Index: /issm/trunk-jpl/src/c/Container/Options.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/Container/Options.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/Container/Options.cpp (revision 11853) @@ -31,5 +31,5 @@ } /*}}}*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ /*FUNCTION Options::Options(int istart, int nrhs, const mxArray* prhs[]){{{1*/ Options::Options(int istart, int nrhs, const mxArray* prhs[]){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/Container/Options.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/Container/Options.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/Container/Options.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ /*constructors, destructors*/ Options(); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ Options(int istart, int nrhs, const mxArray* prhs[]); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/Container/Results.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/Container/Results.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/Container/Results.cpp (revision 11853) @@ -65,5 +65,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION Results::Write{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void Results::Write(mxArray** pdataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/Container/Results.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/Container/Results.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/Container/Results.h (revision 11853) @@ -26,5 +26,5 @@ /*numerics: {{{1*/ Results* SpawnTriaResults(int* indices); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void Write(mxArray** pdataref); #else Index: /issm/trunk-jpl/src/c/include/types.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/include/types.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/include/types.h (revision 11853) @@ -16,5 +16,5 @@ /*Define abstract type for I/O: */ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include typedef const mxArray* ConstDataHandle; //serially, we are reading data from a matlab array. Index: /issm/trunk-jpl/src/c/io/Matlab/FetchMatlabData.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/io/Matlab/FetchMatlabData.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/io/Matlab/FetchMatlabData.cpp (revision 11853) @@ -12,5 +12,5 @@ #include "../../include/include.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include /*FUNCTION FetchMatlabData(DataSet** pdataset,const mxArray* dataref){{{1*/ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/io/Matlab/OptionParse.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/io/Matlab/OptionParse.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/io/Matlab/OptionParse.cpp (revision 11853) @@ -13,5 +13,5 @@ #include "./matlabio.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include Index: /issm/trunk-jpl/src/c/io/Matlab/WriteMatlabData.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/io/Matlab/WriteMatlabData.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/io/Matlab/WriteMatlabData.cpp (revision 11853) @@ -12,5 +12,5 @@ #include "../../shared/shared.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include Index: /issm/trunk-jpl/src/c/io/Matlab/matlabio.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/io/Matlab/matlabio.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/io/Matlab/matlabio.h (revision 11853) @@ -13,5 +13,5 @@ class Parameters; -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include void WriteMatlabData(mxArray** pdataref,DataSet* dataset); Index: /issm/trunk-jpl/src/c/io/PrintfFunction.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/io/PrintfFunction.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/io/PrintfFunction.cpp (revision 11853) @@ -9,5 +9,5 @@ #include "../include/include.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "mex.h" #endif @@ -53,5 +53,5 @@ /*Ok, if we are running in parallel, get node 0 to print*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ mexPrintf(buffer); #else Index: /issm/trunk-jpl/src/c/io/io.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/io/io.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/io/io.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #include "./Disk/diskio.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "./Matlab/matlabio.h" #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/modules/Dakotax/Dakotax.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/modules/Dakotax/Dakotax.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/modules/Dakotax/Dakotax.cpp (revision 11853) @@ -51,5 +51,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void Dakotax(mxArray* femmodel){ #else Index: /issm/trunk-jpl/src/c/modules/Dakotax/Dakotax.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/modules/Dakotax/Dakotax.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/modules/Dakotax/Dakotax.h (revision 11853) @@ -13,5 +13,5 @@ int DescriptorIndex(char* root, int* pindex,char* descriptor); -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void Dakotax(mxArray* femmodel); void SpawnCoreSerial(double* responses, int numresponses, double* variables, char** variables_descriptors,int numvariables, mxArray* femmodel,int counter); Index: /issm/trunk-jpl/src/c/modules/Dakotax/SpawnCore.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/modules/Dakotax/SpawnCore.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/modules/Dakotax/SpawnCore.cpp (revision 11853) @@ -21,5 +21,5 @@ /*Branch into a serial SpawnCore and a parallel SpawnCore: */ - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ SpawnCoreSerial(responses, numresponses, variables, variables_descriptors,numvariables, (mxArray*)femmodel, counter); #else Index: /issm/trunk-jpl/src/c/modules/Dakotax/SpawnCoreSerial.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/modules/Dakotax/SpawnCoreSerial.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/modules/Dakotax/SpawnCoreSerial.cpp (revision 11853) @@ -18,5 +18,5 @@ #include "../../include/include.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void SpawnCoreSerial(double* responses, int numresponses, double* variables, char** variables_descriptors,int numvariables, mxArray* femmodel, int counter){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/modules/OutputResultsx/OutputResultsx.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/modules/OutputResultsx/OutputResultsx.