC_MSG_RESULT($HAVE_3D)
     1213        dnl }}}
     1214        dnl checks{{{
    12461215        AC_MSG_CHECKING(checking consistency between all libraries)
    12471216       
    … …  
    12691238
    12701239        dnl other options
    1271         dnl optimization{{{1
     1240        dnl optimization{{{
    12721241        dnl bypass standard optimization -g -O2 ?
    12731242        AC_ARG_WITH([cxxoptflags],
    1274                           AS_HELP_STRING([--with-cxxoptflags = CXXOPTFLAGS], [optimization using CXX flags, ex: --with-cxxoptflags=-march=opteron -O3]),
    1275                         [CXXOPTFLAGS=$withval],[CXXOPTFLAGS="-g -O2"])
     1243          AS_HELP_STRING([--with-cxxoptflags = CXXOPTFLAGS], [optimization using CXX flags, ex: --with-cxxoptflags=-march=opteron -O3]),
     1244          [CXXOPTFLAGS=$withval],[CXXOPTFLAGS="-g -O2"])
    12761245        AC_MSG_CHECKING(for C++ optimization flags)
    12771246        AC_SUBST([CXXOPTFLAGS])
    … …  
    12791248
    12801249        dnl }}}
    1281         dnl multithreading{{{1
     1250        dnl multithreading{{{
    12821251        AC_ARG_WITH([numthreads],
    1283                           AS_HELP_STRING([--with-numthreads = NUMTHREADS_VALUE],
    1284                                                          [numthreads, default is 1. ]),
    1285                           [NUMTHREADS_VALUE=$withval],[NUMTHREADS_VALUE=1])
     1252          AS_HELP_STRING([--with-numthreads = NUMTHREADS_VALUE],[numthreads, default is 1. ]),
     1253          [NUMTHREADS_VALUE=$withval],[NUMTHREADS_VALUE=1])
    12861254        AC_MSG_CHECKING(for number of threads)
    12871255        dnl defaults
    … …  
    13091277        AC_MSG_RESULT($NUMTHREADS_VALUE)
    13101278        dnl }}}
    1311         dnl 64bit {{{1
     1279        dnl 64bit {{{
    13121280        AC_ARG_WITH([64bit-indices],
    1313                           AS_HELP_STRING([--with-64bit-indices = bool], [use 64 bit integers, default 0, ex: --with-64bit-indices=1]),
    1314                         [USE_64BIT_INDICES=$withval],[USE_64BIT_INDICES=0])
     1281          AS_HELP_STRING([--with-64bit-indices = bool], [use 64 bit integers, default 0, ex: --with-64bit-indices=1]),
     1282          [USE_64BIT_INDICES=$withval],[USE_64BIT_INDICES=0])
    13151283        AC_MSG_CHECKING(for 64 bit indices)
    1316 
    13171284
    13181285        if test "$USE_64BIT_INDICES" == "1"; then
    … …  
    13231290        AC_MSG_RESULT($USE_64BIT_INDICES)
    13241291        dnl }}}
    1325 
    13261292])

  • issm/trunk-jpl/src/c/Container/DataSet.cpp

    r11292 r11874  
    230230                                dataset->AddObject(triavertexinput);}
    231231                                break;
    232                         #ifdef _HAVE_THREED_
     232                        #ifdef _HAVE_3D_
    233233                        case PentaP1InputEnum:{
    234234                                PentaP1Input* pentavertexinput=NULL;
    … …  
    264264                                dataset->AddObject(triavertexelementresult);}
    265265                                break;
    266                          #ifdef _HAVE_THREED_
     266                         #ifdef _HAVE_3D_
    267267                        case PentaP1ElementResultEnum:{
    268268                                PentaP1ElementResult* pentavertexelementresult=NULL;

  • issm/trunk-jpl/src/c/modules/ModelProcessorx/CreateElementsVerticesAndMaterials.cpp

    r11001 r11874  
    4646        /*Fetch data needed: */
    4747        iomodel->FetchData(4,MeshElementsEnum,MeshElementconnectivityEnum,MaterialsRheologyBEnum,MaterialsRheologyNEnum);
    48         #ifdef _HAVE_THREED_
     48        #ifdef _HAVE_3D_
    4949        if(dim==3)iomodel->FetchData(2,MeshUpperelementsEnum,MeshLowerelementsEnum);
    5050        #endif
    … …  
    5757                        /*Create and add tria element to elements dataset: */
    5858                        if(dim==2) elements->AddObject(new Tria(i+1,i,i,iomodel,nummodels));
    59                 #ifdef _HAVE_THREED_
     59                #ifdef _HAVE_3D_
    6060                        else       elements->AddObject(new Penta(i+1,i,i,iomodel,nummodels));
    6161                #endif

  • issm/trunk-jpl/src/c/objects/Loads/Icefront.cpp

    r11679 r11874  
    458458                case MacAyeal2dIceFrontEnum:
    459459                        return CreatePVectorDiagnosticMacAyeal2d();
    460         #ifdef _HAVE_THREED_
     460        #ifdef _HAVE_3D_
    461461                case MacAyeal3dIceFrontEnum:
    462462                        return CreatePVectorDiagnosticMacAyeal3d();
    … …  
    563563/*}}}*/
    564564#endif
    565 #ifdef _HAVE_THREED_
     565#ifdef _HAVE_3D_
    566566/*FUNCTION Icefront::CreatePVectorDiagnosticMacAyeal3d{{{1*/
    567567ElementVector* Icefront::CreatePVectorDiagnosticMacAyeal3d(void){

  • issm/trunk-jpl/src/c/objects/Loads/Icefront.h

    r11679 r11874  
    9393                ElementVector* CreatePVectorDiagnosticMacAyeal2d(void);
    9494                #endif
    95         #ifdef _HAVE_THREED_
     95        #ifdef _HAVE_3D_
    9696                ElementVector* CreatePVectorDiagnosticMacAyeal3d(void);
    9797                ElementVector* CreatePVectorDiagnosticPattyn(void);

  • issm/trunk-jpl/src/c/objects/Materials/Matice.cpp

    r11695 r11874  
    778778
    779779        /*if 3d*/
    780         #ifdef _HAVE_THREED_
     780        #ifdef _HAVE_3D_
    781781        else if(dim==3){
    782782
Note: See TracChangeset for help on using the changeset viewer.