1 | /*!\file: Vector.h
|
---|
2 | * \brief wrapper to vector objects. The goal is to control which API (PETSc,Scalpack, Plapack?)
|
---|
3 | * implements our underlying vector format.
|
---|
4 | */
|
---|
5 |
|
---|
6 | #ifndef _VECTOR_H_
|
---|
7 | #define _VECTOR_H_
|
---|
8 |
|
---|
9 | /*Headers:*/
|
---|
10 | /*{{{*/
|
---|
11 | #ifdef HAVE_CONFIG_H
|
---|
12 | #include <config.h>
|
---|
13 | #else
|
---|
14 | #error "Cannot compile with HAVE_CONFIG_H symbol! run configure first!"
|
---|
15 | #endif
|
---|
16 | #include <cstring>
|
---|
17 | #include "../../shared/Enum/Enum.h"
|
---|
18 | #include "../petsc/petscincludes.h"
|
---|
19 | #include "../issm/issmtoolkit.h"
|
---|
20 | /*}}}*/
|
---|
21 |
|
---|
22 | enum vectortype { PetscVecType, IssmVecType };
|
---|
23 |
|
---|
24 | template <class doubletype>
|
---|
25 | class Vector{
|
---|
26 |
|
---|
27 | public:
|
---|
28 |
|
---|
29 | int type;
|
---|
30 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
31 | PetscVec* pvector;
|
---|
32 | #endif
|
---|
33 | IssmVec<doubletype>* ivector;
|
---|
34 |
|
---|
35 | /*Vector constructors, destructors */
|
---|
36 | Vector(){ /*{{{*/
|
---|
37 |
|
---|
38 | InitCheckAndSetType();
|
---|
39 | }
|
---|
40 | /*}}}*/
|
---|
41 | Vector(int M,bool fromlocalsize=false){ /*{{{*/
|
---|
42 |
|
---|
43 | InitCheckAndSetType();
|
---|
44 |
|
---|
45 | if(type==PetscVecType){
|
---|
46 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
47 | this->pvector=new PetscVec(M,fromlocalsize);
|
---|
48 | #endif
|
---|
49 | }
|
---|
50 | else this->ivector=new IssmVec<doubletype>(M,fromlocalsize);
|
---|
51 |
|
---|
52 | }
|
---|
53 | /*}}}*/
|
---|
54 | Vector(int m,int M){ /*{{{*/
|
---|
55 |
|
---|
56 | InitCheckAndSetType();
|
---|
57 |
|
---|
58 | if(type==PetscVecType){
|
---|
59 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
60 | this->pvector=new PetscVec(m,M);
|
---|
61 | #endif
|
---|
62 | }
|
---|
63 | else this->ivector=new IssmVec<doubletype>(m,M);
|
---|
64 | }
|
---|
65 | /*}}}*/
|
---|
66 | Vector(doubletype* serial_vec,int M){ /*{{{*/
|
---|
67 |
|
---|
68 | InitCheckAndSetType();
|
---|
69 |
|
---|
70 | if(type==PetscVecType){
|
---|
71 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
72 | this->pvector=new PetscVec(serial_vec,M);
|
---|
73 | #endif
|
---|
74 | }
|
---|
75 | else this->ivector=new IssmVec<doubletype>(serial_vec,M);
|
---|
76 | }
|
---|
77 | /*}}}*/
|
---|
78 | ~Vector(){ /*{{{*/
|
---|
79 |
|
---|
80 | if(type==PetscVecType){
|
---|
81 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
82 | delete this->pvector;
|
---|
83 | #endif
|
---|
84 | }
|
---|
85 | else delete this->ivector;
|
---|
86 | }
|
---|
87 | /*}}}*/
|
---|
88 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
89 | Vector(Vec petsc_vector){ /*{{{*/
|
---|
90 |
|
---|
91 | this->type=PetscVecType;
|
---|
92 | this->ivector=NULL;
|
---|
93 | this->pvector=new PetscVec(petsc_vector);
|
---|
94 |
|
---|
95 | }
|
---|
96 | /*}}}*/
|
---|
97 | #endif
|
---|
98 | void InitCheckAndSetType(void){ /*{{{*/
|
---|
99 |
|
---|
100 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
101 | pvector=NULL;
|
---|
102 | #endif
|
---|
103 | ivector=NULL;
|
---|
104 |
|
---|
105 | /*retrieve toolkittype: */
|
---|
106 | char* toolkittype=ToolkitOptions::GetToolkitType();
|
---|
107 | _assert_(toolkittype);
|
---|
108 |
|
---|
109 | /*set vector type: */
|
---|
110 | if(strcmp(toolkittype,"petsc")==0){
|
---|
111 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