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/modules/OutputResultsx/OutputResultsx.cpp (revision 11853) @@ -16,5 +16,5 @@ #include "../../objects/objects.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void OutputResultsx(mxArray** pdataref, Elements* elements, Nodes* nodes, Vertices* vertices, Loads* loads, Materials* materials, Parameters* parameters,Results* results){ #else @@ -31,5 +31,5 @@ bool dakota_analysis = false; - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ const char **fnames = NULL; mwSize onebyone[2] = {0,0}; @@ -43,5 +43,5 @@ if(dakota_analysis){ //no need to output anything, Dakota analysis has different outputs - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ *pdataref=mxCreateStructArray( ndim,onebyone,nfields,fnames); #endif @@ -91,5 +91,5 @@ /*Write results to disk (in parallel), or to memory (in serial mode): */ - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ results->Write(pdataref); #else Index: /issm/trunk-jpl/src/c/modules/OutputResultsx/OutputResultsx.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/modules/OutputResultsx/OutputResultsx.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/modules/OutputResultsx/OutputResultsx.h (revision 11853) @@ -14,5 +14,5 @@ #include "../../Container/Container.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include void OutputResultsx(mxArray** pdataref, Elements* elements, Nodes* nodes, Vertices* vertices, Loads* loads, Materials* materials, Parameters* parameters, Results* results); Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgGeom.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgGeom.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgGeom.cpp (revision 11853) @@ -19,5 +19,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION BamgGeom::BamgGeom(mxArray* matlab_struct){{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ BamgGeom::BamgGeom(mxArray* matlab_struct){ @@ -51,5 +51,5 @@ /*Methods*/ /*FUNCTION BamgGeom::SetMatlabStructureFields{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void BamgGeom::SetMatlabStructureFields(mxArray** matlab_struct){ @@ -94,5 +94,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION BamgGeom::SetMatlabStructureField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void BamgGeom::SetMatlabStructureField(mxArray* matlab_struct,const char* fieldname,int fieldrows,int fieldcols,double* fieldpointer){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgGeom.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgGeom.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgGeom.h (revision 11853) @@ -5,5 +5,5 @@ #define _BAMGGEOM_H_ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -30,10 +30,10 @@ BamgGeom(); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ BamgGeom(mxArray* matlab_struct); #endif ~BamgGeom(); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabStructureFields(mxArray** matlab_struct); void SetMatlabStructureField(mxArray* matlab_struct,const char* fieldname,int fieldrows,int fieldcols,double* fieldpointer); Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgMesh.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgMesh.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgMesh.cpp (revision 11853) @@ -32,5 +32,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION BamgMesh::BamgMesh(mxArray* matlab_struct){{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ BamgMesh::BamgMesh(mxArray* matlab_struct){ @@ -91,5 +91,5 @@ /*Methods*/ /*FUNCTION BamgMesh::SetMatlabStructureFields{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void BamgMesh::SetMatlabStructureFields(mxArray** matlab_struct){ @@ -152,5 +152,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION BamgMesh::SetMatlabStructureField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void BamgMesh::SetMatlabStructureField(mxArray* matlab_struct,const char* fieldname,int fieldrows,int fieldcols,double* fieldpointer){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgMesh.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgMesh.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgMesh.h (revision 11853) @@ -5,5 +5,5 @@ #define _BAMGMESH_H_ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -51,10 +51,10 @@ BamgMesh(); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ BamgMesh(mxArray* matlab_struct); #endif ~BamgMesh(); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabStructureFields(mxArray** matlab_struct); void SetMatlabStructureField(mxArray* matlab_struct,const char* fieldname,int fieldrows,int fieldcols,double* fieldpointer); Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgOpts.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgOpts.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgOpts.cpp (revision 11853) @@ -42,5 +42,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION BamgOpts::BamgOpts(mxArray* matlab_struct){{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ BamgOpts::BamgOpts(mxArray* matlab_struct){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgOpts.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgOpts.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Bamg/BamgOpts.h (revision 11853) @@ -6,5 +6,5 @@ #define _BAMGOPTS_H_ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -54,5 +54,5 @@ BamgOpts(); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ BamgOpts(mxArray* matlab_struct); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/BoolExternalResult.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/BoolExternalResult.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/BoolExternalResult.cpp (revision 11853) @@ -186,5 +186,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION BoolExternalResult::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void BoolExternalResult::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/BoolExternalResult.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/BoolExternalResult.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/BoolExternalResult.h (revision 11853) @@ -16,5 +16,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -59,5 +59,5 @@ void WriteData(FILE* fid,bool io_gather); void GetResultName(char**); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleExternalResult.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleExternalResult.