| 1 | # This holds the errors to be suppressed from valgrind report for ISSM.
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| 2 | # See: http://valgrind.org/docs/manual/manual-core.html#manual-core.suppress
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| 3 | #
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| 4 | # to add errors:
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| 5 | # 1. in m/classes/clusters/generic.m,
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| 6 | # add: --gen-suppressions=all
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| 7 | # 2. in the errlog, copy and paste the suppression log
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| 8 | # in this file.
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| 9 |
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| 10 | #OS specific errors{{{
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| 11 | #http://stackoverflow.com/questions/14474691/wifstream-with-imbue-locale-produces-valgrind-errors (larsen)
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| 12 | {
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|---|
| 13 | <OS1>
|
|---|
| 14 | Memcheck:Addr8
|
|---|
| 15 | fun:wcscmp
|
|---|
| 16 | fun:_ZNSt10moneypunctIwLb1EED1Ev
|
|---|
| 17 | fun:_ZNSt10moneypunctIwLb1EED0Ev
|
|---|
| 18 | }
|
|---|
| 19 | {
|
|---|
| 20 | <OS0>
|
|---|
| 21 | Memcheck:Addr8
|
|---|
| 22 | fun:wcscmp
|
|---|
| 23 | fun:_ZNSt10moneypunctIwLb0EED1Ev
|
|---|
| 24 | fun:_ZNSt10moneypunctIwLb0EED0Ev
|
|---|
| 25 | fun:_ZNSt6locale5_ImplD1Ev
|
|---|
| 26 | fun:_ZNSt6localeD1Ev
|
|---|
| 27 | fun:__cxa_finalize
|
|---|
| 28 | obj:/u/astrid-r1b/morlighe/issmjpl/cron/trunk-jpl/externalpackages/boost/install/lib/libboost_filesystem.so.1.49.0
|
|---|
| 29 | obj:/u/astrid-r1b/morlighe/issmjpl/cron/trunk-jpl/externalpackages/boost/install/lib/libboost_filesystem.so.1.49.0
|
|---|
| 30 | fun:__run_exit_handlers
|
|---|
| 31 | fun:exit
|
|---|
| 32 | fun:(below main)
|
|---|
| 33 | }
|
|---|
| 34 | {
|
|---|
| 35 | <OS2>
|
|---|
| 36 | Memcheck:Leak
|
|---|
| 37 | fun:_Znwm
|
|---|
| 38 | fun:_ZNSs4_Rep9_S_createEmmRKSaIcE
|
|---|
| 39 | fun:_ZNSs12_S_constructIPKcEEPcT_S3_RKSaIcESt20forward_iterator_tag
|
|---|
| 40 | fun:_ZNSsC1EPKcRKSaIcE
|
|---|
| 41 | }
|
|---|
| 42 | {
|
|---|
| 43 | <Libgfortranronne>
|
|---|
| 44 | Memcheck:Cond
|
|---|
| 45 | obj:/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgfortran.so.3.0.0
|
|---|
| 46 | obj:/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgfortran.so.3.0.0
|
|---|
| 47 | obj:/usr/lib/x86_64-linux-gnu/libgfortran.so.3.0.0
|
|---|
| 48 | fun:call_init.part.0
|
|---|
| 49 | fun:call_init
|
|---|
| 50 | fun:_dl_init
|
|---|
| 51 | obj:/lib/x86_64-linux-gnu/ld-2.15.so
|
|---|
| 52 | obj:*
|
|---|
| 53 | obj:*
|
|---|
| 54 | obj:*
|
|---|
| 55 | obj:*
|
|---|
| 56 | obj:*
|
|---|
| 57 | }
|
|---|
| 58 | {
|
|---|
| 59 | <OS3>
|
|---|
