[4050] | 1 | /*!\file PetscVecExternalResult.c
|
---|
| 2 | * \brief: implementation of the PetscVecExternalResult object
|
---|
| 3 | */
|
---|
| 4 |
|
---|
| 5 | /*header files: */
|
---|
| 6 | /*{{{1*/
|
---|
| 7 | #ifdef HAVE_CONFIG_H
|
---|
[9320] | 8 | #include <config.h>
|
---|
[4050] | 9 | #else
|
---|
| 10 | #error "Cannot compile with HAVE_CONFIG_H symbol! run configure first!"
|
---|
| 11 | #endif
|
---|
| 12 |
|
---|
[9320] | 13 | #include <stdio.h>
|
---|
[4050] | 14 | #include <string.h>
|
---|
| 15 | #include "../objects.h"
|
---|
| 16 | #include "../../EnumDefinitions/EnumDefinitions.h"
|
---|
| 17 | #include "../../shared/shared.h"
|
---|
[4236] | 18 | #include "../../Container/Container.h"
|
---|
[4050] | 19 | #include "../../include/include.h"
|
---|
| 20 | /*}}}*/
|
---|
| 21 |
|
---|
[4248] | 22 | /*PetscVecExternalResult constructors and destructor*/
|
---|
[4050] | 23 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::PetscVecExternalResult(){{{1*/
|
---|
| 24 | PetscVecExternalResult::PetscVecExternalResult(){
|
---|
| 25 | return;
|
---|
| 26 | }
|
---|
| 27 | /*}}}*/
|
---|
| 28 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::PetscVecExternalResult(int enum_type,IssmPetscVec value){{{1*/
|
---|
[11695] | 29 | PetscVecExternalResult::PetscVecExternalResult(int in_id, int in_enum_type,Vector* in_value,int in_step, double in_time){
|
---|
[4050] | 30 |
|
---|
| 31 | id=in_id;
|
---|
| 32 | enum_type=in_enum_type;
|
---|
| 33 |
|
---|
| 34 | value=NULL;
|
---|
| 35 |
|
---|
| 36 | if(in_value){
|
---|
[11695] | 37 | value=in_value->Duplicate();
|
---|
| 38 | in_value->Copy(value);
|
---|
[4050] | 39 | }
|
---|
[4195] | 40 | else value=NULL;
|
---|
| 41 |
|
---|
[4050] | 42 | step=in_step;
|
---|
| 43 | time=in_time;
|
---|
| 44 | }
|
---|
| 45 | /*}}}*/
|
---|
| 46 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::~PetscVecExternalResult(){{{1*/
|
---|
| 47 | PetscVecExternalResult::~PetscVecExternalResult(){
|
---|
| 48 | VecFree(&value);
|
---|
| 49 | }
|
---|
| 50 | /*}}}*/
|
---|
| 51 |
|
---|
[4248] | 52 | /*Object virtual functions definitions:*/
|
---|
| 53 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::Echo {{{1*/
|
---|
| 54 | void PetscVecExternalResult::Echo(void){
|
---|
[4050] | 55 |
|
---|
[4248] | 56 | printf("PetscVecExternalResult:\n");
|
---|
[8224] | 57 | printf(" enum: %i (%s)\n",this->enum_type,EnumToStringx(this->enum_type));
|
---|
[4248] | 58 |
|
---|
[4050] | 59 | }
|
---|
| 60 | /*}}}*/
|
---|
| 61 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::DeepEcho{{{1*/
|
---|
| 62 | void PetscVecExternalResult::DeepEcho(void){
|
---|
| 63 |
|
---|
| 64 | int i;
|
---|
| 65 | printf("PetscVecExternalResult:\n");
|
---|
| 66 | printf(" id: %i\n",this->id);
|
---|
[8224] | 67 | printf(" enum: %i (%s)\n",this->enum_type,EnumToStringx(this->enum_type));
|
---|
[4050] | 68 | printf(" step: %i\n",this->step);
|
---|
| 69 | printf(" time: %g\n",this->time);
|
---|
| 70 | VecView(value,PETSC_VIEWER_STDOUT_WORLD);
|
---|
| 71 | }
|
---|
| 72 | /*}}}*/
|
---|
[4248] | 73 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::Id{{{1*/
|
---|
| 74 | int PetscVecExternalResult::Id(void){ return -1; }
|
---|
| 75 | /*}}}*/
|
---|
| 76 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::MyRank{{{1*/
|
---|
| 77 | int PetscVecExternalResult::MyRank(void){
|
---|
| 78 | extern int my_rank;
|
---|
| 79 | return my_rank;
|
---|
| 80 | }
|
---|
| 81 | /*}}}*/
|
---|
[11936] | 82 | #ifdef _SERIAL_
|
---|
[4248] | 83 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::Marshall{{{1*/