112 | type=PetscVecType;
|
---|
113 | #else
|
---|
114 | _error_("cannot create petsc vector without PETSC compiled!");
|
---|
115 | #endif
|
---|
116 | }
|
---|
117 | else if(strcmp(toolkittype,"issm")==0){
|
---|
118 | /*let this choice stand:*/
|
---|
119 | type=IssmVecType;
|
---|
120 | }
|
---|
121 | else{
|
---|
122 | _error_("unknow toolkit type ");
|
---|
123 | }
|
---|
124 |
|
---|
125 | /*Free ressources: */
|
---|
126 | xDelete<char>(toolkittype);
|
---|
127 | }
|
---|
128 | /*}}}*/
|
---|
129 |
|
---|
130 | /*Vector specific routines*/
|
---|
131 | void Echo(void){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
132 |
|
---|
133 | if(type==PetscVecType){
|
---|
134 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
135 | this->pvector->Echo();
|
---|
136 | #endif
|
---|
137 | }
|
---|
138 | else this->ivector->Echo();
|
---|
139 |
|
---|
140 | }
|
---|
141 | /*}}}*/
|
---|
142 | void Assemble(void){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
143 |
|
---|
144 | if(type==PetscVecType){
|
---|
145 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
146 | this->pvector->Assemble();
|
---|
147 | #endif
|
---|
148 | }
|
---|
149 | else this->ivector->Assemble();
|
---|
150 |
|
---|
151 | }
|
---|
152 | /*}}}*/
|
---|
153 | void SetValues(int ssize, int* list, doubletype* values, InsMode mode){ _assert_(this);/*{{{*/
|
---|
154 | if(type==PetscVecType){
|
---|
155 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
156 | this->pvector->SetValues(ssize,list,values,mode);
|
---|
157 | #endif
|
---|
158 | }
|
---|
159 | else this->ivector->SetValues(ssize,list,values,mode);
|
---|
160 |
|
---|
161 | }
|
---|
162 | /*}}}*/
|
---|
163 | void SetValue(int dof, doubletype value, InsMode mode){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
164 |
|
---|
165 | if(type==PetscVecType){
|
---|
166 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
167 | this->pvector->SetValue(dof,value,mode);
|
---|
168 | #endif
|
---|
169 | }
|
---|
170 | else this->ivector->SetValue(dof,value,mode);
|
---|
171 |
|
---|
172 | }
|
---|
173 | /*}}}*/
|
---|
174 | void GetValue(doubletype* pvalue,int dof){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
175 |
|
---|
176 | if(type==PetscVecType){
|
---|
177 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
178 | this->pvector->GetValue(pvalue,dof);
|
---|
179 | #endif
|
---|
180 | }
|
---|
181 | else this->ivector->GetValue(pvalue,dof);
|
---|
182 |
|
---|
183 | }
|
---|
184 | /*}}}*/
|
---|
185 | void GetSize(int* pM){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
186 |
|
---|
187 | if(type==PetscVecType){
|
---|
188 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
189 | this->pvector->GetSize(pM);
|
---|
190 | #endif
|
---|
191 | }
|
---|
192 | else this->ivector->GetSize(pM);
|
---|
193 |
|
---|
194 | }
|
---|
195 | /*}}}*/
|
---|
196 | bool IsEmpty(void){/*{{{*/
|
---|
197 | int M;
|
---|
198 |
|
---|
199 | _assert_(this);
|
---|
200 | this->GetSize(&M);
|
---|
201 |
|
---|
202 | if(M==0)
|
---|
203 | return true;
|
---|
204 | else
|
---|
205 | return false;
|
---|
206 | }
|
---|
207 | /*}}}*/
|
---|
208 | void GetLocalSize(int* pM){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
209 |
|
---|
210 | if(type==PetscVecType){
|
---|
211 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
212 | this->pvector->GetLocalSize(pM);
|
---|
213 | #endif
|
---|
214 | }
|
---|
215 | else this->ivector->GetLocalSize(pM);
|
---|
216 |
|
---|
217 | }
|
---|
218 | /*}}}*/
|
---|