| 60 | Memcheck:Cond
|
|---|
| 61 | fun:index
|
|---|
| 62 | fun:expand_dynamic_string_token
|
|---|
| 63 | fun:_dl_map_object
|
|---|
| 64 | fun:map_doit
|
|---|
| 65 | fun:_dl_catch_error
|
|---|
| 66 | fun:do_preload
|
|---|
| 67 | fun:handle_ld_preload
|
|---|
| 68 | fun:dl_main
|
|---|
| 69 | fun:_dl_sysdep_start
|
|---|
| 70 | fun:_dl_start_final
|
|---|
| 71 | fun:_dl_start
|
|---|
| 72 | obj:/lib/x86_64-linux-gnu/ld-2.19.so
|
|---|
| 73 | obj:*
|
|---|
| 74 | obj:*
|
|---|
| 75 | }
|
|---|
| 76 | {
|
|---|
| 77 | <OS4>
|
|---|
| 78 | Memcheck:Cond
|
|---|
| 79 | fun:index
|
|---|
| 80 | fun:expand_dynamic_string_token
|
|---|
| 81 | fun:fillin_rpath
|
|---|
| 82 | fun:_dl_init_paths
|
|---|
| 83 | fun:dl_main
|
|---|
| 84 | fun:_dl_sysdep_start
|
|---|
| 85 | fun:_dl_start_final
|
|---|
| 86 | fun:_dl_start
|
|---|
| 87 | obj:/lib/x86_64-linux-gnu/ld-2.19.so
|
|---|
| 88 | obj:*
|
|---|
| 89 | obj:*
|
|---|
| 90 | obj:*
|
|---|
| 91 | obj:*
|
|---|
| 92 | }
|
|---|
| 93 | #}}}
|
|---|
| 94 | #PETSc {{{
|
|---|
| 95 | {
|
|---|
| 96 | <petsc0>
|
|---|
| 97 | Memcheck:User
|
|---|
| 98 | fun:PMPI_Get_count
|
|---|
| 99 | fun:maybe_complete
|
|---|
| 100 | fun:PMPI_Waitany
|
|---|
| 101 | fun:MatStashScatterGetMesg_Private
|
|---|
| 102 | fun:MatAssemblyEnd_MPIAIJ
|
|---|
| 103 | fun:MatAssemblyEnd
|
|---|
| 104 | }
|
|---|
| 105 | {
|
|---|
| 106 | <petsc1>
|
|---|
| 107 | Memcheck:User
|
|---|
| 108 | fun:PMPI_Get_count
|
|---|
| 109 | fun:maybe_complete
|
|---|
| 110 | fun:PMPI_Waitany
|
|---|
| 111 | fun:VecStashScatterGetMesg_Private
|
|---|
| 112 | fun:VecAssemblyEnd_MPI
|
|---|
| 113 | fun:VecAssemblyEnd
|
|---|
| 114 | fun:_ZN8PetscVec8AssembleEv
|
|---|
| 115 | }
|
|---|
| 116 | {
|
|---|
| 117 | <petsc2>
|
|---|
| 118 | Memcheck:User
|
|---|
| 119 | fun:PMPI_Get_count
|
|---|
| 120 | fun:PMPI_Recv
|
|---|
| 121 | fun:_Z14VecToMPISerialPPdP6_p_Veci
|
|---|
| 122 | fun:_ZN8PetscVec11ToMPISerialEv
|
|---|
| 123 | }
|
|---|
| 124 | {
|
|---|
| 125 | <petsc3>
|
|---|
| 126 | Memcheck:User
|
|---|
| 127 | fun:PMPI_Get_count
|
|---|
| 128 | fun:maybe_complete
|
|---|
| 129 | fun:PMPI_Waitany
|
|---|
| 130 | fun:VecScatterCreate_PtoS
|
|---|
| 131 | fun:VecScatterCreate
|
|---|
| 132 | fun:MatSetUpMultiply_MPIAIJ
|
|---|
| 133 | fun:MatAssemblyEnd_MPIAIJ
|
|---|
| 134 | fun:MatAssemblyEnd
|
|---|
| 135 | }
|
|---|
| 136 | {
|
|---|
| 137 | <mumps0>
|
|---|
| 138 | Memcheck:Leak
|
|---|
| 139 | fun:malloc
|
|---|
| 140 | fun:mumps_397.3148
|
|---|
| 141 | fun:__mumps_static_mapping_MOD_mumps_369
|
|---|
| 142 | fun:dmumps_537_
|
|---|
| 143 | fun:dmumps_26_
|
|---|
| 144 | fun:dmumps_
|
|---|
| 145 | fun:dmumps_f77_
|
|---|
| 146 | fun:dmumps_c
|
|---|
| 147 | fun:MatLUFactorSymbolic_AIJMUMPS
|
|---|
| 148 | fun:MatLUFactorSymbolic
|
|---|
| 149 | fun:PCSetUp_LU
|
|---|
| 150 | fun:PCSetUp
|
|---|
| 151 | }
|
|---|
| 152 | {
|
|---|
| 153 | <mumps1>
|
|---|
| 154 | Memcheck:User
|
|---|
