| 1 | import numpy as npy
|
|---|
| 2 | from cmaptools import truncate_colormap
|
|---|
| 3 | from plot_contour import plot_contour
|
|---|
| 4 |
|
|---|
| 5 | try:
|
|---|
| 6 | from matplotlib.ticker import MaxNLocator
|
|---|
| 7 | from mpl_toolkits.axes_grid1 import make_axes_locatable
|
|---|
| 8 | import matplotlib as mpl
|
|---|
| 9 | import pylab as p
|
|---|
| 10 | import matplotlib.pyplot as plt
|
|---|
| 11 | except ImportError:
|
|---|
| 12 | print "could not import pylab, matplotlib has not been installed, no plotting capabilities enabled"
|
|---|
| 13 |
|
|---|
| 14 | def applyoptions(md,data,options,fig,ax):
|
|---|
| 15 | '''
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|---|
| 16 | APPLYOPTIONS - apply options to current plot
|
|---|
| 17 |
|
|---|
| 18 | 'plotobj' is the object returned by the specific plot call used to
|
|---|
| 19 | render the data. This object is used for adding a colorbar.
|
|---|
| 20 |
|
|---|
| 21 | Usage:
|
|---|
| 22 | applyoptions(md,data,options)
|
|---|
| 23 |
|
|---|
| 24 | See also: PLOTMODEL, PARSE_OPTIONS
|
|---|
| 25 | '''
|
|---|
| 26 |
|
|---|
| 27 | #some defaults (this seems to be adding a field that already exists...)
|
|---|
| 28 | #if not isnan(md.mesh.hemisphere):
|
|---|
| 29 | # options.addfielddefault('hemisphere',md.mesh.hemisphere)
|
|---|
| 30 |
|
|---|
| 31 | # get handle to current figure and axes instance
|
|---|
| 32 | #fig = p.gcf()
|
|---|
| 33 | #ax=p.gca()
|
|---|
| 34 |
|
|---|
| 35 | #font {{{
|
|---|
| 36 | fontsize=options.getfieldvalue('fontsize',8)
|
|---|
| 37 | fontweight=options.getfieldvalue('fontweight','normal')
|
|---|
| 38 | fontfamily=options.getfieldvalue('fontfamily','sans-serif')
|
|---|
| 39 | font={
|
|---|
| 40 | 'fontsize' :fontsize,
|
|---|
| 41 | 'fontweight' :fontweight,
|
|---|
| 42 | 'family' :fontfamily
|
|---|
| 43 | }
|
|---|
| 44 | #}}}
|
|---|
| 45 |
|
|---|
| 46 | #title {{{
|
|---|
| 47 | if options.exist('title'):
|
|---|
| 48 | title=options.getfieldvalue('title')
|
|---|
| 49 | if options.exist('titlefontsize'):
|
|---|
| 50 | titlefontsize=options.getfieldvalue('titlefontsize')
|
|---|
| 51 | else:
|
|---|
| 52 | titlefontsize=fontsize
|
|---|
| 53 | if options.exist('titlefontweight'):
|
|---|
| 54 | titlefontweight=options.getfieldvalue('titlefontweight')
|
|---|
| 55 | else:
|
|---|
| 56 | titlefontweight=fontweight
|
|---|
| 57 | #title font
|
|---|
| 58 | titlefont=font.copy()
|
|---|
| 59 | titlefont['size']=titlefontsize
|
|---|
| 60 | titlefont['weight']=titlefontweight
|
|---|
| 61 | ax.set_title(title,**titlefont)
|
|---|
| 62 | #}}}
|
|---|
| 63 |
|
|---|
| 64 | #xlabel, ylabel, zlabel {{{
|
|---|
| 65 | if options.exist('labelfontsize'):
|
|---|
| 66 | labelfontsize=options.getfieldvalue('labelfontsize')
|
|---|
| 67 | else:
|
|---|
| 68 | labelfontsize=fontsize
|
|---|
| 69 | if options.exist('labelfontweight'):
|
|---|
| 70 | labelfontweight=options.getfieldvalue('labelfontweight')
|
|---|
| 71 | else:
|
|---|
| 72 | labelfontweight=fontweight
|
|---|
| 73 |