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleExternalResult.cpp (revision 11853) @@ -182,5 +182,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION DoubleExternalResult::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void DoubleExternalResult::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleExternalResult.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleExternalResult.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleExternalResult.h (revision 11853) @@ -16,5 +16,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -60,5 +60,5 @@ void WriteData(FILE* fid,bool io_gather); void GetResultName(char**); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleMatExternalResult.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleMatExternalResult.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleMatExternalResult.cpp (revision 11853) @@ -223,5 +223,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION DoubleMatExternalResult::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void DoubleMatExternalResult::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleMatExternalResult.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleMatExternalResult.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleMatExternalResult.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -61,5 +61,5 @@ void WriteData(FILE* fid,bool io_gather); void GetResultName(char**); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleVecExternalResult.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleVecExternalResult.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleVecExternalResult.cpp (revision 11853) @@ -207,5 +207,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION DoubleVecExternalResult::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void DoubleVecExternalResult::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleVecExternalResult.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleVecExternalResult.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/DoubleVecExternalResult.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -60,5 +60,5 @@ void WriteData(FILE* fid,bool io_gather); void GetResultName(char**); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/ExternalResult.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/ExternalResult.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/ExternalResult.h (revision 11853) @@ -16,5 +16,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -33,5 +33,5 @@ virtual void WriteData(FILE* fid,bool io_gather)=0; virtual void GetResultName(char**)=0; - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ virtual void SetMatlabField(mxArray* dataref)=0; #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/IntExternalResult.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/IntExternalResult.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/IntExternalResult.cpp (revision 11853) @@ -186,5 +186,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION IntExternalResult::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void IntExternalResult::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/IntExternalResult.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/IntExternalResult.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/IntExternalResult.h (revision 11853) @@ -16,5 +16,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -58,5 +58,5 @@ void WriteData(FILE* fid,bool io_gather); void GetResultName(char**); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/PetscVecExternalResult.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/PetscVecExternalResult.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/PetscVecExternalResult.cpp (revision 11853) @@ -245,5 +245,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION PetscVecExternalResult::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void PetscVecExternalResult::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/PetscVecExternalResult.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/PetscVecExternalResult.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/PetscVecExternalResult.h (revision 11853) @@ -16,5 +16,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -60,5 +60,5 @@ void WriteData(FILE* fid,bool io_gather); void GetResultName(char**); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/StringExternalResult.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/StringExternalResult.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/StringExternalResult.cpp (revision 11853) @@ -198,5 +198,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION StringExternalResult::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void StringExternalResult::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/StringExternalResult.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/StringExternalResult.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/ExternalResults/StringExternalResult.h (revision 11853) @@ -16,5 +16,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -58,5 +58,5 @@ void WriteData(FILE* fid,bool io_gather); void GetResultName(char**); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Numerics/Matrix.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Numerics/Matrix.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Numerics/Matrix.cpp (revision 11853) @@ -140,5 +140,5 @@ /*}}}*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ /*FUNCTION Matrix::ToMatlabMatrix{{{1*/ mxArray* Matrix::ToMatlabMatrix(void){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Numerics/Matrix.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Numerics/Matrix.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Numerics/Matrix.h (revision 11853) @@ -21,5 +21,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "mex.h" #endif @@ -51,5 +51,5 @@ /*Matrix specific routines {{{1*/ void Echo(void); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ mxArray* ToMatlabMatrix(void); #endif @@ -66,5 +66,5 @@ }; /*API: */ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ Matrix* MatlabMatrixToMatrix(const mxArray* mxmatrix); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Numerics/Vector.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Numerics/Vector.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Numerics/Vector.cpp (revision 11853) @@ -133,5 +133,5 @@ /*}}}*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ /*FUNCTION Vector::ToMatlabVector{{{1*/ mxArray* Vector::ToMatlabVector(void){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Numerics/Vector.