| 155 | fun:PMPI_Get_count
|
|---|
| 156 | fun:PMPI_Recv
|
|---|
| 157 | fun:mpi_recv
|
|---|
| 158 | fun:dmumps_664_
|
|---|
| 159 | }
|
|---|
| 160 | {
|
|---|
| 161 | <mumps2>
|
|---|
| 162 | Memcheck:User
|
|---|
| 163 | fun:PMPI_Get_count
|
|---|
| 164 | fun:maybe_complete
|
|---|
| 165 | fun:PMPI_Waitany
|
|---|
| 166 | fun:mpi_waitany
|
|---|
| 167 | fun:dmumps_664_
|
|---|
| 168 | }
|
|---|
| 169 | {
|
|---|
| 170 | <mumps3>
|
|---|
| 171 | Memcheck:User
|
|---|
| 172 | fun:PMPI_Get_count
|
|---|
| 173 | fun:PMPI_Recv
|
|---|
| 174 | fun:mpi_recv
|
|---|
| 175 | fun:dmumps_282_
|
|---|
| 176 | }
|
|---|
| 177 | {
|
|---|
| 178 | <mumps4>
|
|---|
| 179 | Memcheck:User
|
|---|
| 180 | fun:PMPI_Get_count
|
|---|
| 181 | fun:PMPI_Recv
|
|---|
| 182 | fun:mpi_recv
|
|---|
| 183 | fun:dmumps_255_
|
|---|
| 184 | }
|
|---|
| 185 | {
|
|---|
| 186 | <mumps5>
|
|---|
| 187 | Memcheck:User
|
|---|
| 188 | fun:PMPI_Get_count
|
|---|
| 189 | fun:maybe_complete
|
|---|
| 190 | fun:PMPI_Wait
|
|---|
| 191 | fun:PMPI_WAIT
|
|---|
| 192 | fun:dmumps_255_
|
|---|
| 193 | }
|
|---|
| 194 | {
|
|---|
| 195 | <mump6>
|
|---|
| 196 | Memcheck:User
|
|---|
| 197 | fun:PMPI_Get_count
|
|---|
| 198 | fun:PMPI_Recv
|
|---|
| 199 | fun:mpi_recv
|
|---|
| 200 | fun:dmumps_638_
|
|---|
| 201 | }
|
|---|
| 202 | {
|
|---|
| 203 | <mumps7>
|
|---|
| 204 | Memcheck:User
|
|---|
| 205 | fun:PMPI_Get_count
|
|---|
| 206 | fun:PMPI_Recv
|
|---|
| 207 | fun:mpi_recv
|
|---|
| 208 | fun:dmumps_640.3488
|
|---|
| 209 | }
|
|---|
| 210 | {
|
|---|
| 211 | <mumps8>
|
|---|
| 212 | Memcheck:User
|
|---|
| 213 | fun:PMPI_Get_count
|
|---|
| 214 | fun:MPI_GET_COUNT
|
|---|
| 215 | fun:dmumps_638_
|
|---|
| 216 | }
|
|---|
| 217 | {
|
|---|
| 218 | <mumps9>
|
|---|
| 219 | Memcheck:User
|
|---|
| 220 | fun:check_mem_is_defined_untyped
|
|---|
| 221 | fun:PMPI_Pack
|
|---|
| 222 | fun:PMPI_PACK
|
|---|
| 223 | fun:__dmumps_comm_buffer_MOD_dmumps_62
|
|---|
| 224 | }
|
|---|
| 225 | {
|
|---|
| 226 | <mumps10>
|
|---|
| 227 | Memcheck:User
|
|---|
| 228 | fun:check_mem_is_defined_untyped
|
|---|
| 229 | fun:PMPI_Pack
|
|---|
| 230 | fun:PMPI_PACK
|
|---|
| 231 | fun:__dmumps_comm_buffer_MOD_dmumps_62
|
|---|
| 232 | }
|
|---|
| 233 | {
|
|---|
| 234 | <mumps11>
|
|---|
| 235 | Memcheck:User
|
|---|
| 236 | fun:check_mem_is_defined_untyped
|
|---|
| 237 | fun:PMPI_Isend
|
|---|
| 238 | fun:libparmetis__gkMPI_Isend
|
|---|
| 239 | fun:libparmetis__CommInterfaceData
|
|---|
| 240 | fun:libparmetis__CompactGraph
|
|---|
| 241 | fun:libparmetis__MultilevelOrder
|
|---|
| 242 | fun:ParMETIS_V32_NodeND
|
|---|
| 243 | fun:ParMETIS_V3_NodeND
|
|---|
| 244 | fun:mumps_parmetis_
|
|---|
| 245 | }
|
|---|
| 246 | {
|
|---|
| 247 | <mumps12>
|
|---|
| 248 | Memcheck:User
|
|---|
| 249 | fun:check_mem_is_defined_untyped
|
|---|
| 250 | fun:PMPI_Bcast
|
|---|
| 251 | fun:MPI_BCAST
|
|---|
| 252 | fun:__dmumps_parallel_analysis_MOD_dmumps_718