219 | void GetLocalVector(doubletype** pvector,int** pindices){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
220 |
|
---|
221 | if(type==PetscVecType){
|
---|
222 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
223 | this->pvector->GetLocalVector(pvector,pindices);
|
---|
224 | #endif
|
---|
225 | }
|
---|
226 | else this->ivector->GetLocalVector(pvector,pindices);
|
---|
227 |
|
---|
228 | }
|
---|
229 | /*}}}*/
|
---|
230 | Vector<doubletype>* Duplicate(void){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
231 |
|
---|
232 | Vector<doubletype>* output=NULL;
|
---|
233 |
|
---|
234 | output=new Vector<doubletype>();
|
---|
235 |
|
---|
236 | if(type==PetscVecType){
|
---|
237 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
238 | output->pvector=this->pvector->Duplicate();
|
---|
239 | #endif
|
---|
240 | }
|
---|
241 | else output->ivector=this->ivector->Duplicate();
|
---|
242 |
|
---|
243 | return output;
|
---|
244 | } /*}}}*/
|
---|
245 | void Set(doubletype value){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
246 |
|
---|
247 | if(type==PetscVecType){
|
---|
248 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
249 | this->pvector->Set(value);
|
---|
250 | #endif
|
---|
251 | }
|
---|
252 | else this->ivector->Set(value);
|
---|
253 |
|
---|
254 | }
|
---|
255 | /*}}}*/
|
---|
256 | void AXPY(Vector* X, doubletype a){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
257 |
|
---|
258 | if(type==PetscVecType){
|
---|
259 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
260 | this->pvector->AXPY(X->pvector,a);
|
---|
261 | #endif
|
---|
262 | }
|
---|
263 | else this->ivector->AXPY(X->ivector,a);
|
---|
264 |
|
---|
265 | }
|
---|
266 | /*}}}*/
|
---|
267 | void AYPX(Vector* X, doubletype a){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
268 |
|
---|
269 | if(type==PetscVecType){
|
---|
270 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
271 | this->pvector->AYPX(X->pvector,a);
|
---|
272 | #endif
|
---|
273 | }
|
---|
274 | else this->ivector->AYPX(X->ivector,a);
|
---|
275 | }
|
---|
276 | /*}}}*/
|
---|
277 | doubletype* ToMPISerial(void){/*{{{*/
|
---|
278 |
|
---|
279 | doubletype* vec_serial=NULL;
|
---|
280 |
|
---|
281 | _assert_(this);
|
---|
282 | if(type==PetscVecType){
|
---|
283 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
284 | vec_serial=this->pvector->ToMPISerial();
|
---|
285 | #endif
|
---|
286 | }
|
---|
287 | else vec_serial=this->ivector->ToMPISerial();
|
---|
288 |
|
---|
289 | return vec_serial;
|
---|
290 |
|
---|
291 | }
|
---|
292 | /*}}}*/
|
---|
293 | doubletype* ToMPISerial0(void){/*{{{*/
|
---|
294 |
|
---|
295 | doubletype* vec_serial=NULL;
|
---|
296 |
|
---|
297 | _assert_(this);
|
---|
298 | if(type==PetscVecType){
|
---|
299 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
300 | vec_serial=this->pvector->ToMPISerial0();
|
---|
301 | #endif
|
---|
302 | }
|
---|
303 | else vec_serial=this->ivector->ToMPISerial0();
|
---|
304 |
|
---|
305 | return vec_serial;
|
---|
306 |
|
---|
307 | }
|
---|
308 | /*}}}*/
|
---|
309 | void Shift(doubletype shift){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
310 |
|
---|
311 | if(type==PetscVecType){
|
---|
312 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
313 | this->pvector->Shift(shift);
|
---|
314 | #endif
|
---|
315 | }
|
---|
316 | else this->ivector->Shift(shift);
|
---|
317 | }
|
---|
318 | /*}}}*/
|
---|
319 | void Copy(Vector* to){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
320 |
|
---|
321 | if(type==PetscVecType){