|
|---|
| 74 | #font dict for labels
|
|---|
| 75 | labelfont=font.copy()
|
|---|
| 76 | labelfont['fontsize']=labelfontsize
|
|---|
| 77 | labelfont['fontweight']=labelfontweight
|
|---|
| 78 |
|
|---|
| 79 | if options.exist('xlabel'):
|
|---|
| 80 | ax.set_xlabel(options.getfieldvalue('xlabel'),**labelfont)
|
|---|
| 81 | if options.exist('ylabel'):
|
|---|
| 82 | ax.set_ylabel(options.getfieldvalue('ylabel'),**labelfont)
|
|---|
| 83 | if options.exist('zlabel'):
|
|---|
| 84 | ax.set_zlabel(options.getfieldvalue('zlabel'),**labelfont)
|
|---|
| 85 | #}}}
|
|---|
| 86 |
|
|---|
| 87 | #xticks, yticks, zticks (tick locations) {{{
|
|---|
| 88 | if options.exist('xticks'):
|
|---|
| 89 | if options.exist('xticklabels'):
|
|---|
| 90 | xticklabels=options.getfieldvalue('xticklabels')
|
|---|
| 91 | ax.set_xticks(options.getfieldvalue('xticks'),xticklabels)
|
|---|
| 92 | else:
|
|---|
| 93 | ax.set_xticks(options.getfieldvalue('xticks'))
|
|---|
| 94 | if options.exist('yticks'):
|
|---|
| 95 | if options.exist('yticklabels'):
|
|---|
| 96 | yticklabels=options.getfieldvalue('yticklabels')
|
|---|
| 97 | ax.set_yticks(options.getfieldvalue('yticks'),yticklabels)
|
|---|
| 98 | else:
|
|---|
| 99 | ax.set_yticks(options.getfieldvalue('yticks'))
|
|---|
| 100 | if options.exist('zticks'):
|
|---|
| 101 | if options.exist('zticklabels'):
|
|---|
| 102 | zticklabels=options.getfieldvalue('zticklabels')
|
|---|
| 103 | ax.set_zticks(options.getfieldvalue('zticks'),zticklabels)
|
|---|
| 104 | else:
|
|---|
| 105 | ax.set_zticks(options.getfieldvalue('zticks'))
|
|---|
| 106 | #}}}
|
|---|
| 107 |
|
|---|
| 108 | #xticklabels,yticklabels,zticklabels {{{
|
|---|
| 109 | if options.getfieldvalue('ticklabels','off')=='off' or options.getfieldvalue('ticklabels',0)==0:
|
|---|
| 110 | options.addfielddefault('xticklabels',[])
|
|---|
| 111 | options.addfielddefault('yticklabels',[])
|
|---|
| 112 | # TODO check if ax has a z-axis (e.g. is 3D)
|
|---|
| 113 | if options.exist('xticklabels'):
|
|---|
| 114 | xticklabels=options.getfieldvalue('xticklabels')
|
|---|
| 115 | ax.set_xticklabels(xticklabels)
|
|---|
| 116 | if options.exist('yticklabels'):
|
|---|
| 117 | yticklabels=options.getfieldvalue('yticklabels')
|
|---|
| 118 | ax.set_yticklabels(yticklabels)
|
|---|
| 119 | if options.exist('zticklabels'):
|
|---|
| 120 | zticklabels=options.getfieldvalue('zticklabels')
|
|---|
| 121 | ax.set_zticklabels(zticklabels)
|
|---|
| 122 | #}}}
|
|---|
| 123 |
|
|---|
| 124 | #ticklabel notation {{{
|
|---|
| 125 | #ax.ticklabel_format(style='sci',scilimits=(0,0))
|
|---|
| 126 | #}}}
|
|---|
| 127 |
|
|---|
| 128 | #ticklabelfontsize {{{
|
|---|
| 129 | if options.exist('ticklabelfontsize'):
|
|---|
| 130 | for label in ax.get_xticklabels() + ax.get_yticklabels():
|
|---|
| 131 | label.set_fontsize(options.getfieldvalue('ticklabelfontsize'))
|
|---|
| 132 | if int(md.mesh.dimension)==3:
|
|---|
| 133 | for label in ax.get_zticklabels():
|
|---|
| 134 | label.set_fontsize(options.getfieldvalue('ticklabelfontsize'))
