Index: /issm/trunk/scripts/Update.sh
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--- /issm/trunk/scripts/Update.sh	(revision 10795)
+++ /issm/trunk/scripts/Update.sh	(revision 10796)
@@ -14,4 +14,5 @@
 cat $FILE | sed -e "s/md\.spcvy/md.diagnostic.spcvy/g" > $FILE$$.bak && mv $FILE$$.bak $FILE
 cat $FILE | sed -e "s/md\.spcvz/md.diagnostic.spcvz/g" > $FILE$$.bak && mv $FILE$$.bak $FILE
+cat $FILE | sed -e "s/md\.spctemperature/md.thermal.spctemperature/g" > $FILE$$.bak && mv $FILE$$.bak $FILE
 cat $FILE | sed -e "s/md\.spcthickness/md.balancethickness.spcthickness/g" > $FILE$$.bak && mv $FILE$$.bak $FILE
 cat $FILE | sed -e "s/md\.bamg/md.private.bamg/g" > $FILE$$.bak && mv $FILE$$.bak $FILE
@@ -29,4 +30,5 @@
 cat $FILE | sed -e "s/md\.thickness/md.geometry.thickness/g" > $FILE$$.bak && mv $FILE$$.bak $FILE
 cat $FILE | sed -e "s/md\.bed/md.geometry.bed/g" > $FILE$$.bak && mv $FILE$$.bak $FILE
+cat $FILE | sed -e "s/md\.bathymetry/md.geometry.bathymetry/g" > $FILE$$.bak && mv $FILE$$.bak $FILE
 cat $FILE | sed -e "s/md\.surface_mass_balance/md.surfaceforcings.mass_balance/g" > $FILE$$.bak && mv $FILE$$.bak $FILE
 cat $FILE | sed -e "s/md\.surface/md.geometry.surface/g" > $FILE$$.bak && mv $FILE$$.bak $FILE
@@ -90,2 +92,3 @@
 cat $FILE | sed -e "s/md\.rheology_law/md.materials.rheology_law/g" > $FILE$$.bak && mv $FILE$$.bak $FILE
 cat $FILE | sed -e "s/md\.basal_melting_rate/md.basalforcings.melting_rate/g" > $FILE$$.bak && mv $FILE$$.bak $FILE
+cat $FILE | sed -e "s/md\.geothermalflux/md.basalforcings.geothermalflux/g" > $FILE$$.bak && mv $FILE$$.bak $FILE