|
---|
322 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
323 | this->pvector->Copy(to->pvector);
|
---|
324 | #endif
|
---|
325 | }
|
---|
326 | else this->ivector->Copy(to->ivector);
|
---|
327 | }
|
---|
328 | /*}}}*/
|
---|
329 | doubletype Max(void){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
330 |
|
---|
331 | doubletype max=0;
|
---|
332 |
|
---|
333 | if(type==PetscVecType){
|
---|
334 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
335 | max=this->pvector->Max();
|
---|
336 | #endif
|
---|
337 | }
|
---|
338 | else _error_("operation not supported yet");
|
---|
339 | return max;
|
---|
340 | }
|
---|
341 | /*}}}*/
|
---|
342 | doubletype Norm(NormMode norm_type){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
343 |
|
---|
344 | doubletype norm=0;
|
---|
345 |
|
---|
346 | if(type==PetscVecType){
|
---|
347 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
348 | norm=this->pvector->Norm(norm_type);
|
---|
349 | #endif
|
---|
350 | }
|
---|
351 | else norm=this->ivector->Norm(norm_type);
|
---|
352 | return norm;
|
---|
353 | }
|
---|
354 | /*}}}*/
|
---|
355 | void Scale(doubletype scale_factor){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
356 |
|
---|
357 | if(type==PetscVecType){
|
---|
358 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
359 | this->pvector->Scale(scale_factor);
|
---|
360 | #endif
|
---|
361 | }
|
---|
362 | else this->ivector->Scale(scale_factor);
|
---|
363 | }
|
---|
364 | /*}}}*/
|
---|
365 | doubletype Dot(Vector* vector){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
366 |
|
---|
367 | doubletype dot;
|
---|
368 |
|
---|
369 | if(type==PetscVecType){
|
---|
370 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
371 | dot=this->pvector->Dot(vector->pvector);
|
---|
372 | #endif
|
---|
373 | }
|
---|
374 | else dot=this->ivector->Dot(vector->ivector);
|
---|
375 | return dot;
|
---|
376 | }
|
---|
377 | /*}}}*/
|
---|
378 | void PointwiseDivide(Vector* x,Vector* y){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
379 |
|
---|
380 | if(type==PetscVecType){
|
---|
381 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
382 | this->pvector->PointwiseDivide(x->pvector,y->pvector);
|
---|
383 | #endif
|
---|
384 | }
|
---|
385 | else this->ivector->PointwiseDivide(x->ivector,y->ivector);
|
---|
386 | }
|
---|
387 | /*}}}*/
|
---|
388 | void PointwiseMult(Vector* x,Vector* y){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
389 |
|
---|
390 | if(type==PetscVecType){
|
---|
391 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
392 | this->pvector->PointwiseMult(x->pvector,y->pvector);
|
---|
393 | #endif
|
---|
394 | }
|
---|
395 | else this->ivector->PointwiseMult(x->ivector,y->ivector);
|
---|
396 | }
|
---|
397 | /*}}}*/
|
---|
398 | void Pow(doubletype scale_factor){_assert_(this);/*{{{*/
|
---|
399 |
|
---|
400 | if(type==PetscVecType){
|
---|
401 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
402 | this->pvector->Pow(scale_factor);
|
---|
403 | #endif
|
---|
404 | }
|
---|
405 | else this->ivector->Pow(scale_factor);
|
---|
406 | }
|
---|
407 | /*}}}*/
|
---|
408 | void Sum(doubletype* pvalue){ /*{{{*/
|
---|
409 | _assert_(this);/*{{{*/
|
---|
410 |
|
---|
411 | if(type==PetscVecType){
|
---|
412 | #ifdef _HAVE_PETSC_
|
---|
413 | this->pvector->Sum(pvalue);
|
---|
414 | #endif
|
---|
415 | }
|
---|
416 | else this->ivector->Sum(pvalue);
|
---|
417 | }
|
---|
418 | /*}}}*/
|
---|
419 | }; /*}}}*/
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