|
|---|
| 135 | #}}}
|
|---|
| 136 |
|
|---|
| 137 | #view
|
|---|
| 138 |
|
|---|
| 139 | #axis {{{
|
|---|
| 140 | if options.exist('axis'):
|
|---|
| 141 | if options.getfieldvalue('axis',True)=='off':
|
|---|
| 142 | ax.ticklabel_format(style='plain')
|
|---|
| 143 | p.setp(ax.get_xticklabels(), visible=False)
|
|---|
| 144 | p.setp(ax.get_yticklabels(), visible=False)
|
|---|
| 145 | # }}}
|
|---|
| 146 |
|
|---|
| 147 | #box
|
|---|
| 148 |
|
|---|
| 149 | #xlim, ylim, zlim {{{
|
|---|
| 150 | if options.exist('xlim'):
|
|---|
| 151 | ax.set_xlim(options.getfieldvalue('xlim'))
|
|---|
| 152 | if options.exist('ylim'):
|
|---|
| 153 | ax.set_ylim(options.getfieldvalue('ylim'))
|
|---|
| 154 | if options.exist('zlim'):
|
|---|
| 155 | ax.set_zlim(options.getfieldvalue('zlim'))
|
|---|
| 156 | #}}}
|
|---|
| 157 |
|
|---|
| 158 | #latlon
|
|---|
| 159 |
|
|---|
| 160 | #Basinzoom
|
|---|
| 161 |
|
|---|
| 162 | #ShowBasins
|
|---|
| 163 |
|
|---|
| 164 | #clim {{{
|
|---|
| 165 | if options.exist('clim'):
|
|---|
| 166 | lims=options.getfieldvalue('clim')
|
|---|
| 167 | assert len(lims)==2, 'error, clim should be passed as a list of length 2'
|
|---|
| 168 | elif options.exist('caxis'):
|
|---|
| 169 | lims=options.getfieldvalue('caxis')
|
|---|
| 170 | assert len(lims)==2, 'error, caxis should be passed as a list of length 2'
|
|---|
| 171 | options.addfielddefault('clim',lims)
|
|---|
| 172 | else:
|
|---|
| 173 | if len(data)>0: lims=[data.min(),data.max()]
|
|---|
| 174 | else: lims=[0,1]
|
|---|
| 175 | #}}}
|
|---|
| 176 |
|
|---|
| 177 | #shading
|
|---|
| 178 |
|
|---|
| 179 | #grid {{{
|
|---|
| 180 | if options.exist('grid'):
|
|---|
| 181 | if 'on' in options.getfieldvalue('grid','on'):
|
|---|
| 182 | ax.grid()
|
|---|
| 183 | #}}}
|
|---|
| 184 |
|
|---|
| 185 | #colormap {{{
|
|---|
| 186 | # default sequential colormap
|
|---|
| 187 | defaultmap=truncate_colormap(mpl.cm.gnuplot2,0.1,0.9,128)
|
|---|
| 188 | cmap=options.getfieldvalue('colormap',defaultmap)
|
|---|
| 189 | norm = mpl.colors.Normalize(vmin=lims[0], vmax=lims[1])
|
|---|
| 190 | options.addfield('colornorm',norm)
|
|---|
| 191 | cbar_extend=0
|
|---|
| 192 | if options.exist('cmap_set_over'):
|
|---|
| 193 | over=options.getfieldvalue('cmap_set_over','0.5')
|
|---|
| 194 | cmap.set_over(over)
|
|---|
| 195 | cbar_extend+=1
|
|---|
| 196 | if options.exist('cmap_set_under'):
|
|---|
| 197 | under=options.getfieldvalue('cmap_set_under','0.5')
|
|---|
| 198 | cmap.set_under(under)
|
|---|
| 199 | cbar_extend+=2
|
|---|
| 200 | options.addfield('colormap',cmap)
|
|---|
| 201 | #}}}
|
|---|
| 202 |
|
|---|
| 203 | #contours {{{
|
|---|
| 204 | if options.exist('contourlevels'):
|
|---|
| 205 | plot_contour(md,data,options,ax)
|
|---|
| 206 | #}}}
|
|---|
| 207 |
|
|---|
| 208 | #wrapping
|
|---|
| 209 |
|
|---|
| 210 | #colorbar {{{
|
|---|
| 211 | if options.getfieldvalue('colorbar',1)==1:
|
|---|
| 212 | if cbar_extend==0:
|
|---|
| 213 | extend='neither'
|
|---|
| 214 | elif cbar_extend==1:
|
|---|