|
---|
| 84 | void PetscVecExternalResult::Marshall(char** pmarshalled_dataset){
|
---|
| 85 |
|
---|
| 86 | char* marshalled_dataset=NULL;
|
---|
| 87 | int enum_value=0;
|
---|
| 88 | int M;
|
---|
| 89 | double* serial_value=NULL;
|
---|
| 90 |
|
---|
| 91 | /*recover marshalled_dataset: */
|
---|
| 92 | marshalled_dataset=*pmarshalled_dataset;
|
---|
| 93 |
|
---|
| 94 | /*get enum value of PetscVecExternalResult: */
|
---|
| 95 | enum_value=PetscVecExternalResultEnum;
|
---|
| 96 |
|
---|
| 97 | /*marshall enum: */
|
---|
| 98 | memcpy(marshalled_dataset,&enum_value,sizeof(enum_value));marshalled_dataset+=sizeof(enum_value);
|
---|
| 99 |
|
---|
| 100 | /*marshall PetscVecExternalResult data: */
|
---|
| 101 | memcpy(marshalled_dataset,&id,sizeof(id));marshalled_dataset+=sizeof(id);
|
---|
| 102 | memcpy(marshalled_dataset,&enum_type,sizeof(enum_type));marshalled_dataset+=sizeof(enum_type);
|
---|
| 103 | memcpy(marshalled_dataset,&step,sizeof(step));marshalled_dataset+=sizeof(step);
|
---|
| 104 | memcpy(marshalled_dataset,&time,sizeof(time));marshalled_dataset+=sizeof(time);
|
---|
| 105 |
|
---|
| 106 | if(value){
|
---|
| 107 | VecGetSize(value,&M);
|
---|
| 108 | VecToMPISerial(&serial_value,value);
|
---|
| 109 | memcpy(marshalled_dataset,&M,sizeof(M));marshalled_dataset+=sizeof(M);
|
---|
| 110 | memcpy(marshalled_dataset,serial_value,M*sizeof(double));marshalled_dataset+=(M*sizeof(double));
|
---|
| 111 | }
|
---|
| 112 | else{
|
---|
| 113 | M=0;
|
---|
| 114 | memcpy(marshalled_dataset,&M,sizeof(M));marshalled_dataset+=sizeof(M);
|
---|
| 115 | }
|
---|
| 116 | /*Free ressources:*/
|
---|
| 117 | xfree((void**)&serial_value);
|
---|
| 118 |
|
---|
| 119 | /*return:*/
|
---|
| 120 | *pmarshalled_dataset=marshalled_dataset;
|
---|
| 121 | }
|
---|
| 122 | /*}}}*/
|
---|
| 123 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::MarshallSize{{{1*/
|
---|
| 124 | int PetscVecExternalResult::MarshallSize(){
|
---|
| 125 |
|
---|
| 126 | int M=0;
|
---|
| 127 | if(value)VecGetSize(value,&M);
|
---|
| 128 |
|
---|
| 129 | return sizeof(M)+M*sizeof(double)
|
---|
| 130 | +sizeof(id)
|
---|
| 131 | +sizeof(enum_type)
|
---|
| 132 | +sizeof(step)
|
---|
| 133 | +sizeof(time)
|
---|
| 134 | +sizeof(int); //sizeof(int) for enum value
|
---|
| 135 | }
|
---|
| 136 | /*}}}*/
|
---|
[4050] | 137 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::Demarshall{{{1*/
|
---|
| 138 | void PetscVecExternalResult::Demarshall(char** pmarshalled_dataset){
|
---|
| 139 |
|
---|
| 140 | char* marshalled_dataset=NULL;
|
---|
| 141 | int i;
|
---|
| 142 | int M;
|
---|
| 143 | double* serial_vec=NULL;
|
---|
| 144 | int* idxm=NULL;
|
---|
| 145 |
|
---|
| 146 | /*recover marshalled_dataset: */
|
---|
| 147 | marshalled_dataset=*pmarshalled_dataset;
|
---|
| 148 |
|
---|
| 149 | /*this time, no need to get enum type, the pointer directly points to the beginning of the
|
---|
| 150 | *object data (thanks to DataSet::Demarshall):*/
|
---|
| 151 | memcpy(&id,marshalled_dataset,sizeof(id));marshalled_dataset+=sizeof(id);
|
---|
| 152 | memcpy(&enum_type,marshalled_dataset,sizeof(enum_type));marshalled_dataset+=sizeof(enum_type);
|
---|
| 153 |
|
---|
| 154 | /*data: */
|
---|
| 155 | memcpy(&step,marshalled_dataset,sizeof(step));marshalled_dataset+=sizeof(step);
|
---|
| 156 | memcpy(&time,marshalled_dataset,sizeof(time));marshalled_dataset+=sizeof(time);
|
---|
| 157 |
|
---|
| 158 | memcpy(&M,marshalled_dataset,sizeof(M));marshalled_dataset+=sizeof(M);
|
---|
| 159 | if(M){
|
---|
| 160 | serial_vec=(double*)xmalloc(M*sizeof(double));