|
|---|
| 253 | fun:__dmumps_parallel_analysis_MOD_dmumps_717
|
|---|
| 254 | fun:__dmumps_parallel_analysis_MOD_dmumps_715
|
|---|
| 255 | }
|
|---|
| 256 | {
|
|---|
| 257 | <mumps13>
|
|---|
| 258 | Memcheck:Leak
|
|---|
| 259 | fun:malloc
|
|---|
| 260 | fun:__dmumps_parallel_analysis_MOD_dmumps_775
|
|---|
| 261 | fun:__dmumps_parallel_analysis_MOD_dmumps_720
|
|---|
| 262 | fun:__dmumps_parallel_analysis_MOD_dmumps_715
|
|---|
| 263 | }
|
|---|
| 264 | {
|
|---|
| 265 | <mump14>
|
|---|
| 266 | Memcheck:Leak
|
|---|
| 267 | fun:malloc
|
|---|
| 268 | fun:mumps_754_
|
|---|
| 269 | fun:__dmumps_parallel_analysis_MOD_dmumps_781
|
|---|
| 270 | fun:__dmumps_parallel_analysis_MOD_dmumps_720
|
|---|
| 271 | fun:__dmumps_parallel_analysis_MOD_dmumps_715
|
|---|
| 272 | fun:dmumps_26_
|
|---|
| 273 | fun:dmumps_
|
|---|
| 274 | fun:dmumps_f77_
|
|---|
| 275 | fun:dmumps_c
|
|---|
| 276 | fun:MatLUFactorSymbolic_AIJMUMPS
|
|---|
| 277 | fun:MatLUFactorSymbolic
|
|---|
| 278 | fun:PCSetUp_LU
|
|---|
| 279 | }
|
|---|
| 280 | {
|
|---|
| 281 | <mumps15>
|
|---|
| 282 | Memcheck:Cond
|
|---|
| 283 | fun:MPIC_Waitall
|
|---|
| 284 | fun:MPIR_Alltoall_intra
|
|---|
| 285 | fun:MPIR_Alltoall
|
|---|
| 286 | fun:MPIR_Alltoall_impl
|
|---|
| 287 | fun:PMPI_Alltoall
|
|---|
| 288 | fun:PMPI_ALLTOALL
|
|---|
| 289 | fun:dmumps_numvolsndrcv_
|
|---|
| 290 | fun:dmumps_simscaleabsuns_
|
|---|
| 291 | fun:dmumps_simscaleabs_
|
|---|
| 292 | fun:dmumps_fac_driver_
|
|---|
| 293 | fun:dmumps_
|
|---|
| 294 | fun:dmumps_f77_
|
|---|
| 295 | }
|
|---|
| 296 | {
|
|---|
| 297 | <mumps16>
|
|---|
| 298 | Memcheck:Cond
|
|---|
| 299 | fun:MPIC_Waitall
|
|---|
| 300 | fun:MPIR_Alltoall_intra
|
|---|
| 301 | fun:MPIR_Alltoall
|
|---|
| 302 | fun:MPIR_Alltoall_impl
|
|---|
| 303 | fun:PMPI_Alltoall
|
|---|
| 304 | fun:PMPI_ALLTOALL
|
|---|
| 305 | fun:__dmumps_parallel_analysis_MOD_dmumps_build_dist_graph
|
|---|
| 306 | fun:__dmumps_parallel_analysis_MOD_dmumps_parmetis_ord
|
|---|
| 307 | fun:__dmumps_parallel_analysis_MOD_dmumps_do_par_ord
|
|---|
| 308 | fun:__dmumps_parallel_analysis_MOD_dmumps_ana_f_par
|
|---|
| 309 | fun:dmumps_ana_driver_
|
|---|
| 310 | fun:dmumps_
|
|---|
| 311 | }
|
|---|
| 312 | {
|
|---|
| 313 | <iparmetis1>
|
|---|
| 314 | Memcheck:Cond
|
|---|
| 315 | fun:MPIC_Waitall
|
|---|
| 316 | fun:MPIR_Scatterv
|
|---|
| 317 | fun:MPIR_Scatterv_impl
|
|---|
| 318 | fun:PMPI_Scatterv
|
|---|
| 319 | fun:libparmetis__gkMPI_Scatterv
|
|---|
| 320 | fun:libparmetis__InitMultisection
|
|---|
| 321 | fun:libparmetis__Order_Partition
|
|---|
| 322 | fun:libparmetis__Order_Partition_Multiple
|
|---|
| 323 | fun:libparmetis__MultilevelOrder
|
|---|
| 324 | fun:ParMETIS_V32_NodeND
|
|---|
| 325 | fun:ParMETIS_V3_NodeND
|
|---|
| 326 | fun:mumps_parmetis_
|
|---|
| 327 | }
|
|---|
| 328 | #}}}
|
|---|
![(please configure the [header_logo] section in trac.ini)](/trac/issm/chrome/common/trac_banner.png)