| 215 | extend='max'
|
|---|
| 216 | elif cbar_extend==2:
|
|---|
| 217 | extend='min'
|
|---|
| 218 | elif cbar_extend==3:
|
|---|
| 219 | extend='both'
|
|---|
| 220 | cb = mpl.colorbar.ColorbarBase(ax.cax, cmap=cmap, norm=norm, extend=extend)
|
|---|
| 221 | if options.exist('alpha'):
|
|---|
| 222 | cb.set_alpha(options.getfieldvalue('alpha'))
|
|---|
| 223 | if options.exist('colorbarnumticks'):
|
|---|
| 224 | cb.locator=MaxNLocator(nbins=options.getfieldvalue('colorbarnumticks',5))
|
|---|
| 225 | else:
|
|---|
| 226 | cb.locator=MaxNLocator(nbins=5) # default 5 ticks
|
|---|
| 227 | if options.exist('colorbartickspacing'):
|
|---|
| 228 | locs=npy.arange(lims[0],lims[1]+1,options.getfieldvalue('colorbartickspacing'))
|
|---|
| 229 | cb.set_ticks(locs)
|
|---|
| 230 | if options.exist('colorbarlines'):
|
|---|
| 231 | locs=npy.arange(lims[0],lims[1]+1,options.getfieldvalue('colorbarlines'))
|
|---|
| 232 | cb.add_lines(locs,['k' for i in range(len(locs))],npy.ones_like(locs))
|
|---|
| 233 | if options.exist('colorbartitle'):
|
|---|
| 234 | if options.exist('colorbartitlepad'):
|
|---|
| 235 | cb.set_label(options.getfieldvalue('colorbartitle'),\
|
|---|
| 236 | labelpad=options.getfieldvalue('colorbartitlepad'),fontsize=fontsize)
|
|---|
| 237 | else:
|
|---|
| 238 | cb.set_label(options.getfieldvalue('colorbartitle'),fontsize=fontsize)
|
|---|
| 239 | cb.ax.tick_params(labelsize=fontsize)
|
|---|
| 240 | cb.update_ticks()
|
|---|
| 241 | plt.sca(ax) # return to original axes control
|
|---|
| 242 | #}}}
|
|---|
| 243 |
|
|---|
| 244 | #area
|
|---|
| 245 |
|
|---|
| 246 | #expdisp
|
|---|
| 247 |
|
|---|
| 248 | #text {{{
|
|---|
| 249 | if options.exist('text'):
|
|---|
| 250 | text=options.getfieldvalue('text')
|
|---|
| 251 | textx=options.getfieldvalue('textx')
|
|---|
| 252 | texty=options.getfieldvalue('texty')
|
|---|
| 253 | textsize=options.getfieldvalue('textsize')
|
|---|
| 254 | textcolor=options.getfieldvalue('textcolor')
|
|---|
| 255 | textweight=options.getfieldvalue('textweight')
|
|---|
| 256 | textrotation=options.getfieldvalue('textrotation')
|
|---|
| 257 | for label,x,y,size,color,weight,rotation in zip(text,textx,texty,textsize,textcolor,textweight,textrotation):
|
|---|
| 258 | ax.text(x,y,label,transform=ax.transAxes,fontsize=size,color=color,weight=weight,rotation=rotation)
|
|---|
| 259 | #}}}
|
|---|
| 260 |
|
|---|
| 261 | #north arrow
|
|---|
| 262 |
|
|---|
| 263 | #scale ruler
|
|---|
| 264 |
|
|---|
| 265 | #streamlines
|
|---|
| 266 |
|
|---|
| 267 |
|
|---|
| 268 | #axis positions
|
|---|
| 269 |
|
|---|
| 270 | #figure position
|
|---|
| 271 |
|
|---|
| 272 | #axes position
|
|---|
| 273 |
|
|---|
| 274 | #showregion
|
|---|
| 275 |
|
|---|
| 276 | #flat edges of a partition
|
|---|
| 277 |
|
|---|
| 278 | #scatter
|
|---|
| 279 |
|
|---|
| 280 | #backgroundcolor
|
|---|
| 281 |
|
|---|
| 282 | #figurebackgroundcolor
|
|---|
| 283 |
|
|---|
| 284 | #lighting
|
|---|
| 285 |
|
|---|
| 286 | #point cloud
|
|---|
| 287 |
|
|---|
| 288 | #inset
|
|---|