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Numerics/Vector.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Numerics/Vector.h (revision 11853) @@ -21,5 +21,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "mex.h" #endif @@ -54,5 +54,5 @@ /*Vector specific routines {{{1*/ void Echo(void); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ mxArray* ToMatlabVector(void); #endif @@ -78,5 +78,5 @@ /*API: */ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ Vector* MatlabVectorToVector(const mxArray* mxvector); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/OptArgs.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/OptArgs.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/OptArgs.h (revision 11853) @@ -6,5 +6,5 @@ #define _OPTARGS_H_ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "mex.h" Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/BoolParam.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/BoolParam.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/BoolParam.cpp (revision 11853) @@ -135,5 +135,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION BoolParam::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void BoolParam::SetMatlabField(mxArray* dataref){ char* name=NULL; Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/BoolParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/BoolParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/BoolParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -81,5 +81,5 @@ void GetParameterName(char**pname); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleMatArrayParam.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleMatArrayParam.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleMatArrayParam.cpp (revision 11853) @@ -309,5 +309,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION StringArrayParam::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void DoubleMatArrayParam::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleMatArrayParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleMatArrayParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleMatArrayParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -84,5 +84,5 @@ void GetParameterName(char**pname); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleMatParam.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleMatParam.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleMatParam.cpp (revision 11853) @@ -191,5 +191,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION DoubleMatParam::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void DoubleMatParam::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleMatParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleMatParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleMatParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -84,5 +84,5 @@ void GetParameterName(char**pname); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleParam.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleParam.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleParam.cpp (revision 11853) @@ -220,5 +220,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION DoubleParam::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void DoubleParam::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -82,5 +82,5 @@ void GetParameterName(char**pname); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleTransientMatParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleTransientMatParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleTransientMatParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleVecParam.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleVecParam.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleVecParam.cpp (revision 11853) @@ -203,5 +203,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION DoubleVecParam::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void DoubleVecParam::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleVecParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleVecParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/DoubleVecParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -82,5 +82,5 @@ void GetParameterName(char**pname); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/FileParam.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/FileParam.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/FileParam.cpp (revision 11853) @@ -102,5 +102,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION FileParam::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void FileParam::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/FileParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/FileParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/FileParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -81,5 +81,5 @@ void GetParameterName(char**pname); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntMatParam.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntMatParam.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntMatParam.cpp (revision 11853) @@ -173,5 +173,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION IntMatParam::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void IntMatParam::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntMatParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntMatParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntMatParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -83,5 +83,5 @@ void GetParameterName(char**pname); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntParam.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntParam.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntParam.cpp (revision 11853) @@ -135,5 +135,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION IntParam::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void IntParam::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -82,5 +82,5 @@ void GetParameterName(char**pname); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntVecParam.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntVecParam.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntVecParam.cpp (revision 11853) @@ -186,5 +186,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION IntVecParam::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void IntVecParam::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntVecParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntVecParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/IntVecParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -83,5 +83,5 @@ void GetParameterName(char**pname); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/MatrixParam.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/MatrixParam.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/MatrixParam.cpp (revision 11853) @@ -191,5 +191,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION MatrixParam::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void MatrixParam::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/MatrixParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/MatrixParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/MatrixParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -82,5 +82,5 @@ void GetParameterName(char**pname); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/Param.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/Param.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/Param.h (revision 11853) @@ -16,5 +16,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -60,5 +60,5 @@ virtual void UnitConversion(int direction_enum)=0; virtual void GetParameterName(char**pname)=0; - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ virtual void SetMatlabField(mxArray* dataref)=0; #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/StringArrayParam.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/StringArrayParam.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/StringArrayParam.cpp (revision 11853) @@ -237,5 +237,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION StringArrayParam::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void StringArrayParam::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/StringArrayParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/StringArrayParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/StringArrayParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -84,5 +84,5 @@ void GetParameterName(char**pname); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/StringParam.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/StringParam.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/StringParam.cpp (revision 11853) @@ -165,5 +165,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION StringParam::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void StringParam::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/StringParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/StringParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/StringParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -82,5 +82,5 @@ void GetParameterName(char**pname); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/VectorParam.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/VectorParam.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/VectorParam.cpp (revision 11853) @@ -189,5 +189,5 @@ /*}}}*/ /*FUNCTION VectorParam::SetMatlabField{{{1*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ void VectorParam::SetMatlabField(mxArray* dataref){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/VectorParam.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/VectorParam.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/objects/Params/VectorParam.h (revision 11853) @@ -15,5 +15,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -82,5 +82,5 @@ void GetParameterName(char**pname); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ void SetMatlabField(mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Alloc/alloc.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Alloc/alloc.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Alloc/alloc.cpp (revision 11853) @@ -125,5 +125,5 @@ if(!size)_error_("attempting to realloc to zero"); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ value = (void*)mxRealloc(pv,size); #else Index: /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Exceptions/Exceptions.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Exceptions/Exceptions.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Exceptions/Exceptions.cpp (revision 11853) @@ -11,5 +11,5 @@ #include "../shared.h" #include "../../include/include.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "mex.h" #endif @@ -45,5 +45,5 @@ } else{ - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ mexErrMsgTxt(exprintf("\n??? Error using ==> %s at %i\n%s error message: %s\n", file_name.c_str(),file_line,function_name.c_str(),what())); Index: /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Matlab/CheckNumMatlabArguments.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Matlab/CheckNumMatlabArguments.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Matlab/CheckNumMatlabArguments.cpp (revision 11853) @@ -3,5 +3,5 @@ */ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "../Exceptions/exceptions.h" Index: /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Matlab/matlabshared.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Matlab/matlabshared.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Matlab/matlabshared.h (revision 11853) @@ -14,5 +14,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "mex.h" mxArray* mxGetAssignedField(const mxArray* pmxa_array,int number, const char* field); Index: /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Matlab/mxGetAssignedField.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Matlab/mxGetAssignedField.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Matlab/mxGetAssignedField.cpp (revision 11853) @@ -9,5 +9,5 @@ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "mex.h" Index: /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Numerics/OptFunc.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Numerics/OptFunc.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Numerics/OptFunc.cpp (revision 11853) @@ -13,5 +13,5 @@ #include "../../include/include.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "mex.h" double OptFunc(double scalar, OptArgs* optargs){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Numerics/Verbosity.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Numerics/Verbosity.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/shared/Numerics/Verbosity.cpp (revision 11853) @@ -18,5 +18,5 @@ #include "../../include/macros.h" #include "../Exceptions/exceptions.