|
---|
| 161 | memcpy(serial_vec,marshalled_dataset,M*sizeof(double));marshalled_dataset+=(M*sizeof(double));
|
---|
| 162 |
|
---|
| 163 | value=NewVec(M);
|
---|
| 164 | idxm=(int*)xmalloc(M*sizeof(int));
|
---|
| 165 | for(i=0;i<M;i++)idxm[i]=i;
|
---|
| 166 | VecSetValues(value,M,idxm,serial_vec,INSERT_VALUES);
|
---|
| 167 |
|
---|
| 168 | VecAssemblyBegin(value);
|
---|
| 169 | VecAssemblyEnd(value);
|
---|
| 170 |
|
---|
| 171 |
|
---|
| 172 | }
|
---|
| 173 | else{
|
---|
| 174 | value=NULL;
|
---|
| 175 | }
|
---|
| 176 |
|
---|
| 177 | /*Free ressources:*/
|
---|
| 178 | xfree((void**)&serial_vec);
|
---|
| 179 | xfree((void**)&idxm);
|
---|
| 180 |
|
---|
| 181 | /*return: */
|
---|
| 182 | *pmarshalled_dataset=marshalled_dataset;
|
---|
| 183 | }
|
---|
| 184 | /*}}}*/
|
---|
[9777] | 185 | #endif
|
---|
[9883] | 186 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::ObjectEnum{{{1*/
|
---|
| 187 | int PetscVecExternalResult::ObjectEnum(void){
|
---|
[4050] | 188 |
|
---|
| 189 | return PetscVecExternalResultEnum;
|
---|
| 190 |
|
---|
| 191 | }
|
---|
| 192 | /*}}}*/
|
---|
[4248] | 193 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::copy{{{1*/
|
---|
| 194 | Object* PetscVecExternalResult::copy() {
|
---|
[4050] | 195 |
|
---|
[4248] | 196 | return new PetscVecExternalResult(this->id,this->enum_type,this->value,this->step,this->time);
|
---|
[4050] | 197 |
|
---|
| 198 | }
|
---|
| 199 | /*}}}*/
|
---|
| 200 |
|
---|
[4248] | 201 | /*PetscVecExternalResult management: */
|
---|
[4546] | 202 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::WriteData{{{1*/
|
---|
[6389] | 203 | void PetscVecExternalResult::WriteData(FILE* fid,bool io_gather){
|
---|
[4139] | 204 |
|
---|
| 205 | int length;
|
---|
| 206 | int type;
|
---|
[4143] | 207 | int size;
|
---|
[4139] | 208 | char *name = NULL;
|
---|
| 209 | double *serialvec = NULL;
|
---|
[9761] | 210 | extern int my_rank;
|
---|
[4139] | 211 |
|
---|
| 212 | /*serialize: */
|
---|
| 213 | VecGetSize(this->value,&size);
|
---|
| 214 | VecToMPISerial(&serialvec,this->value);
|
---|
| 215 |
|
---|
| 216 | /*now, exit if we are not on cpu 0: */
|
---|
| 217 | if(my_rank)return;
|
---|
| 218 |
|
---|
| 219 | /*First write enum: */
|
---|
[11202] | 220 | EnumToStringx(&name,this->enum_type);
|
---|
[4139] | 221 | length=(strlen(name)+1)*sizeof(char);
|
---|
| 222 | fwrite(&length,sizeof(int),1,fid);
|
---|
| 223 | fwrite(name,length,1,fid);
|
---|
[11205] | 224 | xfree((void**)&name);
|
---|
[4139] | 225 |
|
---|
| 226 | /*Now write time and step: */
|
---|
| 227 | fwrite(&time,sizeof(double),1,fid);
|
---|
| 228 | fwrite(&step,sizeof(int),1,fid);
|
---|
| 229 |
|
---|
| 230 | /*writing a double, type is 1, size is 1: */
|
---|
| 231 | type=1;
|
---|
| 232 |
|
---|
| 233 | fwrite(&type,sizeof(int),1,fid);
|
---|
| 234 | fwrite(&size,sizeof(int),1,fid);
|
---|
| 235 | fwrite(serialvec,size*sizeof(double),1,fid);
|
---|
| 236 |
|
---|
| 237 | /*Free ressources:*/
|
---|
| 238 | xfree((void**)&serialvec);
|
---|
| 239 | }
|
---|
| 240 | /*}}}1*/
|
---|
[4546] | 241 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::GetResultName{{{1*/
|
---|
[11202] | 242 | void PetscVecExternalResult::GetResultName(char**pname){
|
---|
| 243 | EnumToStringx(pname,this->enum_type);
|
---|
[4166] | 244 | }
|
---|
| 245 | /*}}}*/
|
---|
[4546] | 246 | /*FUNCTION PetscVecExternalResult::GetStep{{{1*/
|
---|
[4182] | 247 | int PetscVecExternalResult::GetStep(void){
|
---|
| 248 |
|
---|
| 249 | return this->step;
|
---|
| 250 | }
|
---|
| 251 | /*}}}*/
|
---|