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include #endif @@ -39,5 +39,5 @@ if(level<0) _error_("vebosity level should be a positive integer (user provided %i)",level); -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ mxArray* output=NULL; @@ -54,5 +54,5 @@ /*FUNCTION GetVerbosityLevel {{{*/ int GetVerbosityLevel(void){ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ mxArray* output=NULL; Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/double/MatlabMatrixToDoubleMatrix.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/double/MatlabMatrixToDoubleMatrix.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/double/MatlabMatrixToDoubleMatrix.cpp (revision 11853) @@ -11,5 +11,5 @@ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ /*Matlab includes: */ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/double/MatlabVectorToDoubleVector.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/double/MatlabVectorToDoubleVector.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/double/MatlabVectorToDoubleVector.cpp (revision 11853) @@ -11,5 +11,5 @@ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/double/double.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/double/double.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/double/double.h (revision 11853) @@ -6,5 +6,5 @@ #define _DOUBLE_H_ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "mex.h" int MatlabMatrixToDoubleMatrix(double** pmatrix,int* pmatrix_rows,int* pmatrix_cols,const mxArray* mxmatrix); Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/issm/SeqMat.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/issm/SeqMat.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/issm/SeqMat.cpp (revision 11853) @@ -93,5 +93,5 @@ /*}}}*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ /*FUNCTION SeqMat::ToMatlabMatrix{{{1*/ mxArray* SeqMat::ToMatlabMatrix(void){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/issm/SeqMat.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/issm/SeqMat.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/issm/SeqMat.h (revision 11853) @@ -16,5 +16,5 @@ #include "../toolkitsenums.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "mex.h" #endif @@ -40,5 +40,5 @@ /*SeqMat specific routines {{{1*/ void Echo(void); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ mxArray* ToMatlabMatrix(void); #endif @@ -56,5 +56,5 @@ /*API :*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ SeqMat* MatlabMatrixToSeqMat(const mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/issm/SeqVec.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/issm/SeqVec.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/issm/SeqVec.cpp (revision 11853) @@ -66,5 +66,5 @@ /*}}}*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ /*FUNCTION SeqVec::ToMatlabVector{{{1*/ mxArray* SeqVec::ToMatlabVector(void){ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/issm/SeqVec.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/issm/SeqVec.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/issm/SeqVec.h (revision 11853) @@ -16,5 +16,5 @@ #include "../toolkitsenums.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "mex.h" #endif @@ -37,5 +37,5 @@ /*SeqVec specific routines {{{1*/ void Echo(void); - #ifdef _HAVE_MATLAB_ + #ifdef _SERIAL_ mxArray* ToMatlabVector(void); #endif @@ -61,5 +61,5 @@ /*API :*/ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ SeqVec* MatlabVectorToSeqVec(const mxArray* dataref); #endif Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/matlab/MatlabNArrayToNArray.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/matlab/MatlabNArrayToNArray.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/matlab/MatlabNArrayToNArray.cpp (revision 11853) @@ -13,5 +13,5 @@ #include "../../include/include.h" -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/matlab/matlabincludes.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/matlab/matlabincludes.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/matlab/matlabincludes.h (revision 11853) @@ -6,5 +6,5 @@ #define _MATLAB_INCLUDES_H_ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include class Matrix; Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/MatlabMatrixToPetscMatrix.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/MatlabMatrixToPetscMatrix.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/MatlabMatrixToPetscMatrix.cpp (revision 11853) @@ -11,5 +11,5 @@ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ /*Petsc includes: */ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/MatlabVectorToPetscVector.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/MatlabVectorToPetscVector.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/MatlabVectorToPetscVector.cpp (revision 11853) @@ -11,5 +11,5 @@ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ /*Petsc includes: */ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/PetscMatrixToMatlabMatrix.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/PetscMatrixToMatlabMatrix.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/PetscMatrixToMatlabMatrix.cpp (revision 11853) @@ -11,5 +11,5 @@ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ /*Petsc includes: */ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/PetscVectorToMatlabVector.cpp =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/PetscVectorToMatlabVector.cpp (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/PetscVectorToMatlabVector.cpp (revision 11853) @@ -11,5 +11,5 @@ -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ /*Petsc includes: */ Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/petscpatches.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/petscpatches.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/petsc/patches/petscpatches.h (revision 11853) @@ -16,5 +16,5 @@ class Parameters; -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "mex.h" int MatlabMatrixToPetscMatrix(Mat* matrix,int* prows,int* pcols, const mxArray* mxmatrix); Index: /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/toolkits.h =================================================================== --- /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/toolkits.h (revision 11852) +++ /issm/trunk-jpl/src/c/toolkits/toolkits.h (revision 11853) @@ -16,5 +16,5 @@ #endif -#ifdef _HAVE_MATLAB_ +#ifdef _SERIAL_ #include "./matlab/matlabincludes.h" #endif